ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Anomodon rugelii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016121	CTC	4	7229	7240	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	35352653
2	NC_016121	CAA	4	15835	15845	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016121	ATT	4	19683	19695	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35352654
4	NC_016121	TGA	4	19966	19977	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35352654
5	NC_016121	TAA	4	21366	21377	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016121	AGA	4	24254	24264	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016121	CAT	4	28026	28036	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35352654
8	NC_016121	TCT	4	29861	29873	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35352654
9	NC_016121	ATG	4	31201	31212	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016121	TAA	4	34837	34848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016121	ATA	4	34921	34932	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016121	GCG	4	35740	35750	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016121	GAA	7	41111	41130	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_016121	TAA	4	41144	41155	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016121	AGA	4	47310	47321	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35352655
16	NC_016121	ACT	4	48666	48678	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	35352655
17	NC_016121	GAT	4	48949	48959	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35352655
18	NC_016121	GAA	6	49765	49782	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016121	TCT	4	52087	52098	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35352655
20	NC_016121	CTC	4	59142	59154	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	35352655
21	NC_016121	TGC	4	61901	61913	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016121	GAA	4	66183	66194	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	35352656
23	NC_016121	TCT	4	66215	66225	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35352656
24	NC_016121	AGG	4	69786	69797	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35352656
25	NC_016121	TTG	4	72811	72822	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35352656
26	NC_016121	TTA	4	73087	73098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352656
27	NC_016121	GCT	4	76344	76355	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35352656
28	NC_016121	CTT	4	84257	84268	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016121	CTT	4	84709	84720	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35352656
30	NC_016121	CGA	4	89217	89227	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	35352656
31	NC_016121	ATT	4	93592	93603	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352657
32	NC_016121	AGA	4	94211	94222	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35352657
33	NC_016121	TTA	4	94754	94765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352657
34	NC_016121	TAT	4	95722	95732	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016121	ATA	4	96171	96182	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35352657
36	NC_016121	TTA	4	99914	99925	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352657

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Anomodon rugelii mitochondrion