ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Protantigius superans mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016016	TAAA	3	65	77	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016016	TTTTTA	4	284	307	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	34760033
3	NC_016016	ATT	4	1030	1042	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760033
4	NC_016016	TAT	7	2031	2051	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35352313
5	NC_016016	GGA	4	2123	2133	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35352313
6	NC_016016	GAAA	3	2241	2252	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35352313
7	NC_016016	ATTT	4	2482	2497	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35352313
8	NC_016016	ATA	4	3491	3503	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34760034
9	NC_016016	AATT	3	3721	3731	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34760034
10	NC_016016	TTTC	3	3920	3930	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34760034
11	NC_016016	TTAA	3	4102	4113	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34760034
12	NC_016016	ATT	4	4186	4196	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34760034
13	NC_016016	ATTA	3	4713	4724	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	34760034
14	NC_016016	ATC	4	4735	4746	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34760034
15	NC_016016	TAT	4	4871	4884	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760034
16	NC_016016	T	15	4999	5013	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	34760034
17	NC_016016	CAAA	3	5199	5211	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	34760034
18	NC_016016	ATA	4	5392	5403	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760034
19	NC_016016	TATTTA	3	5526	5544	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_016016	TAT	5	5881	5894	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760034
21	NC_016016	TTA	4	6031	6042	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016016	TATTAA	4	6382	6405	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34760034
23	NC_016016	TAAA	3	6423	6434	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	34760034
24	NC_016016	ATT	4	6827	6838	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34760034
25	NC_016016	AATTAT	3	6885	6903	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	34760034
26	NC_016016	AAAT	3	6969	6980	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34760034
27	NC_016016	TAAA	3	7173	7183	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34760034
28	NC_016016	TTA	4	7248	7259	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34760034
29	NC_016016	ATA	5	7353	7367	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34760034
30	NC_016016	TAAT	3	7386	7396	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34760034
31	NC_016016	AAT	4	7537	7548	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760034
32	NC_016016	TAA	4	7791	7803	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34760034
33	NC_016016	ATT	5	8006	8019	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34760034
34	NC_016016	AAAAAT	3	8063	8080	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	34760034
35	NC_016016	TATAA	3	8179	8194	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	34760034
36	NC_016016	TA	6	9003	9013	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34760034
37	NC_016016	AAAT	3	9084	9094	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34760034
38	NC_016016	AAAAT	3	9173	9186	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	34760034
39	NC_016016	TAA	5	9228	9241	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34760034
40	NC_016016	AT	7	9631	9643	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34760034
41	NC_016016	ATT	4	9648	9659	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34760034
42	NC_016016	ATAATT	3	9774	9791	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34760034
43	NC_016016	ATTT	4	9804	9819	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	34760034
44	NC_016016	AT	25	9812	9862	51	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016016	ATT	5	9957	9970	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016016	TATT	3	10035	10045	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34760034
47	NC_016016	TTTA	3	10177	10188	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	34760034
48	NC_016016	TAA	4	10228	10239	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760034
49	NC_016016	TATT	4	10251	10267	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	34760034
50	NC_016016	AT	6	10296	10306	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34760034
51	NC_016016	TAA	4	10363	10374	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760034
52	NC_016016	TAA	7	10416	10436	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	34760034
53	NC_016016	TTTA	4	10433	10448	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	34760034
54	NC_016016	ATT	4	10876	10886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34760034
55	NC_016016	TAT	4	11090	11101	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34760034
56	NC_016016	ATTT	3	11111	11121	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34760034
57	NC_016016	ATTT	3	11217	11227	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34760034
58	NC_016016	ATA	4	11771	11783	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34760035
59	NC_016016	ATTAA	4	12162	12181	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	34760035
60	NC_016016	TAAAA	3	12342	12355	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	34760035
61	NC_016016	TAA	4	12445	12455	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34760035
62	NC_016016	TTAT	3	12479	12490	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34760035
63	NC_016016	AAT	4	12648	12659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34760035
64	NC_016016	TAT	4	12764	12775	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016016	T	14	12965	12978	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016016	TCAT	3	13045	13056	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016016	AATT	3	13157	13167	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016016	TTTTA	3	13194	13209	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016016	TTAA	3	13343	13353	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016016	ATT	4	13475	13485	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016016	AAATT	4	13543	13563	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016016	T	13	13718	13730	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016016	AAATTT	3	13731	13748	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_016016	ATTT	4	14661	14676	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016016	TTAT	4	14735	14750	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016016	ATTT	3	14879	14889	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016016	T	24	14913	14936	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016016	TAA	4	14941	14955	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016016	ATT	4	14959	14970	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016016	TA	6	15062	15072	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016016	TA	13	15155	15181	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Protantigius superans mitochondrion