Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica rapa subsp. campestris mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016125CTT412241236130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352672
2NC_016125TTC522232237150 %66.67 %0 %33.33 %6 %35352672
3NC_016125CTT841824205240 %66.67 %0 %33.33 %0 %35352672
4NC_016125GGT466346645120 %33.33 %66.67 %0 %8 %35352672
5NC_016125AGA6900490221966.67 %0 %33.33 %0 %10 %35352672
6NC_016125TTC41241212422110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352672
7NC_016125CTA415424154351233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35352672
8NC_016125CAG416766167771233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35352672
9NC_016125TGT42255922570120 %66.67 %33.33 %0 %8 %35352672
10NC_016125TGA423360233711233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %35352672
11NC_016125TGC43157931590120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35352672
12NC_016125AGC434647346581233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35352672
13NC_016125CAC435129351391133.33 %0 %0 %66.67 %9 %35352672
14NC_016125GAA435609356201266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352672
15NC_016125AGA436961369711166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352672
16NC_016125ATT438317383281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %35352672
17NC_016125ATA440697407091366.67 %33.33 %0 %0 %7 %35352672
18NC_016125CTT44073740747110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352672
19NC_016125TGC44389043900110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %35352672
20NC_016125CTT44611446126130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352672
21NC_016125TTC45244852458110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352672
22NC_016125CAT456340563501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352672
23NC_016125ATC458039580491133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352672
24NC_016125CTA460445604561233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35352672
25NC_016125GAA463454634651266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352672
26NC_016125GGC46624166253130 %0 %66.67 %33.33 %7 %35352672
27NC_016125TCT46725167262120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
28NC_016125CTA468565685751133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352672
29NC_016125TAT469405694151133.33 %66.67 %0 %0 %9 %35352672
30NC_016125ACT570112701261533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %35352672
31NC_016125GAA570466704801566.67 %0 %33.33 %0 %6 %35352672
32NC_016125CTT47051470525120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
33NC_016125CGC47393673946110 %0 %33.33 %66.67 %9 %35352672
34NC_016125AAT473947739581266.67 %33.33 %0 %0 %8 %35352672
35NC_016125TAT475268752801333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35352672
36NC_016125CGA475428754391233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35352672
37NC_016125AGA475538755501366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35352672
38NC_016125AGG577340773541533.33 %0 %66.67 %0 %6 %35352672
39NC_016125CGA478965789751133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %35352672
40NC_016125TCT48035880369120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
41NC_016125TTC48085180862120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
42NC_016125TCT48164681657120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
43NC_016125TTC48205282064130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352672
44NC_016125CTT48386183873130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352672
45NC_016125TTC58486084874150 %66.67 %0 %33.33 %6 %35352672
46NC_016125GTT48645986470120 %66.67 %33.33 %0 %0 %35352672
47NC_016125CTA588285882981433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %35352672
48NC_016125AAG494414944241166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352672
49NC_016125AGC494776947871233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35352672
50NC_016125GAA495638956501366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35352672
51NC_016125GAA498826988361166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352672
52NC_016125AGG41013281013401333.33 %0 %66.67 %0 %7 %35352672
53NC_016125CAG41049991050101233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35352672
54NC_016125ATA41073111073211166.67 %33.33 %0 %0 %9 %35352672
55NC_016125TCA41100601100701133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352672
56NC_016125TCT4111239111251130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352672
57NC_016125TCT4120445120456120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
58NC_016125TCT5121513121526140 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352672
59NC_016125AGA41227751227851166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352672
60NC_016125TTC4124063124073110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352672
61NC_016125TTC4125894125905120 %66.67 %0 %33.33 %0 %35352672
62NC_016125CGG4127694127705120 %0 %66.67 %33.33 %8 %35352672
63NC_016125CTA41325571325681233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35352672
64NC_016125AAT51364711364861666.67 %33.33 %0 %0 %6 %35352672
65NC_016125AGA41366981367101366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35352672
66NC_016125TAC41375151375251133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352672
67NC_016125AGA41378091378211366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35352672
68NC_016125ATA41382421382521166.67 %33.33 %0 %0 %9 %35352672
69NC_016125AAC41553171553281266.67 %0 %0 %33.33 %8 %35352672
70NC_016125AAG41556721556831266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352672
71NC_016125TGC4155785155796120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35352672
72NC_016125ACG41579001579121333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %35352672
73NC_016125CAT41591111591211133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352672
74NC_016125TTG4162127162138120 %66.67 %33.33 %0 %8 %35352672
75NC_016125AAG41622011622121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352672
76NC_016125AGA41649851649951166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352672
77NC_016125CTC8165524165547240 %33.33 %0 %66.67 %8 %35352672
78NC_016125TAT41656821656941333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35352672
79NC_016125CTT4166629166639110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352672
80NC_016125AAG61676271676451966.67 %0 %33.33 %0 %10 %35352672
81NC_016125AGA41680021680121166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352672
82NC_016125ATT41752911753031333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35352672
83NC_016125TAG41761581761681133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %35352672
84NC_016125TCG4177886177896110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %35352672
85NC_016125TCC4178380178391120 %33.33 %0 %66.67 %8 %35352672
86NC_016125GGA41862021862131233.33 %0 %66.67 %0 %8 %35352672
87NC_016125CTT4188074188085120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
88NC_016125AAT41881641881771466.67 %33.33 %0 %0 %7 %35352672
89NC_016125GTG4190040190050110 %33.33 %66.67 %0 %9 %35352672
90NC_016125AGA41965131965231166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352672
91NC_016125CGT4206376206387120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35352672
92NC_016125CTT4209373209384120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
93NC_016125TTC4215670215681120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352672
94NC_016125ATA42188972189081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %35352672