ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Picea morrisonicola chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016069	GCT	4	457	468	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35335180
2	NC_016069	GTA	4	2053	2063	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35335180
3	NC_016069	ATTG	3	4148	4158	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35335180
4	NC_016069	ATGAAG	3	5667	5684	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	35335180
5	NC_016069	ATGGAT	3	7350	7367	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	35335180
6	NC_016069	A	13	8382	8394	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016069	GGA	4	8577	8587	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016069	AT	6	9350	9361	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016069	CTTT	4	11221	11236	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	35335184
10	NC_016069	TAC	4	11711	11722	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35335184
11	NC_016069	AT	8	12385	12402	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35335184
12	NC_016069	GTA	4	14023	14033	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35335184
13	NC_016069	AATG	3	14515	14526	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	35335184
14	NC_016069	CTT	4	15294	15305	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35335184
15	NC_016069	AAG	4	18020	18031	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35335184
16	NC_016069	CAAA	3	19056	19067	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	35335184
17	NC_016069	AGAA	5	19177	19197	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35335184
18	NC_016069	T	13	21149	21161	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35335184
19	NC_016069	AGAA	3	21168	21178	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35335184
20	NC_016069	CATT	3	21186	21197	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	35335184
21	NC_016069	TGT	6	21414	21431	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	35335184
22	NC_016069	GAA	4	22140	22152	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	35335184
23	NC_016069	TTC	4	22504	22518	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	35335184
24	NC_016069	TCTA	3	24320	24331	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	35335184
25	NC_016069	ATA	4	24762	24772	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35335184
26	NC_016069	TCT	4	26314	26325	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35335184
27	NC_016069	TTTCAT	4	26703	26726	24	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	4 %	35335184
28	NC_016069	ATC	4	26806	26817	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35335184
29	NC_016069	ATG	4	27588	27599	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35335184
30	NC_016069	AT	6	27805	27815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35335184
31	NC_016069	TAA	5	30376	30390	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35335184
32	NC_016069	ATTAG	3	31005	31020	16	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	35335184
33	NC_016069	TC	6	31090	31100	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35335184
34	NC_016069	GGTT	3	31730	31742	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	35335184
35	NC_016069	CTAC	3	33358	33369	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	35335184
36	NC_016069	GGAT	3	36835	36846	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	35335184
37	NC_016069	AGT	4	39374	39384	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35335184
38	NC_016069	GA	6	40330	40340	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	35335184
39	NC_016069	GGAT	3	40639	40649	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	35335184
40	NC_016069	GAAA	3	42196	42207	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35335184
41	NC_016069	GGA	4	42398	42409	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35335184
42	NC_016069	A	16	43347	43362	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	35335184
43	NC_016069	GA	6	43364	43375	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	35335184
44	NC_016069	ATACC	3	43511	43524	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	35335184
45	NC_016069	CTCCC	3	43954	43968	15	0 %	20 %	0 %	80 %	6 %	35335184
46	NC_016069	AGG	4	44017	44027	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35335184
47	NC_016069	AT	7	44131	44143	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35335184
48	NC_016069	TCT	4	44832	44844	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35335184
49	NC_016069	ATT	5	45705	45719	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35335184
50	NC_016069	ATG	4	46392	46402	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35335184
51	NC_016069	TCC	4	47761	47771	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	35335184
52	NC_016069	AATG	3	47885	47896	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	35335184
53	NC_016069	GCA	4	48290	48301	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35335184
54	NC_016069	TA	7	49795	49808	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35335184
55	NC_016069	A	14	49858	49871	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35335184
56	NC_016069	CCAT	3	49872	49883	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	35335184
57	NC_016069	A	15	51340	51354	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	35335184
58	NC_016069	TTCC	3	52085	52096	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	35335184
59	NC_016069	GAAA	3	53794	53804	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35335184
60	NC_016069	ATTG	3	56602	56613	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	35335184
61	NC_016069	C	12	56679	56690	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	35335184
62	NC_016069	CCAT	3	57115	57125	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	35335184
63	NC_016069	ACAAT	3	57148	57161	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	35335184
64	NC_016069	A	16	58059	58074	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	35335184
65	NC_016069	AG	7	58849	58861	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	35335184
66	NC_016069	A	14	59613	59626	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	35335184
67	NC_016069	A	13	61364	61376	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35335184
68	NC_016069	AATT	3	61690	61702	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35335184
69	NC_016069	AACT	3	61869	61879	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	35335184
70	NC_016069	ACGA	3	62138	62148	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	35335184
71	NC_016069	AGAA	3	63079	63089	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35335184
72	NC_016069	TA	6	63756	63766	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35335184
