Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 3

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016006GAG418281133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
2NC_016006AGGT31071171125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016006AAG42242341166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_016006AGA42532631166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
5NC_016006GATA38388481150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
6NC_016006TC610461059140 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
7NC_016006CAAG3113011401150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
8NC_016006TCAT3117211821125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
9NC_016006TTCA3139414051225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
10NC_016006TC618991910120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
11NC_016006AATG3290729181250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
12NC_016006TTCA3361036211225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
13NC_016006GAAA3365736681275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
14NC_016006TTC437643775120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
15NC_016006TC638033814120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
16NC_016006AGA5402240351466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
17NC_016006AAGC3424942591150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
18NC_016006AG7450045121350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
19NC_016006CTTT347314741110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
20NC_016006TCT450925104130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
21NC_016006TCAT3512251331225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
22NC_016006TTCT351865197120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
23NC_016006TCT452055216120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
24NC_016006GGA4595059601133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
25NC_016006TGAGC3691069241520 %20 %40 %20 %0 %Non-Coding
26NC_016006TC669886998110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
27NC_016006AAG4825182611166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
28NC_016006AGGA3834983601250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016006TGA410285102961233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016006TCT41043110444140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
31NC_016006CTTT31135211362110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
32NC_016006CATT311375113861225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
33NC_016006AGAA311767117781275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
34NC_016006CGTAGG312366123831816.67 %16.67 %50 %16.67 %5 %Non-Coding
35NC_016006GAAA312888128981175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
36NC_016006TTTTC31353713551150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
37NC_016006AGC414325143361233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
38NC_016006TTCCT31438714401150 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
39NC_016006AGTC414406144211625 %25 %25 %25 %6 %Non-Coding
40NC_016006CTTT31522715238120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
41NC_016006GCCT41532115335150 %25 %25 %50 %6 %Non-Coding
42NC_016006CTTT31573815749120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
43NC_016006CT61688316894120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
44NC_016006GGTA317125171361225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
45NC_016006AGCGG318870188831420 %0 %60 %20 %7 %Non-Coding
46NC_016006GGGA319326193361125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding
47NC_016006TGAA421496215101550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
48NC_016006AGC421531215421233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
49NC_016006GAA422044220541166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
50NC_016006GAAT322580225911250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
51NC_016006AATCC324108241211440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
52NC_016006ATGA324188241991250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016006CT62467924689110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
54NC_016006TC62471024721120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
55NC_016006ATA425066250771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_016006TCT92577925804260 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
57NC_016006GAA426301263121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
58NC_016006CTCTT32683926852140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
59NC_016006TCT42803728048120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
60NC_016006CTTT32813228144130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
61NC_016006CTT42857628587120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
62NC_016006TCTTT42961529633190 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
63NC_016006AGA429786297961166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
64NC_016006TG62999930009110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
65NC_016006AGAC330063300731150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
66NC_016006TTC43109331104120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
67NC_016006AGA431823318331166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
68NC_016006TCGA331991320021225 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
69NC_016006GAA432005320161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
70NC_016006CTT43201832029120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
71NC_016006TCCT33233432344110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
72NC_016006AGGA332415324251150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
73NC_016006CCGAT332664326771420 %20 %20 %40 %7 %Non-Coding
74NC_016006GTC43321233223120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
75NC_016006TTGGAG333533335501816.67 %33.33 %50 %0 %5 %Non-Coding
76NC_016006CTT43384733858120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
77NC_016006CTTT33386733878120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
78NC_016006AGAA333993340041275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
79NC_016006GAA434511345221266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
80NC_016006ATTC334618346291225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
81NC_016006CTCC33497834989120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
82NC_016006GCA435153351631133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
83NC_016006GTCC33569235702110 %25 %25 %50 %9 %Non-Coding
84NC_016006TTCT33647636486110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
85NC_016006AAG537327373421666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
86NC_016006AAAG337716377281375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
87NC_016006GAAAA337784377981580 %0 %20 %0 %0 %Non-Coding
88NC_016006ATTC338180381911225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
89NC_016006CAT438728387381133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
90NC_016006A12388623887312100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
91NC_016006TC83964239656150 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
92NC_016006CTTT34049840508110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
93NC_016006ATCTCT441791418142416.67 %50 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
94NC_016006TTTC34279342804120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
95NC_016006TTATT342974429881520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
96NC_016006ATTC343178431891225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
97NC_016006CCT44320643216110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
98NC_016006AAAAG443915439352180 %0 %20 %0 %9 %Non-Coding
99NC_016006GAAA344758447681175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding