ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Treubia lacunosa mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016122	TTTG	3	425	435	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016122	A	15	1951	1965	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016122	AAAG	3	2408	2418	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016122	A	12	2443	2454	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016122	ATT	4	2710	2720	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352658
6	NC_016122	ATT	4	3980	3991	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352658
7	NC_016122	GAT	4	4577	4587	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35352658
8	NC_016122	TCCC	3	5434	5445	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016122	TAT	4	6934	6944	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352658
10	NC_016122	GTAC	3	7691	7701	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	35352658
11	NC_016122	ATTTT	3	7924	7937	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	35352658
12	NC_016122	GGTT	3	9009	9021	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	35352658
13	NC_016122	TGTT	3	9412	9423	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35352658
14	NC_016122	AT	6	10566	10577	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35352658
15	NC_016122	AT	6	10901	10914	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35352658
16	NC_016122	TTTG	3	11455	11465	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35352658
17	NC_016122	TTCA	3	12660	12671	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016122	TAT	4	12773	12783	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016122	TA	6	13997	14007	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016122	AT	6	14968	14980	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016122	GA	6	15147	15157	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016122	A	13	16260	16272	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016122	AAAT	3	16705	16716	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016122	AG	6	17789	17799	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	35352658
25	NC_016122	CATA	3	17966	17977	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	35352658
26	NC_016122	G	12	18169	18180	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016122	ATTT	5	19703	19722	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_016122	TGAA	3	20727	20737	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016122	ATTT	3	22514	22525	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016122	T	12	23042	23053	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016122	TAAAA	3	23394	23407	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016122	CAAA	3	24652	24662	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016122	GCTG	3	25276	25287	12	0 %	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016122	G	16	25659	25674	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016122	TAT	5	26125	26140	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016122	TAA	4	26903	26913	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016122	A	12	27720	27731	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016122	AATAT	3	28013	28027	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016122	AT	8	28587	28602	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016122	TA	7	28925	28939	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016122	ATGC	3	31282	31293	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016122	TTCT	3	32306	32317	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016122	AT	8	35191	35205	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35352659
44	NC_016122	AT	6	35207	35218	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35352659
45	NC_016122	AAAT	3	36229	36239	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016122	AT	6	36407	36418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016122	TTC	4	38845	38857	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016122	GA	7	38907	38920	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016122	TTTATT	3	39809	39827	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
50	NC_016122	AGGT	3	39870	39881	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016122	TA	6	40170	40181	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016122	AACC	3	44852	44862	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	35352660
53	NC_016122	AGCG	3	46304	46314	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	35352660
54	NC_016122	TAA	4	46419	46430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35352660
55	NC_016122	AT	6	46801	46812	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016122	AT	8	46817	46832	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016122	C	23	47611	47633	23	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	35352660
58	NC_016122	CAAA	3	47925	47935	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	35352660
59	NC_016122	CGTA	3	50017	50027	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	35352660
60	NC_016122	CCCT	3	50182	50193	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	35352660
61	NC_016122	ATT	4	51573	51584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352660
62	NC_016122	TTA	5	52618	52631	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352660
63	NC_016122	GGGAAA	3	53270	53287	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	35352660
64	NC_016122	TTTG	3	57852	57862	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35352661
65	NC_016122	A	14	58129	58142	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35352661
66	NC_016122	TAA	4	58314	58325	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35352661
67	NC_016122	TTA	4	58936	58947	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352661
68	NC_016122	ACA	4	59615	59625	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	35352661
69	NC_016122	CAAG	3	59699	59710	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	35352661
70	NC_016122	AATA	3	60253	60263	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35352661
71	NC_016122	TAT	4	61183	61193	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352661
72	NC_016122	AT	6	62480	62491	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016122	TAA	4	63378	63389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35352661
74	NC_016122	AG	6	63676	63686	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016122	AG	6	64460	64471	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	35352662
76	NC_016122	GAT	4	65670	65680	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35352662
77	NC_016122	AATT	3	65788	65799	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35352662
78	NC_016122	AAAT	3	66687	66699	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35352662
79	NC_016122	G	17	67791	67807	17	0 %	0 %	100 %	0 %	5 %	35352662
80	NC_016122	TCAC	3	71102	71113	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	35352662
81	NC_016122	TC	6	74007	74018	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	35352662
82	NC_016122	ACAT	3	74193	74203	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	35352662
83	NC_016122	AAGT	3	74729	74739	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	35352662
84	NC_016122	TTG	4	75517	75528	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35352662
85	NC_016122	C	13	75595	75607	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016122	ACT	4	76933	76944	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016122	CCAT	3	77318	77329	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016122	AT	11	81413	81433	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016122	TTGG	3	83157	83168	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	35352662
90	NC_016122	AAAC	3	83722	83733	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	35352662
91	NC_016122	GGGA	3	85971	85982	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	35352662
92	NC_016122	GGCG	3	86384	86395	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	35352662
93	NC_016122	TGA	4	89711	89722	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016122	AAAT	3	90587	90598	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016122	ATT	5	91901	91914	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352663
96	NC_016122	AT	7	93205	93218	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016122	AT	6	93352	93362	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35352663
98	NC_016122	AAAC	3	94821	94832	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	35352663
99	NC_016122	CCCT	3	95837	95847	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016122	ACAA	3	97803	97814	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	35352663
101	NC_016122	CTA	4	98648	98659	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35352663
102	NC_016122	AATC	3	101380	101391	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	35352663
103	NC_016122	TCTT	3	101443	101454	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35352663
104	NC_016122	TCAC	3	104279	104289	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	35352663
105	NC_016122	AT	6	107512	107522	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35352663
106	NC_016122	TC	6	109447	109457	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35352663
107	NC_016122	TTCG	3	113375	113387	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	35352663
108	NC_016122	GC	6	114165	114175	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	35352663
109	NC_016122	TAA	4	114526	114537	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016122	GA	6	114665	114675	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016122	CGCCC	3	118526	118540	15	0 %	0 %	20 %	80 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016122	AT	6	118546	118556	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016122	ACAA	3	119375	119386	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016122	TCA	4	119987	119998	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016122	TTTC	3	120491	120501	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016122	GAAA	3	120502	120512	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016122	AAT	4	120532	120544	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016122	TTC	4	123833	123844	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016122	TAT	4	124194	124206	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016122	AT	6	124227	124239	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016122	TTGT	3	124607	124618	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016122	AAAG	3	125401	125412	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35352664
123	NC_016122	AAG	4	125731	125743	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	35352664
124	NC_016122	CAAA	3	126416	126428	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016122	CTAT	3	127480	127491	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016122	AT	6	127495	127508	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016122	TA	6	127560	127571	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016122	TA	6	128105	128115	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35352664
129	NC_016122	TAT	4	128273	128283	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352664
130	NC_016122	CAAA	3	128442	128452	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	35352664
131	NC_016122	TTTG	3	129098	129109	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016122	TA	6	131168	131178	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35352663
133	NC_016122	CCCG	3	131587	131598	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016122	TTCT	3	133117	133127	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016122	AAT	4	133250	133261	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016122	TTTC	5	134351	134369	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	35352664
137	NC_016122	A	12	134769	134780	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016122	A	12	135932	135943	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016122	ACA	4	136733	136743	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016122	CGAA	3	137955	137966	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016122	AAAT	3	137997	138007	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016122	TG	7	138308	138320	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	35352664
143	NC_016122	TCCC	4	138326	138340	15	0 %	25 %	0 %	75 %	6 %	35352664
144	NC_016122	ATTG	3	139031	139041	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35352664
145	NC_016122	CTT	4	139299	139309	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35352664
146	NC_016122	CGTA	3	140486	140496	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	35352664
147	NC_016122	GCT	4	141105	141116	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35352664
148	NC_016122	T	13	143477	143489	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_016122	AAAG	3	144405	144415	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016122	CAA	4	145568	145579	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016122	AAG	4	146334	146345	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016122	A	15	147266	147280	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
153	NC_016122	AT	7	147984	147999	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
154	NC_016122	GGTC	3	148110	148120	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016122	CTTA	3	148927	148937	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016122	A	14	150563	150576	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016122	TACTTG	3	150853	150871	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10 %	35352664
158	NC_016122	TGTT	3	151061	151071	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35352664
159	NC_016122	T	14	151378	151391	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Treubia lacunosa mitochondrion