Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica juncea mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016123CTT412261238130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35353133
2NC_016123TTC522252239150 %66.67 %0 %33.33 %6 %35353133
3NC_016123CTT841844207240 %66.67 %0 %33.33 %0 %35353133
4NC_016123GGT466366647120 %33.33 %66.67 %0 %8 %35353133
5NC_016123AGA6900690241966.67 %0 %33.33 %0 %10 %35353133
6NC_016123TTC41241412424110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35353133
7NC_016123CTA415427154381233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35353133
8NC_016123CAG416769167801233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35353133
9NC_016123TGT42256322574120 %66.67 %33.33 %0 %8 %35353133
10NC_016123TGA423364233751233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %35353133
11NC_016123TGC43158331594120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35353133
12NC_016123AGC434649346601233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35353133
13NC_016123CAC435131351411133.33 %0 %0 %66.67 %9 %35353133
14NC_016123GAA435612356231266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35353133
15NC_016123AGA436965369751166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35353133
16NC_016123ATT438321383321233.33 %66.67 %0 %0 %8 %35353133
17NC_016123ATA440701407131366.67 %33.33 %0 %0 %7 %35353133
18NC_016123CTT44074140751110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35353133
19NC_016123TGC44389443904110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %35353133
20NC_016123CTT44611846130130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35353133
21NC_016123TTC45245252462110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35353133
22NC_016123CAT456345563551133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35353133
23NC_016123ATC458044580541133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35353133
24NC_016123CTA460451604621233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35353133
25NC_016123GAA463460634711266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35353133
26NC_016123GGC46624766259130 %0 %66.67 %33.33 %7 %35353133
27NC_016123TCT46725867269120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
28NC_016123CTA468572685821133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35353133
29NC_016123TAT469411694211133.33 %66.67 %0 %0 %9 %35353133
30NC_016123ACT570117701311533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %35353133
31NC_016123GAA570471704851566.67 %0 %33.33 %0 %6 %35353133
32NC_016123CTT47051970530120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
33NC_016123CGC47394173951110 %0 %33.33 %66.67 %9 %35353133
34NC_016123AAT473952739631266.67 %33.33 %0 %0 %8 %35353133
35NC_016123TAT475273752851333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35353133
36NC_016123CGA475433754441233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35353133
37NC_016123AGA475543755551366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35353133
38NC_016123AGG577345773591533.33 %0 %66.67 %0 %6 %35353133
39NC_016123CGA478970789801133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %35353133
40NC_016123TCT48036380374120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
41NC_016123TTC48085680867120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
42NC_016123TCT48165381664120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
43NC_016123TTC48205982071130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35353133
44NC_016123CTT48386883880130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35353133
45NC_016123TTC58486784881150 %66.67 %0 %33.33 %6 %35353133
46NC_016123GTT48646686477120 %66.67 %33.33 %0 %0 %35353133
47NC_016123CTA588292883051433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %35353133
48NC_016123AAG494422944321166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35353133
49NC_016123AGC494784947951233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35353133
50NC_016123GAA495646956581366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35353133
51NC_016123GAA498834988441166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35353133
52NC_016123AGG41013371013491333.33 %0 %66.67 %0 %7 %35353133
53NC_016123CAG41050081050191233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35353133
54NC_016123ATA41073201073301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %35353133
55NC_016123TCA41100691100791133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35353133
56NC_016123TCT4111248111260130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35353133
57NC_016123TCT4120456120467120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
58NC_016123TCT5121524121537140 %66.67 %0 %33.33 %7 %35353133
59NC_016123AGA41227861227961166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35353133
60NC_016123TTC4124074124084110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35353133
61NC_016123TTC4125905125916120 %66.67 %0 %33.33 %0 %35353133
62NC_016123CGG4127706127717120 %0 %66.67 %33.33 %8 %35353133
63NC_016123CTA41325711325821233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35353133
64NC_016123AAT51364851365001666.67 %33.33 %0 %0 %6 %35353133
65NC_016123AGA41367121367241366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35353133
66NC_016123TAC41375291375391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35353133
67NC_016123AGA41378231378351366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35353133
68NC_016123ATA41382561382661166.67 %33.33 %0 %0 %9 %35353133
69NC_016123AAC41553331553441266.67 %0 %0 %33.33 %8 %35353133
70NC_016123AAG41556881556991266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35353133
71NC_016123TGC4155801155812120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35353133
72NC_016123ACG41579161579281333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %35353133
73NC_016123CAT41591271591371133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35353133
74NC_016123TTG4162144162155120 %66.67 %33.33 %0 %8 %35353133
75NC_016123AAG41622181622291266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35353133
76NC_016123AGA41650021650121166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35353133
77NC_016123CTC8165541165564240 %33.33 %0 %66.67 %8 %35353133
78NC_016123TAT41656991657111333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35353133
79NC_016123CTT4166647166657110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35353133
80NC_016123AAG61676451676631966.67 %0 %33.33 %0 %10 %35353133
81NC_016123AGA41680201680301166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35353133
82NC_016123ATT41753121753241333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35353133
83NC_016123TAG41761791761891133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %35353133
84NC_016123TCG4177907177917110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %35353133
85NC_016123TCC4178401178412120 %33.33 %0 %66.67 %8 %35353133
86NC_016123GGA41862221862331233.33 %0 %66.67 %0 %8 %35353133
87NC_016123CTT4188094188105120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
88NC_016123AAT41881841881971466.67 %33.33 %0 %0 %7 %35353133
89NC_016123GTG4190060190070110 %33.33 %66.67 %0 %9 %35353133
90NC_016123AGA41965331965431166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35353133
91NC_016123CGT4206396206407120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35353133
92NC_016123CTT4209393209404120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
93NC_016123TTC4215690215701120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35353133
94NC_016123ATA42189162189271266.67 %33.33 %0 %0 %8 %35353133