ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida deformans mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016130	TAA	4	50	62	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016130	TTA	4	163	173	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016130	ATA	4	796	807	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016130	ATA	4	1359	1371	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016130	ATA	4	2225	2236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016130	TAA	5	3387	3401	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016130	TAT	5	3402	3416	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016130	TAA	4	4661	4672	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016130	TAT	4	5833	5844	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743309
10	NC_016130	ATA	4	6347	6357	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
11	NC_016130	ATA	4	7474	7485	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
12	NC_016130	ATT	4	7566	7577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743310
13	NC_016130	TTC	4	7687	7698	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743310
14	NC_016130	TTA	4	8231	8241	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016130	TAA	4	8371	8382	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016130	TAA	4	9362	9372	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016130	TAT	4	10344	10355	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016130	ATA	6	10837	10854	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743310
19	NC_016130	ATA	4	10924	10934	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
20	NC_016130	TAA	5	11114	11128	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743310
21	NC_016130	ATA	4	11224	11234	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
22	NC_016130	ATA	4	11593	11603	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
23	NC_016130	AAT	4	12241	12253	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016130	TAA	4	12784	12797	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743310
25	NC_016130	ATA	23	12834	12902	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743310
26	NC_016130	TAT	4	13107	13117	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743310
27	NC_016130	TTA	4	13460	13471	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743310
28	NC_016130	TAA	4	13612	13623	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743310
29	NC_016130	TAA	4	13833	13845	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743310
30	NC_016130	AAT	4	14473	14483	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
31	NC_016130	ATA	4	14491	14502	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
32	NC_016130	ATA	6	15656	15673	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743310
33	NC_016130	TAA	4	15880	15891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743310
34	NC_016130	TTA	4	17080	17091	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743310
35	NC_016130	ATG	4	17267	17278	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35743310
36	NC_016130	ATA	4	18400	18411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
37	NC_016130	TAA	4	19084	19095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
38	NC_016130	TAA	4	19330	19341	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
39	NC_016130	TAA	4	19437	19447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
40	NC_016130	ATA	4	19564	19574	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
41	NC_016130	ATA	4	19722	19732	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
42	NC_016130	ATA	4	19779	19790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
43	NC_016130	AGA	4	20679	20689	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35743310
44	NC_016130	TAA	4	21812	21823	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743310
45	NC_016130	TTA	4	22377	22388	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743310
46	NC_016130	ATA	7	22617	22638	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
47	NC_016130	TAT	4	22759	22771	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743310
48	NC_016130	ATA	5	23330	23343	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743310
49	NC_016130	ATA	4	23852	23862	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743310
50	NC_016130	ATA	4	24860	24870	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016130	CTA	4	25446	25457	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016130	TAG	4	25993	26004	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35743310
53	NC_016130	TTC	4	27279	27290	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743311
54	NC_016130	TAT	4	27412	27423	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743311
55	NC_016130	CTT	4	27779	27790	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743311
56	NC_016130	TAC	4	27936	27947	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35743311
57	NC_016130	TTA	5	28998	29013	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35743311
58	NC_016130	TTA	4	29269	29279	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743311
59	NC_016130	ATA	4	31137	31147	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016130	TTA	4	31592	31602	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743311
61	NC_016130	TAA	5	32046	32060	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016130	TAT	4	32377	32387	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743311
63	NC_016130	TTA	4	33266	33277	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743311
64	NC_016130	TAA	5	33438	33452	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743311
65	NC_016130	TAT	8	33464	33488	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743311
66	NC_016130	TAT	4	35164	35174	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743311
67	NC_016130	TAA	4	35861	35872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743311
68	NC_016130	ATT	8	36419	36442	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743311
69	NC_016130	ATT	4	36547	36558	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016130	TTA	4	36767	36778	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016130	TTA	4	37694	37705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743311
72	NC_016130	TTA	4	38423	38434	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743311
73	NC_016130	ATT	4	38691	38702	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743311
74	NC_016130	TAA	4	38782	38792	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743311
75	NC_016130	TTA	4	39089	39100	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743311
76	NC_016130	TTA	5	39412	39426	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743311
77	NC_016130	AAT	4	39427	39439	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743311
78	NC_016130	ATA	4	39788	39799	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743311
79	NC_016130	ATA	4	40428	40440	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida deformans mitochondrion