ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phalera flavescens mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016067	TTTAT	3	129	143	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016067	AATT	4	210	225	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016067	T	17	290	306	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35100017
4	NC_016067	ATT	5	713	727	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35100017
5	NC_016067	TTTATT	3	855	872	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	35100017
6	NC_016067	AATT	5	967	986	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35100017
7	NC_016067	ATT	4	1037	1049	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35100017
8	NC_016067	TAA	4	1053	1065	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35100017
9	NC_016067	TTAA	3	1205	1215	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100017
10	NC_016067	T	12	1258	1269	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	35100017
11	NC_016067	ATT	4	1368	1378	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016067	TATAA	3	1772	1785	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35100016
13	NC_016067	CTTTA	3	2929	2942	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	35100016
14	NC_016067	TCT	4	2945	2957	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35100016
15	NC_016067	TTACT	3	3338	3351	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	35100017
16	NC_016067	AATT	3	3757	3767	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100017
17	NC_016067	TAT	5	3980	3994	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35100017
18	NC_016067	ATT	4	4012	4022	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100017
19	NC_016067	A	17	4062	4078	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	35100017
20	NC_016067	TTAA	3	4143	4154	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35100017
21	NC_016067	T	15	5036	5050	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35100017
22	NC_016067	TAT	4	5684	5694	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100017
23	NC_016067	TAT	4	5906	5917	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100017
24	NC_016067	AATT	6	5958	5979	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100017
25	NC_016067	TCTTAT	3	6264	6280	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
26	NC_016067	TAAA	3	6499	6510	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35100017
27	NC_016067	ATT	4	6564	6575	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100017
28	NC_016067	ATT	4	6801	6812	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100017
29	NC_016067	TTA	4	7324	7335	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100017
30	NC_016067	ATA	7	7429	7449	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35100017
31	NC_016067	AATT	3	7463	7474	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35100017
32	NC_016067	ATT	4	7632	7643	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100017
33	NC_016067	TAAAA	3	8134	8148	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	35100017
34	NC_016067	AAAG	3	8150	8161	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35100017
35	NC_016067	ATC	4	8552	8563	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35100017
36	NC_016067	TAA	4	9212	9224	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35100017
37	NC_016067	AATA	3	9304	9315	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35100017
38	NC_016067	AT	6	9437	9447	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100017
39	NC_016067	TATTAA	3	9501	9518	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35100017
40	NC_016067	ATT	4	9568	9579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35100017
41	NC_016067	TTA	4	9587	9598	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100017
42	NC_016067	TA	28	9600	9652	53	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100017
43	NC_016067	TTA	4	9650	9661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100017
44	NC_016067	AT	9	9769	9785	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35100017
45	NC_016067	TAA	4	9913	9924	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100017
46	NC_016067	ATT	4	10139	10149	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100016
47	NC_016067	ATTTT	4	10243	10262	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	35100016
48	NC_016067	ATT	5	10279	10293	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35100016
49	NC_016067	T	14	10353	10366	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35100016
50	NC_016067	TAAAT	3	10583	10597	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	35100016
51	NC_016067	AAT	4	10649	10660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100018
52	NC_016067	TA	6	10768	10778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100018
53	NC_016067	T	14	10876	10889	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35100018
54	NC_016067	ATTT	3	11170	11180	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35100018
55	NC_016067	ATT	5	11309	11322	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35100018
56	NC_016067	TAA	4	11598	11609	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100018
57	NC_016067	TTA	4	11650	11660	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100018
58	NC_016067	AAAT	3	11983	11993	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35100017
59	NC_016067	TAAA	3	12032	12044	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35100017
60	NC_016067	TAAA	3	12230	12241	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35100017
61	NC_016067	ATA	4	12257	12268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100017
62	NC_016067	TA	6	12758	12769	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35100017
63	NC_016067	TA	6	12786	12796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016067	TTTA	3	12803	12814	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016067	TTAATT	3	12864	12881	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_016067	T	14	13097	13110	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016067	TTTTAA	3	13252	13269	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_016067	TTTTA	3	13327	13341	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016067	TTTTA	3	13570	13584	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016067	AAATTT	3	13862	13880	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
71	NC_016067	AATT	3	14224	14235	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016067	AAATT	3	14417	14431	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016067	ATTA	3	14859	14870	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016067	ATTA	3	15085	15096	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016067	T	16	15140	15155	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016067	T	18	15335	15352	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_016067	T	14	15425	15438	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016067	AT	8	15497	15511	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016067	TTTA	4	15513	15528	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016067	AT	6	15574	15587	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016067	TA	7	15588	15600	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016067	AATT	5	15603	15622	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

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