ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016005CCTTC31716017174150 %40 %0 %60 %6 %34668339
2NC_016005TCCGA327780277931420 %20 %20 %40 %7 %34668339
3NC_016005AAGAA335484354981580 %0 %20 %0 %0 %34668339
4NC_016005CTTTT33590435918150 %80 %0 %20 %0 %34668339
5NC_016005CCTTT34079040803140 %60 %0 %40 %7 %34668339
6NC_016005TTCTT35286752881150 %80 %0 %20 %0 %34668339
7NC_016005GATCC371559715721420 %20 %20 %40 %7 %34668339
8NC_016005AATGA391896919101560 %20 %20 %0 %0 %34668339
9NC_016005CCGCT39928999302140 %20 %20 %60 %7 %34668339
10NC_016005GACTT31279691279831520 %40 %20 %20 %0 %34668339
11NC_016005TTCTT3130290130304150 %80 %0 %20 %0 %34668339
12NC_016005AATAG31319701319831460 %20 %20 %0 %7 %34668339
13NC_016005TTCTT3135371135385150 %80 %0 %20 %0 %34668339
14NC_016005AAAGA31355051355191580 %0 %20 %0 %0 %34668339
15NC_016005CGGAG31395251395381420 %0 %60 %20 %7 %34668339
16NC_016005AAGAA31419121419261580 %0 %20 %0 %0 %34668339
17NC_016005AATAT31420841420981560 %40 %0 %0 %6 %34668339
18NC_016005AAGAA31496681496821580 %0 %20 %0 %0 %34668339
19NC_016005AAGAA31548841548981580 %0 %20 %0 %0 %34668339
20NC_016005CAAAG31592671592801460 %0 %20 %20 %7 %34668339
21NC_016005GAATA31653111653241460 %20 %20 %0 %7 %34668339
22NC_016005AGAAA31688791688941680 %0 %20 %0 %6 %34668339
23NC_016005AAGAA31806661806801580 %0 %20 %0 %6 %34668339
24NC_016005CGAGA31943821943961540 %0 %40 %20 %6 %34668339
25NC_016005AGCGG31985011985151520 %0 %60 %20 %6 %34668339
26NC_016005TTCTT3203077203091150 %80 %0 %20 %0 %34668339
27NC_016005GCGAA32331652331791540 %0 %40 %20 %6 %34668339
28NC_016005CGAAG32538962539091440 %0 %40 %20 %7 %34668339
29NC_016005AAGAA32693852693991580 %0 %20 %0 %0 %34668339
30NC_016005AAGAA32776992777131580 %0 %20 %0 %0 %34668339
31NC_016005TATAT42891802891992040 %60 %0 %0 %0 %34668339
32NC_016005GAAAA42983622983812080 %0 %20 %0 %5 %34668339
33NC_016005AGATC33020283020411440 %20 %20 %20 %7 %34668339
34NC_016005TCCGC3304289304303150 %20 %20 %60 %6 %34668339
35NC_016005TAGGG33057373057501420 %20 %60 %0 %7 %34668339
36NC_016005GAGAA33072513072641460 %0 %40 %0 %7 %34668339
37NC_016005CTTTT3322681322695150 %80 %0 %20 %6 %34668339
38NC_016005AAAGA33235053235191580 %0 %20 %0 %0 %34668339
39NC_016005AAAGG33331133331261460 %0 %40 %0 %7 %34668339
40NC_016005TAAGA33334393334521460 %20 %20 %0 %7 %34668339
41NC_016005TAGGG33414993415121420 %20 %60 %0 %7 %34668339
42NC_016005CAAAG33451133451261460 %0 %20 %20 %7 %34668339
43NC_016005CCTTT3359070359084150 %60 %0 %40 %6 %34668339
44NC_016005TCCTC3363966363980150 %40 %0 %60 %6 %34668339
45NC_016005AAGAA33830543830671480 %0 %20 %0 %7 %34668339
46NC_016005GCTTT3399471399484140 %60 %20 %20 %7 %34668339
47NC_016005TTCTT3408098408112150 %80 %0 %20 %0 %34668339
48NC_016005CTGAT34125494125621420 %40 %20 %20 %7 %34668339
