ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chironomus tepperi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016167	AATT	3	505	517	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35701777
2	NC_016167	TAA	4	531	542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701777
3	NC_016167	A	13	1172	1184	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35701777
4	NC_016167	ATA	4	4076	4093	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35701777
5	NC_016167	GAAA	3	5766	5776	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35701777
6	NC_016167	TTTTAT	4	5968	5991	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	35701777
7	NC_016167	TAA	4	6528	6539	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701777
8	NC_016167	ATAG	3	6727	6737	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	35701777
9	NC_016167	TAA	4	7497	7508	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701777
10	NC_016167	AAG	4	7637	7648	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35701777
11	NC_016167	ATT	5	7936	7950	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35701777
12	NC_016167	TAAA	3	8459	8470	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701777
13	NC_016167	TAA	4	8945	8956	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701777
14	NC_016167	TAATA	3	9363	9376	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35701777
15	NC_016167	TAAA	6	9800	9823	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701777
16	NC_016167	AAAT	3	9920	9931	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35701777
17	NC_016167	TCTTTT	3	10130	10147	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	35701778
18	NC_016167	TA	6	10288	10298	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35701778
19	NC_016167	ATTTT	5	10366	10389	24	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	35701778
20	NC_016167	AAAT	3	10461	10471	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701778
21	NC_016167	ATTA	4	10540	10555	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35701778
22	NC_016167	TAA	4	11331	11342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701778
23	NC_016167	TTAA	3	11873	11883	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35701778
24	NC_016167	AAAAAT	3	12262	12279	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	35701778
25	NC_016167	A	15	12479	12493	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	35701778
26	NC_016167	AAAT	3	12580	12590	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701778
27	NC_016167	TTA	4	13321	13332	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016167	TTAT	3	13419	13429	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016167	TAAA	3	13727	13737	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016167	TTTTA	4	14895	14914	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_016167	ATTAA	3	15009	15022	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016167	AATTTT	3	15055	15071	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_016167	AATT	3	15081	15091	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016167	AAATT	4	15112	15131	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_016167	ATTTTT	3	15343	15360	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016167	T	14	15350	15363	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016167	TTTAT	3	15419	15432	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016167	TA	11	15545	15565	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016167	TA	9	15568	15585	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016167	AATTT	4	15588	15606	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_016167	ATTTT	3	15627	15640	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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