ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Stenopirates sp. HL-2011 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016017	ATA	4	225	236	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
2	NC_016017	ATA	4	331	345	15	66.67 %	33.33 %	6 %	34760036
3	NC_016017	AAT	4	359	370	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
4	NC_016017	TAT	4	431	443	13	33.33 %	66.67 %	7 %	34760036
5	NC_016017	AAT	4	444	455	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
6	NC_016017	TAA	4	529	540	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
7	NC_016017	ATT	4	594	604	11	33.33 %	66.67 %	9 %	34760036
8	NC_016017	TAT	4	812	823	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
9	NC_016017	TAA	4	1162	1173	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
10	NC_016017	ATT	4	1704	1716	13	33.33 %	66.67 %	7 %	34760036
11	NC_016017	TAT	5	1952	1966	15	33.33 %	66.67 %	6 %	34760036
12	NC_016017	ATA	4	2800	2811	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
13	NC_016017	TAA	5	3092	3106	15	66.67 %	33.33 %	6 %	34760036
14	NC_016017	AAT	4	4052	4062	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036
15	NC_016017	TAA	4	4279	4289	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036
16	NC_016017	ATA	4	5260	5270	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036
17	NC_016017	ATT	5	5651	5665	15	33.33 %	66.67 %	0 %	34760036
18	NC_016017	TTA	4	5721	5732	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
19	NC_016017	TAA	4	6181	6191	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036
20	NC_016017	ATT	4	6220	6230	11	33.33 %	66.67 %	9 %	34760036
21	NC_016017	TAA	4	7003	7013	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036
22	NC_016017	TTA	4	7014	7025	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
23	NC_016017	TAA	5	7306	7319	14	66.67 %	33.33 %	7 %	34760036
24	NC_016017	ATA	4	7398	7408	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036
25	NC_016017	ATT	4	7901	7911	11	33.33 %	66.67 %	9 %	34760036
26	NC_016017	ATA	4	7992	8003	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
27	NC_016017	ATT	4	9563	9573	11	33.33 %	66.67 %	9 %	34760036
28	NC_016017	TAA	5	10149	10163	15	66.67 %	33.33 %	6 %	34760036
29	NC_016017	AAT	4	10273	10284	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
30	NC_016017	TAA	4	10501	10512	12	66.67 %	33.33 %	8 %	34760036
31	NC_016017	TAT	4	10903	10914	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
32	NC_016017	TAT	4	10982	10993	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
33	NC_016017	TAT	4	11097	11108	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
34	NC_016017	TAT	4	11177	11188	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
35	NC_016017	TAT	4	11291	11302	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
36	NC_016017	TAT	4	11371	11382	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
37	NC_016017	ATT	4	12457	12467	11	33.33 %	66.67 %	9 %	34760036
38	NC_016017	TAT	4	12563	12574	12	33.33 %	66.67 %	8 %	34760036
39	NC_016017	TAT	4	12663	12673	11	33.33 %	66.67 %	9 %	34760036
40	NC_016017	ATA	4	12827	12837	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036
41	NC_016017	ATA	4	14307	14319	13	66.67 %	33.33 %	7 %	34760036
42	NC_016017	TAA	5	14350	14364	15	66.67 %	33.33 %	6 %	34760036
43	NC_016017	ATA	4	14892	14902	11	66.67 %	33.33 %	9 %	34760036

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Stenopirates sp. HL-2011 mitochondrion