ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 14

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016171	CTT	4	666	677	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016171	T	18	2472	2489	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016171	AT	6	2651	2661	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016171	A	12	3529	3540	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016171	ATA	5	4020	4033	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016171	GTA	4	5192	5202	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016171	TCT	7	5799	5819	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016171	TAT	4	5972	5984	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016171	TTTC	3	5998	6010	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016171	TTA	4	6859	6869	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016171	AG	6	7771	7781	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016171	TTCATA	3	7967	7984	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
13	NC_016171	CTT	4	9072	9083	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016171	CGCA	3	9163	9175	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016171	ATA	4	9255	9266	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016171	TAT	5	9504	9517	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016171	CT	6	10821	10832	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016171	CTT	4	12294	12304	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016171	TAT	4	15010	15021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016171	TGA	4	15101	15112	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016171	TAT	4	15148	15158	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016171	TA	6	16449	16459	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016171	CTTG	3	17211	17222	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016171	A	13	19167	19179	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016171	ATT	4	20438	20449	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016171	AAAG	3	21345	21355	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016171	CTT	4	21927	21938	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016171	CTTT	3	22220	22231	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016171	CCTT	3	22925	22936	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016171	TGGA	3	23847	23857	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016171	TTA	4	24151	24162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016171	CTTT	3	24219	24230	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016171	AT	6	24305	24315	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016171	AT	6	25244	25254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016171	A	12	26106	26117	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016171	TCTT	3	28432	28443	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016171	TCT	4	29441	29452	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016171	AAT	4	30049	30059	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016171	ATCT	3	30901	30913	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016171	TAT	5	30913	30927	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016171	A	15	31951	31965	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016171	AAAAG	3	34417	34431	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016171	TTA	4	34534	34546	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016171	TA	7	34665	34677	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016171	CTC	4	34936	34947	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016171	A	29	35341	35369	29	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016171	TTGC	3	35449	35459	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016171	TAAG	3	35848	35859	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016171	AAG	4	36485	36495	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016171	ACTA	3	36912	36923	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016171	TTC	4	38698	38708	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016171	AGA	4	39109	39121	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016171	ATGAT	3	39412	39426	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016171	AGGA	3	40670	40681	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016171	GAA	4	40876	40887	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016171	GTC	4	42083	42093	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016171	TCAA	3	42367	42378	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016171	AGA	4	42950	42961	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016171	ATTC	3	43196	43206	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016171	AAAG	3	45225	45236	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016171	T	12	47254	47265	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016171	TAG	4	48317	48328	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016171	TA	9	48576	48593	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016171	T	18	48592	48609	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016171	CTT	4	49097	49107	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016171	A	13	51640	51652	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016171	AAAG	4	52004	52018	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016171	CTT	4	52490	52502	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016171	TTAC	3	53672	53683	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016171	CT	6	54460	54471	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016171	TTA	4	55160	55171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016171	CTTA	3	55360	55370	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016171	T	17	55924	55940	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_016171	G	13	57473	57485	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016171	TAA	4	57615	57626	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016171	CTTG	3	58808	58819	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016171	CTT	4	60637	60648	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016171	T	12	61901	61912	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016171	TTCC	3	63374	63385	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016171	AGAA	3	64035	64045	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016171	TAT	4	67094	67104	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016171	GCTT	3	67158	67168	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016171	GCT	4	67588	67598	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016171	CCT	4	67838	67850	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016171	TA	7	67961	67973	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016171	AG	7	68503	68516	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016171	TA	6	68644	68655	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016171	TTCTCT	4	69356	69379	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016171	TCTTA	3	69483	69497	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016171	TTTTTC	4	69589	69611	23	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016171	TTAG	3	70885	70896	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016171	AG	6	71218	71228	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016171	GTT	4	71678	71689	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016171	TGTA	3	72099	72110	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016171	CTT	4	72338	72348	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016171	AG	7	73348	73360	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016171	TCAGAC	3	73969	73986	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016171	TGA	5	74058	74072	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016171	T	17	74098	74114	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_016171	TA	6	74461	74471	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016171	ATTTA	3	74588	74603	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016171	ACAA	3	76129	76140	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016171	CGTT	3	76346	76357	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016171	CAG	4	76934	76944	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016171	TC	6	78227	78238	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016171	AAAG	3	79096	79107	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016171	TTC	4	79345	79357	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016171	ATT	5	79810	79824	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016171	AG	7	80264	80277	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016171	CATT	3	80436	80447	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016171	TATG	3	80731	80743	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016171	TCC	4	81208	81219	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016171	CTTT	3	82725	82735	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016171	AAAG	3	82903	82913	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016171	AGT	4	82917	82927	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016171	TTTC	3	83059	83070	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016171	TTAA	3	85795	85806	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016171	ATGC	3	85820	85832	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016171	AATC	3	88264	88274	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016171	AAGA	3	91122	91133	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016171	TTTA	3	91840	91850	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016171	CTTC	3	93960	93971	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016171	TTA	4	94192	94202	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016171	CA	6	94411	94421	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016171	GTCTT	3	94531	94545	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016171	AGC	4	95181	95193	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016171	TTAT	3	95287	95298	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016171	TTTA	3	95432	95443	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016171	AAAGA	3	95635	95648	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016171	TAGA	3	96289	96299	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016171	GTAA	3	96313	96324	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016171	G	12	96901	96912	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016171	AGAAA	4	97589	97608	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
134	NC_016171	TAG	5	98575	98588	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016171	GTTG	3	98665	98675	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016171	A	16	99225	99240	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016171	GAAA	3	99664	99674	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016171	CT	6	100226	100236	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016171	CTAA	3	100787	100797	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016171	AGA	4	100922	100933	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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179	NC_016171	ATA	4	125197	125207	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
180	NC_016171	TTAA	3	126608	126619	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
181	NC_016171	GAGAG	3	127073	127088	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
182	NC_016171	AGAA	3	127712	127723	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
183	NC_016171	A	14	127790	127803	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 14