ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Spindasis takanonis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016018	AT	6	42	53	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016018	TTTAT	3	125	139	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016018	TTTTA	3	280	293	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	34760036
4	NC_016018	TAT	5	653	666	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760036
5	NC_016018	TATAAT	3	860	877	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34760036
6	NC_016018	ATT	4	1020	1032	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760036
7	NC_016018	TAT	4	1052	1062	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34760036
8	NC_016018	ATTTTA	3	1128	1146	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	34760036
9	NC_016018	ATTT	3	1180	1191	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	34760036
10	NC_016018	TAT	4	1951	1962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35352314
11	NC_016018	ATT	5	2026	2040	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35352314
12	NC_016018	GGA	4	2120	2130	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35352314
13	NC_016018	ATTT	4	2479	2494	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35352314
14	NC_016018	TAA	5	2847	2861	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35352314
15	NC_016018	ATT	4	3303	3313	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34760036
16	NC_016018	TAA	4	3435	3446	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760036
17	NC_016018	ATA	4	3487	3499	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34760036
18	NC_016018	AATT	3	3717	3727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34760036
19	NC_016018	TA	12	3802	3824	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016018	ATA	4	3871	3882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016018	T	12	3918	3929	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	34760036
22	NC_016018	TATTTT	3	3937	3954	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	34760036
23	NC_016018	ATT	4	3969	3979	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34760036
24	NC_016018	AATT	3	4230	4241	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34760037
25	NC_016018	T	15	4993	5007	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	34760037
26	NC_016018	TTG	4	5452	5463	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34760037
27	NC_016018	TATTTA	3	5509	5527	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_016018	ATT	5	5803	5816	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760037
29	NC_016018	ATTT	3	6014	6026	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016018	AAAT	4	6249	6265	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_016018	ATT	4	6369	6380	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34760037
32	NC_016018	TAAA	3	6394	6405	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	34760037
33	NC_016018	ATAAAA	3	6425	6443	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	34760037
34	NC_016018	AATT	3	6539	6550	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34760037
35	NC_016018	CTTAT	3	6645	6658	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	34760037
36	NC_016018	ATA	7	6786	6806	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34760037
37	NC_016018	AT	6	6926	6936	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34760037
38	NC_016018	AATTAT	3	6955	6973	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	34760037
39	NC_016018	ATT	4	7106	7118	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760037
40	NC_016018	ATA	5	7324	7338	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34760037
41	NC_016018	AATAA	3	7794	7809	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	34760037
42	NC_016018	ATAAA	3	8028	8042	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	34760037
43	NC_016018	TTAAT	3	8162	8176	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016018	TTTCT	7	8197	8231	35	0 %	80 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016018	ATA	4	8519	8530	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760037
46	NC_016018	TAAA	3	9018	9030	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	34760037
47	NC_016018	AAAT	3	9138	9148	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34760037
48	NC_016018	AAAAAT	4	9226	9248	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	34760037
49	NC_016018	TA	7	9267	9279	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34760037
50	NC_016018	ATTAA	4	9562	9582	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	34760037
51	NC_016018	AT	7	9682	9696	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34760037
52	NC_016018	ATTAT	3	9840	9853	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	34760037
53	NC_016018	ATTTT	4	10149	10168	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	34760037
54	NC_016018	TAT	5	10284	10297	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760037
55	NC_016018	TTA	4	10318	10329	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34760037
56	NC_016018	AAT	4	10396	10407	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760037
57	NC_016018	ATA	4	10421	10432	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760037
58	NC_016018	ATTA	3	10433	10444	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34760037
59	NC_016018	AAT	5	10446	10460	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34760037
60	NC_016018	TTAT	4	10457	10472	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	34760037
61	NC_016018	T	14	10811	10824	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34760037
62	NC_016018	ATT	4	10896	10909	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760037
63	NC_016018	TTA	4	11107	11117	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34760037
64	NC_016018	TAA	5	11116	11130	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34760037
65	NC_016018	TAT	4	11243	11254	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34760037
66	NC_016018	AAT	4	11252	11263	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760037
67	NC_016018	ATT	5	11729	11742	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016018	TA	6	11766	11776	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016018	A	12	12170	12181	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	34760037
70	NC_016018	A	15	12199	12213	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	34760037
71	NC_016018	TAAAA	3	12383	12396	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	34760037
72	NC_016018	AAT	4	12689	12700	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760037
73	NC_016018	TA	6	12751	12761	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016018	AATTA	3	12827	12841	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016018	TAT	5	12872	12885	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016018	T	14	13015	13028	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016018	TTTA	3	13491	13501	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016018	ATTT	3	13517	13528	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016018	ATTAA	3	13590	13604	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016018	TA	6	13766	13777	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016018	ATTA	5	13872	13892	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016018	AAATT	3	14311	14325	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016018	TAT	4	14889	14900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016018	T	24	15010	15033	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016018	TA	6	15214	15226	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016018	ATTA	5	15229	15249	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016018	AT	8	15254	15269	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016018	ATAA	5	15327	15346	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

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