ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Taiwania cryptomerioides chloroplast DNA

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016065	GCT	4	602	613	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35295104
2	NC_016065	ATC	4	1862	1872	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35295104
3	NC_016065	AAG	4	2076	2087	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35295104
4	NC_016065	ATG	4	2950	2961	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35295104
5	NC_016065	ATA	4	4259	4270	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016065	TTA	4	7707	7717	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016065	CAT	4	12715	12725	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35295104
8	NC_016065	ATT	4	18442	18452	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016065	CTG	4	18534	18545	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35295105
10	NC_016065	ATC	4	20984	20996	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016065	ATT	4	21855	21866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016065	TAA	4	22201	22211	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016065	TAT	4	22458	22469	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016065	TAT	4	22963	22973	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016065	TTA	4	24795	24805	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016065	TAT	4	24872	24882	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016065	ATT	4	25838	25848	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35295105
18	NC_016065	AAC	4	28619	28630	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35295105
19	NC_016065	CAA	4	31102	31113	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35295105
20	NC_016065	ATT	4	35596	35606	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016065	TAA	4	36556	36567	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016065	CTG	4	37087	37098	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35295106
23	NC_016065	AAC	4	38234	38245	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35295106
24	NC_016065	TTA	4	41912	41923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016065	TAA	4	46460	46470	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35295106
26	NC_016065	CAG	4	47627	47638	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35295106
27	NC_016065	AAT	4	48509	48519	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35295107
28	NC_016065	GAA	4	49443	49453	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016065	AGA	4	53438	53449	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35295107
30	NC_016065	TTA	4	54226	54237	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016065	ATT	4	56633	56645	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35295107
32	NC_016065	GTG	4	57381	57392	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016065	ATG	4	62809	62819	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016065	CTT	4	62916	62928	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016065	ATT	4	63227	63238	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016065	ATT	4	66898	66909	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016065	ATT	4	67770	67780	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016065	TAA	6	68194	68211	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_016065	GTA	4	68536	68547	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35295111
40	NC_016065	TAA	4	72995	73006	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35295111
41	NC_016065	TAT	4	73004	73014	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35295111
42	NC_016065	ATA	5	73058	73071	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35295111
43	NC_016065	AGA	4	74255	74266	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35295111
44	NC_016065	AGA	4	77084	77094	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35295111
45	NC_016065	AAT	4	79227	79237	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35295111
46	NC_016065	AGA	4	79769	79780	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35295111
47	NC_016065	TAA	4	80874	80885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35295111
48	NC_016065	TTG	4	81197	81208	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35295111
49	NC_016065	AGA	4	83633	83643	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35295111
50	NC_016065	AGA	8	84716	84738	23	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35295111
51	NC_016065	ATT	4	87514	87526	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35295111
52	NC_016065	AAT	4	89358	89369	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35295111
53	NC_016065	TTA	4	91021	91032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35295111
54	NC_016065	ATT	4	96184	96195	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35295111
55	NC_016065	CTT	4	98280	98291	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35295111
56	NC_016065	CTT	4	103498	103508	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35295111
57	NC_016065	AAT	6	107554	107570	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35295111
58	NC_016065	ATA	4	109508	109519	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35295111
59	NC_016065	TCT	4	114094	114105	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35295111
60	NC_016065	ACC	4	115103	115114	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016065	TCT	4	118185	118196	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35295111
62	NC_016065	GCT	4	121923	121934	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35295111
63	NC_016065	TTC	4	124304	124315	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	35295111
64	NC_016065	AAT	4	124369	124383	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016065	AAG	4	127470	127481	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35295112
66	NC_016065	ATT	4	128292	128304	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Taiwania cryptomerioides chloroplast DNA