ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida galli mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016116	ATA	4	5	16	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016116	TTA	4	113	123	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016116	ATA	4	756	767	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016116	ATA	4	2179	2190	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016116	TAA	4	3274	3285	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016116	TAT	4	4065	4076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016116	TAT	4	5951	5962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743303
8	NC_016116	ATT	4	7618	7629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743303
9	NC_016116	TTC	4	7739	7750	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743303
10	NC_016116	CTC	4	8128	8138	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016116	TTA	4	8255	8265	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016116	TAA	4	8690	8700	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016116	TAT	4	10143	10153	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016116	AAT	4	10167	10179	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016116	ATA	5	10454	10467	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016116	ATA	6	10640	10656	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743304
17	NC_016116	ATA	4	10727	10737	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
18	NC_016116	ATA	4	11021	11031	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
19	NC_016116	ATA	7	11378	11398	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	35743304
20	NC_016116	TCT	4	12569	12580	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35743304
21	NC_016116	TTA	4	13073	13084	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
22	NC_016116	ATA	4	13082	13094	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743304
23	NC_016116	TAA	4	13095	13106	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
24	NC_016116	ATT	4	13399	13410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
25	NC_016116	TAA	4	13635	13646	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35743304
26	NC_016116	TTA	4	14810	14821	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743304
27	NC_016116	ATA	4	15093	15104	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
28	NC_016116	TAT	4	15702	15712	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743304
29	NC_016116	TAA	4	15805	15816	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
30	NC_016116	ATA	4	16118	16129	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
31	NC_016116	AAT	4	16234	16245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
32	NC_016116	TAA	4	16282	16292	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
33	NC_016116	TAA	4	16428	16439	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
34	NC_016116	TAA	4	16808	16819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
35	NC_016116	ATA	5	17049	17064	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743304
36	NC_016116	TAA	4	17161	17171	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
37	NC_016116	ATA	4	17446	17456	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
38	NC_016116	TAT	4	19697	19707	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743304
39	NC_016116	AAT	4	19731	19741	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743304
40	NC_016116	AGG	4	20090	20101	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35743304
41	NC_016116	TAA	4	21436	21447	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
42	NC_016116	TTA	4	21642	21653	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
43	NC_016116	TTC	4	22723	22734	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016116	TAT	4	22974	22985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016116	TAT	5	24624	24637	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743304
46	NC_016116	TAA	4	25334	25345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743304
47	NC_016116	TAT	5	25483	25496	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743304
48	NC_016116	TAT	4	25660	25671	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743304
49	NC_016116	TTA	5	26334	26349	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35743305
50	NC_016116	TTA	4	26497	26507	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
51	NC_016116	TTA	4	26605	26615	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
52	NC_016116	TAT	4	27359	27369	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
53	NC_016116	ATA	4	28175	28185	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016116	TAA	5	28315	28328	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016116	TTA	4	28908	28918	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
56	NC_016116	ATA	6	29045	29061	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_016116	AAT	4	29072	29084	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016116	TAT	5	29115	29129	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016116	TAA	4	29263	29274	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016116	TAA	6	29517	29533	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35743305
61	NC_016116	AAT	5	29692	29706	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743305
62	NC_016116	TAT	4	30760	30772	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016116	TAA	5	30935	30949	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016116	TAA	4	30971	30982	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016116	ATT	4	31423	31435	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743305
66	NC_016116	TAA	4	31787	31798	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
67	NC_016116	TAA	4	31852	31864	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743305
68	NC_016116	AAT	5	32028	32042	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743305
69	NC_016116	TAA	4	32150	32161	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
70	NC_016116	ATA	4	32239	32250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
71	NC_016116	ATA	4	32307	32318	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
72	NC_016116	TAA	4	32354	32364	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743305
73	NC_016116	AAT	4	33134	33146	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016116	TAA	5	33286	33300	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016116	TAT	4	33588	33600	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743305
76	NC_016116	TAT	4	33616	33626	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
77	NC_016116	TTA	4	34474	34485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743305
78	NC_016116	TAA	4	34646	34657	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
79	NC_016116	TAT	5	34672	34686	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35743305
80	NC_016116	CTA	4	34805	34816	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35743305
81	NC_016116	ATA	5	35921	35935	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743305
82	NC_016116	ATT	4	36105	36116	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743305
83	NC_016116	ATA	4	36151	36161	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743305
84	NC_016116	TAA	4	37506	37517	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
85	NC_016116	ATT	6	38064	38084	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
86	NC_016116	ATA	5	39152	39167	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35743305
87	NC_016116	ATT	4	39187	39197	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
88	NC_016116	ATA	4	39270	39281	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
89	NC_016116	TAT	4	39634	39646	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35743305
90	NC_016116	ATA	4	44031	44043	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743305
91	NC_016116	ATT	4	44044	44055	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743305
92	NC_016116	TAT	4	44217	44227	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743305
93	NC_016116	ATA	4	44336	44347	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743305
94	NC_016116	TAA	4	44660	44672	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35743305
95	NC_016116	TAG	4	44820	44831	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35743305
96	NC_016116	ATT	6	45681	45699	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35743305
97	NC_016116	TTA	4	46320	46331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743305
98	NC_016116	ATT	4	46588	46599	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743306
99	NC_016116	TAA	4	46679	46689	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35743306
100	NC_016116	TTA	4	46986	46997	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35743306
101	NC_016116	TTA	5	47309	47323	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35743306
102	NC_016116	ATA	4	47685	47696	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35743306
103	NC_016116	TTA	7	48128	48148	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35743306

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida galli mitochondrion