Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica carinata mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016120TCT413541365120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_016120GAA4397139821266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
3NC_016120ATC4444044501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
4NC_016120GAA4475047611266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
5NC_016120GAA5664966631566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
6NC_016120CTT466946705120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
7NC_016120TAA410136101471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %35352646
8NC_016120TAT411453114651333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35352646
9NC_016120CGA411613116241233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35352646
10NC_016120AGA411723117351366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35352646
11NC_016120AGG513525135391533.33 %0 %66.67 %0 %6 %Non-Coding
12NC_016120CGA415149151591133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
13NC_016120TCT41654216553120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352646
14NC_016120TTC41703517046120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352646
15NC_016120TCT41783217843120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
16NC_016120TTC41823818250130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
17NC_016120CTT42005020062130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352646
18NC_016120TTC52104821062150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
19NC_016120GTT42272522736120 %66.67 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
20NC_016120CTA524551245641433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
21NC_016120AAG627616276341966.67 %0 %33.33 %0 %10 %Non-Coding
22NC_016120AGA427991280011166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
23NC_016120GTA432144321551233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
24NC_016120CTT43268532695110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
25NC_016120TCC43586435875120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
26NC_016120GAA439579395891166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
27NC_016120GCT44117841188110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
28NC_016120GGA443682436931233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016120CGA444177441871133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_016120TCT44814948160120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
31NC_016120ACA448960489741566.67 %0 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
32NC_016120GAA451465514761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
33NC_016120TGA451929519391133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %35352647
34NC_016120CTG45700057012130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
35NC_016120CCT45984759859130 %33.33 %0 %66.67 %7 %35352649
36NC_016120TTC46235262362110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352649
37NC_016120GCT46639766408120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35352649
38NC_016120GTT47034870358110 %66.67 %33.33 %0 %9 %35352649
39NC_016120AGG471484714941133.33 %0 %66.67 %0 %9 %35352649
40NC_016120AGC472111721211133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %35352649
41NC_016120TCT47329473305120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352649
42NC_016120TGA474309743201233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %35352649
43NC_016120ATC476045760561233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35352649
44NC_016120ACA476844768551266.67 %0 %0 %33.33 %8 %35352649
45NC_016120TAG482554825651233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %35352649
46NC_016120CAA484563845731166.67 %0 %0 %33.33 %9 %35352649
47NC_016120TTC49142291432110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352649
48NC_016120GAA693761937781866.67 %0 %33.33 %0 %0 %35352649
49NC_016120TCT49710297113120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352649
50NC_016120GAA499719997301266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352649
51NC_016120ATC41001881001981133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352649
52NC_016120GAA41004981005091266.67 %0 %33.33 %0 %0 %35352649
53NC_016120GTA41041551041651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %35352649
54NC_016120AGA41054701054811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352649
55NC_016120CGC4106479106491130 %0 %33.33 %66.67 %7 %35352649
56NC_016120CTT4109262109273120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352649
57NC_016120AAG41106851106961266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352649
58NC_016120TAG41122361122471233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %35352649
59NC_016120CTT4113562113572110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352649
60NC_016120CGG4113967113978120 %0 %66.67 %33.33 %8 %35352649
61NC_016120CTA41188271188381233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35352649
62NC_016120AAT51227451227601666.67 %33.33 %0 %0 %6 %35352649
63NC_016120AGA41229721229841366.67 %0 %33.33 %0 %7 %35352649
64NC_016120TAC41237891237991133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352649
65NC_016120ATA41245161245261166.67 %33.33 %0 %0 %9 %35352649
66NC_016120AAC41415011415121266.67 %0 %0 %33.33 %8 %35352649
67NC_016120AAG41418561418671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352649
68NC_016120TGC4141969141980120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35352649
69NC_016120ACG41440831440951333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %35352649
70NC_016120CAT41452941453041133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352649
71NC_016120TTG4148312148323120 %66.67 %33.33 %0 %8 %35352649
72NC_016120AAG41483861483971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352649
73NC_016120AGA41511721511821166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352649
74NC_016120CTC8151711151734240 %33.33 %0 %66.67 %8 %35352649
75NC_016120TAT41518691518811333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35352649
76NC_016120GAA51545111545241466.67 %0 %33.33 %0 %7 %35352649
77NC_016120CTT4156206156216110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352649
78NC_016120TGC4162915162926120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %35352649
79NC_016120AGC41659911660021233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %35352649
80NC_016120CAC41664731664831133.33 %0 %0 %66.67 %9 %35352649
81NC_016120GAA41669541669651266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35352649
82NC_016120AGA41683131683231166.67 %0 %33.33 %0 %9 %35352649
83NC_016120ATT41696711696821233.33 %66.67 %0 %0 %8 %35352649
84NC_016120ATA41720511720631366.67 %33.33 %0 %0 %7 %35352649
85NC_016120CTT4172091172101110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352649
86NC_016120TGC4175240175250110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %35352649
87NC_016120CTT4177460177472130 %66.67 %0 %33.33 %7 %35352649
88NC_016120TTC4183795183805110 %66.67 %0 %33.33 %9 %35352649
89NC_016120CAT41876861876961133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352649
90NC_016120ATC41893791893891133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35352649
91NC_016120CTC8190423190446240 %33.33 %0 %66.67 %8 %35352649
92NC_016120CTT4191934191945120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35352649
93NC_016120GTG4193898193908110 %33.33 %66.67 %0 %9 %35352649
94NC_016120TAT42086712086811133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
95NC_016120CGA42154422154531233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
96NC_016120CTG4216509216520120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
97NC_016120TTC4219484219495120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
98NC_016120ATA42227102227211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
99NC_016120CAG52251042251171433.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
100NC_016120TGA42281632281731133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
101NC_016120TAT52289182289331633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
102NC_016120CTT4229734229746130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding