ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016005	TCCTTT	3	3003	3020	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016005	AACTTC	3	59068	59085	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
3	NC_016005	TTCCCC	3	73566	73584	19	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	34668339
4	NC_016005	CTTTCT	3	82939	82955	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
5	NC_016005	AAGAGA	3	96424	96441	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
6	NC_016005	TTTAGT	3	105550	105566	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	34668339
7	NC_016005	AGGCCT	3	123049	123067	19	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10 %	34668339
8	NC_016005	AACTCG	3	169948	169964	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	34668339
9	NC_016005	TGAAAC	3	195996	196012	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
10	NC_016005	AATGAT	3	240682	240700	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	34668339
11	NC_016005	GGATAG	3	255586	255603	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	34668339
12	NC_016005	GAAAGA	3	258727	258744	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
13	NC_016005	GCTAAG	3	272660	272676	17	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	34668339
14	NC_016005	AGTTCA	3	288960	288976	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
15	NC_016005	TTTTCT	3	308229	308247	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	34668339
16	NC_016005	GTCGGG	3	326850	326867	18	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	5 %	34668339
17	NC_016005	GGAAAG	3	336325	336342	18	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	34668339
18	NC_016005	TTCTTT	3	419394	419412	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	34668339
19	NC_016005	TTTCTT	4	433150	433174	25	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	34668339
20	NC_016005	TCTAAG	3	437391	437408	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
21	NC_016005	TCGCTC	3	448590	448606	17	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	5 %	34668339
22	NC_016005	ATAGGG	3	501714	501730	17	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	34668339
23	NC_016005	AAAGGA	3	585657	585674	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
24	NC_016005	TTGTCT	3	596918	596934	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
25	NC_016005	CTCAGT	3	633402	633420	19	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	34668339
26	NC_016005	CCTTAT	3	649138	649155	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
27	NC_016005	GAAAGA	3	715985	716002	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
28	NC_016005	CTTTCT	3	722712	722728	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
29	NC_016005	TCTTTG	3	764948	764965	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
30	NC_016005	GTGAGG	3	767973	767990	18	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	5 %	34668339
31	NC_016005	ACTTCA	3	788751	788768	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
32	NC_016005	GAAAGA	3	800080	800097	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
33	NC_016005	TGGGGT	3	810723	810739	17	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	34668339
34	NC_016005	TTGTCT	3	837025	837041	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
35	NC_016005	ATGGAA	3	905117	905133	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
36	NC_016005	TCTCTT	3	905518	905534	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
37	NC_016005	AACTCG	3	920903	920919	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	34668339
38	NC_016005	TTCAAC	3	953391	953408	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
39	NC_016005	GGAGGG	3	1020254	1020272	19	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	10 %	34668339
40	NC_016005	CTTCAC	3	1029100	1029118	19	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	34668339
41	NC_016005	TTGTCT	3	1065267	1065283	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
42	NC_016005	TACAAA	3	1108864	1108882	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	34668339
43	NC_016005	AGAGAT	3	1114044	1114061	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
44	NC_016005	TTCCTC	4	1146059	1146082	24	0 %	50 %	0 %	50 %	4 %	34668339
45	NC_016005	AGAGTC	3	1151572	1151589	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	34668339
46	NC_016005	TAGAAG	3	1175265	1175282	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
47	NC_016005	CTTTCT	3	1184230	1184246	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
48	NC_016005	TTTTCT	3	1190005	1190022	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	34668339
49	NC_016005	TCTTTG	3	1218090	1218106	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
50	NC_016005	CTTTCT	3	1254639	1254656	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
51	NC_016005	AAATGA	3	1264130	1264148	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	34668339
52	NC_016005	TTCCTC	3	1319243	1319261	19	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	34668339
53	NC_016005	TGGCAG	3	1322852	1322870	19	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10 %	34668339
54	NC_016005	CCGTGC	3	1342903	1342920	18	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	34668339
55	NC_016005	AGTGCA	3	1359366	1359384	19	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	34668339
56	NC_016005	AGCTGC	3	1360495	1360512	18	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	5 %	34668339
57	NC_016005	CTTTCT	3	1362362	1362378	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
58	NC_016005	TCTTTG	4	1371376	1371399	24	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	8 %	34668339
59	NC_016005	TCTTTG	3	1371452	1371469	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
60	NC_016005	TTCTCT	3	1376012	1376029	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
61	NC_016005	CAAAAA	3	1453644	1453661	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	34668339
62	NC_016005	TTCTTT	3	1471708	1471726	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	34668339
63	NC_016005	GCAAAG	3	1506151	1506167	17	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	34668339
64	NC_016005	AGGAAG	3	1522555	1522573	19	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016005	GGGTAA	3	1525510	1525526	17	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_016005	GAATCT	3	1541188	1541204	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	34668339
67	NC_016005	ATAGGG	3	1550618	1550634	17	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1