ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida deformans mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016130	TAA	4	50	62	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016130	TTA	4	163	173	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016130	ATA	4	796	807	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016130	ATA	4	1359	1371	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016130	AATT	3	1616	1627	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016130	AT	6	1991	2004	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016130	ATA	4	2225	2236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016130	TTAA	3	2687	2697	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016130	AT	6	2844	2854	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016130	A	15	3013	3027	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016130	TAA	5	3387	3401	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016130	TAT	5	3402	3416	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016130	TA	8	3622	3637	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016130	AT	10	3739	3757	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_016130	TA	6	4042	4052	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016130	AT	8	4593	4607	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016130	AAAT	3	4650	4660	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016130	TAA	4	4661	4672	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016130	ATTA	5	4745	4764	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_016130	ATTAT	3	4819	4833	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_016130	AAAAT	3	5272	5286	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016130	TA	6	5500	5510	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743309
23	NC_016130	TAT	4	5833	5844	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743309
24	NC_016130	TTAAT	3	6084	6098	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016130	ATA	4	6347	6357	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
26	NC_016130	TA	6	6360	6371	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743310
27	NC_016130	AT	7	6409	6423	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35743310
28	NC_016130	AT	9	6452	6469	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35743310
29	NC_016130	TTAG	3	7228	7238	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35743310
30	NC_016130	ATA	4	7474	7485	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
31	NC_016130	GTTC	3	7488	7499	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	35743310
32	NC_016130	ATT	4	7566	7577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743310
33	NC_016130	TTC	4	7687	7698	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743310
34	NC_016130	TAATA	16	8024	8104	81	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	35743310
35	NC_016130	TTA	4	8231	8241	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016130	TAA	4	8371	8382	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016130	TA	6	8555	8565	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016130	CAAA	3	9003	9014	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016130	TAA	4	9362	9372	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016130	ATATT	3	9989	10002	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016130	TAT	4	10344	10355	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016130	TA	6	10509	10520	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016130	ACAAAT	3	10609	10626	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016130	TAAAAA	3	10647	10664	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_016130	AAAAT	3	10819	10833	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	35743310
46	NC_016130	ATA	6	10837	10854	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743310
47	NC_016130	ATA	4	10924	10934	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
48	NC_016130	TAA	5	11114	11128	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743310
49	NC_016130	ATA	4	11224	11234	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
50	NC_016130	TAAA	4	11410	11426	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	35743310
51	NC_016130	A	15	11514	11528	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	35743310
52	NC_016130	ATA	4	11593	11603	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
53	NC_016130	AT	16	11733	11763	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016130	AT	7	12038	12052	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016130	AAT	4	12241	12253	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016130	TA	6	12272	12282	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016130	AATA	3	12474	12484	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016130	TAA	4	12784	12797	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743310
59	NC_016130	ATA	23	12834	12902	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743310
60	NC_016130	TAT	4	13107	13117	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743310
61	NC_016130	TA	6	13353	13363	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743310
62	NC_016130	TTA	4	13460	13471	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743310
63	NC_016130	TAA	4	13612	13623	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743310
64	NC_016130	TAA	4	13833	13845	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743310
65	NC_016130	AAAT	3	14380	14391	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35743310
66	NC_016130	AAT	4	14473	14483	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
67	NC_016130	ATA	4	14491	14502	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
68	NC_016130	ACAT	3	14838	14850	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	35743310
69	NC_016130	AT	11	15263	15284	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743310
70	NC_016130	AATATT	4	15389	15412	24	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	35743310
71	NC_016130	ATTAAT	3	15547	15564	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35743310
72	NC_016130	ATA	6	15656	15673	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743310
73	NC_016130	TAA	4	15880	15891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743310
74	NC_016130	GTGTA	3	16074	16087	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	35743310
75	NC_016130	AACA	3	16737	16748	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	35743310
76	NC_016130	AT	8	16849	16864	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35743310
77	NC_016130	TTA	4	17080	17091	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743310
78	NC_016130	ATG	4	17267	17278	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35743310
79	NC_016130	ATAG	3	17585	17596	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	35743310
80	NC_016130	TAAA	3	17837	17847	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35743310
81	NC_016130	ATA	4	18400	18411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
82	NC_016130	AT	6	18775	18788	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743310
83	NC_016130	TA	8	18859	18873	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35743310
84	NC_016130	AT	8	18898	18912	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35743310
85	NC_016130	AT	6	18998	19008	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743310
86	NC_016130	AT	10	19022	19042	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743310
87	NC_016130	TAA	4	19084	19095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
88	NC_016130	TAA	4	19330	19341	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
89	NC_016130	TAA	4	19437	19447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
90	NC_016130	ATA	4	19564	19574	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
91	NC_016130	ATA	4	19722	19732	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
92	NC_016130	AATT	3	19736	19748	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743310
93	NC_016130	TA	6	19763	19774	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743310
94	NC_016130	ATA	4	19779	19790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
95	NC_016130	TA	7	19792	19804	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743310
96	NC_016130	TAAATA	3	19812	19830	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	35743310
97	NC_016130	AAATT	3	20006	20019	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35743310
98	NC_016130	AGA	4	20679	20689	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35743310
99	NC_016130	TAAAA	3	20843	20857	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	35743310
100	NC_016130	AT	6	21030	21040	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743310
101	NC_016130	AAAT	3	21758	21768	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35743310
102	NC_016130	TAA	4	21812	21823	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
103	NC_016130	TA	7	22212	22224	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743310
104	NC_016130	TA	9	22242	22258	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35743310
105	NC_016130	TTA	4	22377	22388	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743310
106	NC_016130	AT	6	22478	22488	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743310
107	NC_016130	ATA	7	22617	22638	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
108	NC_016130	AT	6	22639	22649	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743310
109	NC_016130	AATA	3	22745	22755	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35743310
110	NC_016130	TAT	4	22759	22771	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743310
111	NC_016130	TATT	5	23101	23119	19	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	35743310
112	NC_016130	ATA	5	23330	23343	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743310
113	NC_016130	ATA	4	23852	23862	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
114	NC_016130	A	12	24005	24016	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	35743310
115	NC_016130	AATT	3	24074	24085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	35743310
116	NC_016130	AATT	3	24676	24686	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016130	ATA	4	24860	24870	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016130	TA	7	24944	24957	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016130	TA	12	24973	24997	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016130	GTTA	3	25168	25178	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016130	CTA	4	25446	25457	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016130	TAG	4	25993	26004	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35743310
123	NC_016130	ACAAA	5	26968	26992	25	80 %	0 %	0 %	20 %	8 %	35743311
124	NC_016130	TTC	4	27279	27290	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743311
125	NC_016130	TAT	4	27412	27423	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743311
126	NC_016130	CTT	4	27779	27790	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743311
127	NC_016130	ATGG	3	27895	27905	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	35743311
128	NC_016130	TAC	4	27936	27947	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35743311
129	NC_016130	AT	6	28046	28057	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743311
130	NC_016130	TTA	5	28998	29013	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35743311
131	NC_016130	AATT	3	29071	29082	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743311
132	NC_016130	TTA	4	29269	29279	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743311
133	NC_016130	TTTA	3	29336	29346	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35743311
134	NC_016130	AT	6	29727	29737	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743311
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida deformans mitochondrion