ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida alimentaria mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016124	AATAT	11	1	53	53	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016124	AT	6	2	14	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016124	AAAT	3	71	82	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016124	TTA	4	254	264	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016124	AAGT	3	673	683	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016124	TAAT	3	728	739	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016124	ATA	4	915	926	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016124	AATT	3	1762	1773	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016124	TAT	4	2065	2076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016124	ATA	4	2389	2400	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016124	AT	7	2958	2970	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016124	TAA	4	3425	3436	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016124	TTAA	3	3454	3464	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016124	AT	8	3538	3552	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016124	TA	12	3774	3799	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016124	TA	6	4480	4491	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016124	ATA	4	4491	4501	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016124	TTAAAT	3	4522	4540	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
19	NC_016124	TAA	4	4582	4594	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016124	AT	6	5048	5058	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016124	ATA	5	5115	5130	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016124	TA	6	5931	5941	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743306
23	NC_016124	TAT	4	6264	6275	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743306
24	NC_016124	CTC	4	6329	6341	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016124	TTAG	3	6684	6694	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35743306
26	NC_016124	CTGAAT	3	7081	7098	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	35743306
27	NC_016124	TTC	4	7143	7154	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743306
28	NC_016124	TTA	4	7196	7208	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743306
29	NC_016124	AT	6	7455	7465	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743306
30	NC_016124	TTA	4	7647	7657	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016124	AAT	4	7706	7717	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016124	ATA	4	7741	7752	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016124	TAAATA	3	7756	7774	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
34	NC_016124	TAA	4	8170	8181	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016124	AT	6	8201	8211	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016124	CAAA	3	8286	8297	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016124	ATA	4	8319	8329	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016124	TA	7	8424	8437	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016124	TAAA	3	9599	9609	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016124	AT	6	9923	9934	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016124	AAAT	3	10030	10041	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35743306
42	NC_016124	ATA	6	10212	10228	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743306
43	NC_016124	ATA	4	10299	10309	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743306
44	NC_016124	TTTA	3	10456	10468	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	35743306
45	NC_016124	TAA	4	10516	10527	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743306
46	NC_016124	AAAG	3	10921	10932	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35743306
47	NC_016124	ATA	4	10989	11001	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743306
48	NC_016124	ATA	4	11060	11072	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743306
49	NC_016124	TA	7	11606	11618	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016124	TTAA	3	11630	11642	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016124	TTAA	3	11655	11667	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016124	TA	6	11676	11689	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016124	TAA	6	11742	11758	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016124	A	12	11772	11783	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016124	TAAT	3	12203	12214	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743306
56	NC_016124	AAT	4	12290	12301	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743306
57	NC_016124	TAA	5	12518	12531	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743306
58	NC_016124	TTA	4	12821	12831	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743306
59	NC_016124	AT	6	13636	13646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743306
60	NC_016124	TTA	4	13864	13875	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743306
61	NC_016124	GGT	4	13954	13965	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	35743306
62	NC_016124	ATA	4	14762	14773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743306
63	NC_016124	TAATA	3	14877	14890	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35743306
64	NC_016124	TA	7	15061	15073	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743306
65	NC_016124	ATTT	3	15284	15295	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35743306
66	NC_016124	ATATT	3	15464	15478	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	35743306
67	NC_016124	TAA	4	15490	15500	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743306
68	NC_016124	TA	6	15658	15668	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743306
69	NC_016124	TAA	4	15972	15984	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743306
70	NC_016124	AAT	5	16208	16222	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743306
71	NC_016124	TTAA	3	16242	16253	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743306
72	NC_016124	TA	6	16365	16375	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743306
73	NC_016124	TAA	4	16499	16509	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743306
74	NC_016124	TA	6	16668	16678	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743306
75	NC_016124	TA	7	17533	17545	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743306
76	NC_016124	AAAAT	3	17884	17899	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	35743306
77	NC_016124	ATA	4	18419	18431	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016124	AT	6	18437	18450	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016124	AT	6	18983	18993	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016124	TCAT	3	19371	19381	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	35743307
81	NC_016124	AAAAAC	7	19864	19905	42	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016124	TCACCA	3	20136	20153	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	5 %	35743307
83	NC_016124	TTC	4	20379	20390	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743307
84	NC_016124	AATT	3	21076	21087	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743307
85	NC_016124	TTA	4	21274	21284	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743307
86	NC_016124	TCAT	3	21426	21436	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	35743307
87	NC_016124	AT	6	21732	21742	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743307
88	NC_016124	CAAT	3	22165	22176	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	35743307
89	NC_016124	T	13	22481	22493	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016124	TA	7	22520	22533	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016124	AT	8	22552	22566	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016124	AT	6	22601	22613	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016124	TA	7	22614	22627	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016124	AT	6	22788	22798	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016124	AATT	3	22842	22853	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016124	TTTA	3	22989	23001	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016124	TTA	4	23562	23572	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743307
98	NC_016124	GATAT	3	23632	23646	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016124	AATATA	3	23685	23702	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_016124	TAA	4	23764	23774	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016124	ATTT	3	23944	23956	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016124	TTA	4	24231	24242	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743307
103	NC_016124	TA	7	24872	24885	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016124	ATA	4	24941	24952	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016124	ATA	4	24965	24976	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016124	TA	8	25054	25069	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016124	TAA	4	25132	25143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016124	ATATA	4	25157	25175	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_016124	TTA	4	25533	25544	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743307
110	NC_016124	TTA	4	25730	25741	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743307
111	NC_016124	AATT	3	25780	25791	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743307
112	NC_016124	CTA	4	25864	25875	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35743307
113	NC_016124	ATT	4	26406	26417	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743307
114	NC_016124	ATA	4	26524	26534	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743307
115	NC_016124	TAAA	3	27165	27176	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35743307
116	NC_016124	TAAA	3	27295	27307	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35743307
117	NC_016124	TAA	4	27343	27353	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743307
118	NC_016124	TATT	4	27449	27463	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35743307
119	NC_016124	ATT	4	28553	28564	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743307
120	NC_016124	TA	6	28621	28631	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743307
121	NC_016124	TAATC	4	28759	28779	21	40 %	40 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016124	TA	6	28780	28790	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016124	AT	7	28799	28811	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016124	TAA	4	28931	28943	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016124	AT	6	29113	29124	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016124	A	13	29238	29250	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016124	TTATT	3	29251	29265	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016124	TA	6	29276	29288	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016124	TTATA	6	29284	29314	31	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016124	AT	6	29338	29348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016124	ATTT	3	29533	29544	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016124	TTA	4	29976	29987	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743307
133	NC_016124	TA	6	30100	30110	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743307
134	NC_016124	TA	6	30122	30132	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743307
135	NC_016124	AAT	4	30174	30184	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743307
136	NC_016124	A	12	30206	30217	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	35743307
137	NC_016124	AGAA	3	30296	30306	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35743307
138	NC_016124	CAA	4	30418	30429	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35743307
139	NC_016124	ATTA	9	31165	31200	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743307
140	NC_016124	TA	6	31601	31611	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743307
141	NC_016124	AT	7	31613	31626	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743307
142	NC_016124	AAAT	3	31649	31660	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35743307
143	NC_016124	TAAATG	3	32357	32374	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	35743307
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145	NC_016124	TTA	4	33243	33254	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743307
146	NC_016124	ATAA	3	33341	33352	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida alimentaria mitochondrion