73	NC_016069	GAATT	3	64487	64500	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	35335184
74	NC_016069	GAAA	3	65329	65341	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	35335184
75	NC_016069	AATT	3	66649	66659	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35335184
76	NC_016069	T	13	68658	68670	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35335184
77	NC_016069	AGAT	3	68764	68774	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	35335184
78	NC_016069	AATG	3	69146	69157	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	35335184
79	NC_016069	TCAT	3	69178	69189	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	35335184
80	NC_016069	TCCATC	3	69932	69950	19	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	10 %	35335184
81	NC_016069	T	16	70948	70963	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35335184
82	NC_016069	TTTA	3	71459	71470	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35335184
83	NC_016069	GAA	4	71557	71567	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35335184
84	NC_016069	AGA	4	71571	71581	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35335184
85	NC_016069	A	16	72847	72862	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	35335184
86	NC_016069	GTT	4	74464	74474	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	35335184
87	NC_016069	GTA	4	74783	74794	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016069	TGGAT	3	77389	77402	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016069	AAT	4	78422	78433	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016069	AGA	4	78757	78767	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016069	A	12	78851	78862	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016069	TCAA	3	79632	79643	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016069	TAA	4	79752	79763	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016069	TTGT	3	81266	81277	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35335185
95	NC_016069	TCAG	3	83139	83151	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016069	ATATGA	4	83348	83371	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016069	AT	7	83449	83462	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016069	AT	12	83947	83970	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016069	TTA	4	83996	84007	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016069	AT	8	85666	85681	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016069	AT	6	85684	85695	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016069	GATA	3	85713	85724	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016069	TA	9	87958	87975	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_016069	GGA	4	88596	88607	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35335185
105	NC_016069	TTCGA	3	90437	90451	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016069	TA	6	90921	90932	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016069	A	13	91110	91122	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016069	CTTC	3	91350	91361	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016069	T	14	91489	91502	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016069	AATA	3	92226	92238	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016069	ATA	4	92872	92882	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016069	GAAA	3	93352	93362	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016069	TC	6	94533	94543	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016069	TCT	4	94896	94907	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016069	TTCT	4	95191	95205	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016069	TGAAA	3	95255	95269	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016069	TC	6	95480	95491	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016069	AT	7	96295	96308	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016069	TTAA	3	96556	96567	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016069	GGAT	3	98890	98900	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016069	T	15	99197	99211	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016069	GAA	4	99982	99993	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35335186
123	NC_016069	GGGAGG	3	99995	100013	19	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	10 %	35335186
124	NC_016069	AAC	4	102625	102636	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35335186
125	NC_016069	AT	9	103614	103631	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35335186
126	NC_016069	T	16	103629	103644	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35335186
127	NC_016069	ATG	4	105058	105068	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35335186
128	NC_016069	AT	6	105262	105272	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35335186
129	NC_016069	CGTA	3	106151	106161	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	35335186
130	NC_016069	TAA	4	110069	110080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016069	ATATGG	3	110322	110339	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	35335186
132	NC_016069	TCCTT	3	112358	112372	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	35335187
133	NC_016069	AAAT	3	112427	112439	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35335187
134	NC_016069	TC	7	115409	115421	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016069	CTAT	3	115584	115596	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016069	ATAG	4	115597	115611	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016069	T	19	115837	115855	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
138	NC_016069	TTCTC	4	115913	115932	20	0 %	60 %	0 %	40 %	5 %	Non-Coding
139	NC_016069	TTC	4	116852	116862	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016069	TCT	4	116880	116891	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016069	TGAAA	3	117058	117072	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
142	NC_016069	TC	6	117282	117293	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016069	CTT	4	117678	117689	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016069	CTTT	3	118623	118633	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016069	TCAT	3	120887	120898	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016069	ATAG	3	121804	121814	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016069	AAAT	3	122676	122686	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35335187
148	NC_016069	TTC	4	122908	122919	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35335187
149	NC_016069	GAT	4	123119	123129	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35335187
150	NC_016069	GATC	3	123134	123146	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	35335187
151	NC_016069	TATT	3	123845	123856	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Picea morrisonicola chloroplast