ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida galli mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016116	ATA	4	5	16	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016116	TTA	4	113	123	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016116	ATA	4	756	767	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016116	AT	6	1330	1340	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016116	AATT	3	1572	1583	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016116	AT	8	1952	1967	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016116	AAAT	3	1968	1979	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016116	ATA	4	2179	2190	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016116	TTAA	3	2641	2651	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016116	AT	7	2787	2799	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016116	TA	18	3014	3046	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016116	TAA	4	3274	3285	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016116	C	16	3394	3409	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016116	TA	7	3520	3535	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016116	TAT	4	4065	4076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016116	TAAA	3	4173	4183	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016116	TGAA	3	4257	4268	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016116	TA	6	4485	4495	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016116	AT	8	4788	4802	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016116	TA	6	5618	5628	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743303
21	NC_016116	TAT	4	5951	5962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743303
22	NC_016116	ATTT	5	6698	6718	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35743303
23	NC_016116	AT	10	6940	6958	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	35743303
24	NC_016116	TA	8	7111	7126	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35743303
25	NC_016116	TTAG	3	7280	7290	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35743303
26	NC_016116	GTTC	3	7540	7551	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	35743303
27	NC_016116	ATT	4	7618	7629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743303
28	NC_016116	TTC	4	7739	7750	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743303
29	NC_016116	TAATA	3	8082	8096	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	35743303
30	NC_016116	CTC	4	8128	8138	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016116	AT	6	8181	8192	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016116	TTA	4	8255	8265	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016116	C	12	8326	8337	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016116	TTTA	3	8339	8351	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016116	TA	6	8354	8364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016116	A	12	8462	8473	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016116	TA	6	8603	8613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016116	TAA	4	8690	8700	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016116	AT	6	8700	8710	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016116	TA	6	8716	8726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016116	CAAA	3	8805	8816	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016116	ATATT	3	9789	9802	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016116	TAT	4	10143	10153	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016116	AAT	4	10167	10179	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016116	TA	6	10314	10325	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016116	ACAAAT	3	10415	10432	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016116	ATA	5	10454	10467	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016116	ATA	6	10640	10656	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743304
49	NC_016116	ATA	4	10727	10737	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
50	NC_016116	TAATA	3	10914	10927	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35743304
51	NC_016116	ATA	4	11021	11031	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
52	NC_016116	TAAA	4	11207	11223	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	35743304
53	NC_016116	ATA	7	11378	11398	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	35743304
54	NC_016116	AT	6	11513	11525	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016116	TA	16	11526	11556	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016116	A	12	11627	11638	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016116	AT	7	11702	11715	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016116	ATAA	4	11859	11873	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016116	TA	6	12069	12079	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016116	ATAA	4	12118	12133	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016116	AAAT	3	12303	12314	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016116	TCT	4	12569	12580	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743304
63	NC_016116	TA	8	12696	12710	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35743304
64	NC_016116	AATAA	4	12900	12918	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	35743304
65	NC_016116	TTA	4	13073	13084	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
66	NC_016116	ATA	4	13082	13094	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743304
67	NC_016116	TAA	4	13095	13106	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
68	NC_016116	ATTAAT	3	13284	13301	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35743304
69	NC_016116	ATT	4	13399	13410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
70	NC_016116	TAA	4	13635	13646	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743304
71	NC_016116	GTGTA	3	13814	13827	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	35743304
72	NC_016116	AT	7	14581	14594	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743304
73	NC_016116	TTA	4	14810	14821	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743304
74	NC_016116	ATAATG	3	15018	15035	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	35743304
75	NC_016116	AACATG	3	15036	15053	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	35743304
76	NC_016116	ATA	4	15093	15104	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
77	NC_016116	TAT	4	15702	15712	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743304
78	NC_016116	AT	6	15757	15767	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
79	NC_016116	TAA	4	15805	15816	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
80	NC_016116	AT	6	16069	16082	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743304
81	NC_016116	TA	6	16080	16090	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
82	NC_016116	ATA	4	16118	16129	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
83	NC_016116	ATTTAT	3	16155	16172	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35743304
84	NC_016116	AAT	4	16234	16245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
85	NC_016116	TAA	4	16282	16292	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
86	NC_016116	TATT	3	16293	16304	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35743304
87	NC_016116	TAA	4	16428	16439	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
88	NC_016116	TA	6	16461	16471	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
89	NC_016116	AT	6	16553	16564	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743304
90	NC_016116	AT	6	16722	16732	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
91	NC_016116	AT	9	16748	16765	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35743304
92	NC_016116	TAA	4	16808	16819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
93	NC_016116	ATA	5	17049	17064	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743304
94	NC_016116	TAA	4	17161	17171	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
95	NC_016116	ATA	4	17446	17456	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
96	NC_016116	AATT	3	17460	17472	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35743304
97	NC_016116	TA	6	17487	17498	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743304
98	NC_016116	TAAA	3	17745	17755	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35743304
99	NC_016116	TA	6	18170	18180	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
100	NC_016116	AAAT	3	18465	18477	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35743304
101	NC_016116	AT	6	18961	18971	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
102	NC_016116	ATTA	3	19112	19123	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743304
103	NC_016116	TAT	4	19697	19707	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743304
104	NC_016116	AAT	4	19731	19741	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
105	NC_016116	TAAA	3	19898	19909	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35743304
106	NC_016116	ATGAT	3	20023	20036	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	35743304
107	NC_016116	TA	6	20037	20047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
108	NC_016116	AGG	4	20090	20101	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35743304
109	NC_016116	TTAA	3	20335	20345	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743304
110	NC_016116	TA	8	20503	20519	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35743304
111	NC_016116	AATA	3	21141	21152	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35743304
112	NC_016116	TATT	5	21199	21217	19	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	35743304
113	NC_016116	TAAA	3	21417	21429	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35743304
114	NC_016116	TAA	4	21436	21447	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
115	NC_016116	TTA	4	21642	21653	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
116	NC_016116	TCAA	3	21763	21775	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	35743304
117	NC_016116	TAAAAA	3	21995	22013	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
118	NC_016116	AATT	3	22028	22038	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016116	TA	7	22275	22288	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016116	TA	7	22306	22321	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_016116	TTC	4	22723	22734	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016116	AT	6	22792	22802	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016116	TAT	4	22974	22985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016116	AT	6	23829	23841	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016116	ACAAAA	6	24168	24203	36	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	8 %	35743304
126	NC_016116	TAT	5	24624	24637	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743304
127	NC_016116	AT	6	25301	25312	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743304
128	NC_016116	TAA	4	25334	25345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
129	NC_016116	TAAA	3	25405	25415	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35743304
130	NC_016116	TAT	5	25483	25496	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743304
131	NC_016116	TAT	4	25660	25671	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
132	NC_016116	TAAA	3	25735	25746	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35743304
133	NC_016116	AT	14	25820	25847	28	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	35743304
134	NC_016116	TTA	5	26334	26349	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35743305
135	NC_016116	AT	6	26355	26365	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35743305
136	NC_016116	AATT	3	26407	26418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743305
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140	NC_016116	TAT	4	27359	27369	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
141	NC_016116	AT	6	27542	27553	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35743305
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144	NC_016116	AATAT	3	28148	28162	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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154	NC_016116	TA	6	29309	29320	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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240	NC_016116	A	12	47844	47855	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	35743306
241	NC_016116	TTA	7	48128	48148	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743306
242	NC_016116	AT	9	48310	48327	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
243	NC_016116	AAATAT	6	48310	48345	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
244	NC_016116	AT	12	48473	48494	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida galli mitochondrion