ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Treubia lacunosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016122	ATT	4	2710	2720	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352658
2	NC_016122	ATT	4	3980	3991	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352658
3	NC_016122	GAT	4	4577	4587	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35352658
4	NC_016122	TAT	4	6934	6944	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352658
5	NC_016122	TAT	4	12773	12783	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016122	TAT	5	26125	26140	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016122	TAA	4	26903	26913	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016122	TTC	4	38845	38857	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016122	TAA	4	46419	46430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35352660
10	NC_016122	ATT	4	51573	51584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352660
11	NC_016122	TTA	5	52618	52631	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352660
12	NC_016122	TAA	4	58314	58325	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35352661
13	NC_016122	TTA	4	58936	58947	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352661
14	NC_016122	ACA	4	59615	59625	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	35352661
15	NC_016122	TAT	4	61183	61193	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352661
16	NC_016122	TAA	4	63378	63389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35352661
17	NC_016122	GAT	4	65670	65680	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35352662
18	NC_016122	TTG	4	75517	75528	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35352662
19	NC_016122	ACT	4	76933	76944	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016122	TGA	4	89711	89722	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016122	ATT	5	91901	91914	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352663
22	NC_016122	CTA	4	98648	98659	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35352663
23	NC_016122	TAA	4	114526	114537	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016122	TCA	4	119987	119998	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016122	AAT	4	120532	120544	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016122	TTC	4	123833	123844	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016122	TAT	4	124194	124206	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016122	AAG	4	125731	125743	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	35352664
29	NC_016122	TAT	4	128273	128283	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352664
30	NC_016122	AAT	4	133250	133261	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016122	ACA	4	136733	136743	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016122	CTT	4	139299	139309	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35352664
33	NC_016122	GCT	4	141105	141116	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35352664
34	NC_016122	CAA	4	145568	145579	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016122	AAG	4	146334	146345	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Treubia lacunosa mitochondrion