49NC_016005AAGGA34328984329111460 %0 %40 %0 %7 %34668339
50NC_016005GAATA34553204553331460 %20 %20 %0 %7 %34668339
51NC_016005ATCCC34581034581161420 %20 %0 %60 %7 %34668339
52NC_016005TGCTT3532208532221140 %60 %20 %20 %7 %34668339
53NC_016005GAATA35426065426191460 %20 %20 %0 %7 %34668339
54NC_016005TGATT35436185436311420 %60 %20 %0 %7 %34668339
55NC_016005TTCTT3545925545939150 %80 %0 %20 %0 %34668339
56NC_016005AAGAT35463265463391460 %20 %20 %0 %7 %34668339
57NC_016005AAGAA35652865653001580 %0 %20 %0 %6 %34668339
58NC_016005TCTTG4580103580121190 %60 %20 %20 %10 %34668339
59NC_016005CTTTG3581529581544160 %60 %20 %20 %6 %34668339
60NC_016005CCTTA35888355888491520 %40 %0 %40 %6 %34668339
61NC_016005AAAGG35968335968471560 %0 %40 %0 %0 %34668339
62NC_016005TAAAA36008226008351480 %20 %0 %0 %7 %34668339
63NC_016005AAAGC36227006227131460 %0 %20 %20 %7 %34668339
64NC_016005AAGAA36231026231161580 %0 %20 %0 %0 %34668339
65NC_016005AAAAC36234776234911580 %0 %0 %20 %6 %34668339
66NC_016005AAAGA36238006238141580 %0 %20 %0 %0 %34668339
67NC_016005GCTCC3625673625688160 %20 %20 %60 %6 %34668339
68NC_016005GCTTT3629798629811140 %60 %20 %20 %7 %34668339
69NC_016005AAGGA36337336337471560 %0 %40 %0 %6 %34668339
70NC_016005GAAGA36355796355921460 %0 %40 %0 %7 %34668339
71NC_016005AAGAA36434696434831580 %0 %20 %0 %6 %34668339
72NC_016005AAGAA36560136560261480 %0 %20 %0 %7 %34668339
73NC_016005TCTCT3664753664766140 %60 %0 %40 %7 %34668339
74NC_016005AAGAA36659066659201580 %0 %20 %0 %0 %34668339
75NC_016005CCTCT3679441679455150 %40 %0 %60 %6 %34668339
76NC_016005CTTTT3680936680949140 %80 %0 %20 %7 %34668339
77NC_016005AGAGC36840336840461440 %0 %40 %20 %7 %34668339
78NC_016005GAGAA36840586840721560 %0 %40 %0 %6 %34668339
79NC_016005TAAGA36871636871771560 %20 %20 %0 %6 %34668339
80NC_016005CTTTT3703056703070150 %80 %0 %20 %6 %34668339
81NC_016005AAGAA37179297179431580 %0 %20 %0 %0 %34668339
82NC_016005AGAGG37203367203491440 %0 %60 %0 %7 %34668339
83NC_016005AGCGA37219327219461540 %0 %40 %20 %0 %34668339
84NC_016005CTTTT4724091724110200 %80 %0 %20 %10 %34668339
85NC_016005TTACC37371717371861620 %40 %0 %40 %6 %34668339
86NC_016005GAGAG47472927473101940 %0 %60 %0 %10 %34668339
87NC_016005TCTTT3789646789660150 %80 %0 %20 %0 %34668339
88NC_016005AAAGC38114738114871560 %0 %20 %20 %6 %34668339
89NC_016005AAGAA38197658197791580 %0 %20 %0 %0 %34668339
90NC_016005AGCAC38251428251551440 %0 %20 %40 %7 %34668339
91NC_016005TCCTT3864528864541140 %60 %0 %40 %7 %34668339
92NC_016005AAAAG38696598696721480 %0 %20 %0 %7 %34668339
93NC_016005TTTCT3875897875911150 %80 %0 %20 %6 %34668339
94NC_016005AGAAT38804008804151660 %20 %20 %0 %6 %34668339
95NC_016005AGAAA39198349198491680 %0 %20 %0 %6 %34668339
96NC_016005AAATT39327169327301560 %40 %0 %0 %6 %34668339
97NC_016005CGAAT39367289367421540 %20 %20 %20 %6 %34668339
98NC_016005GCATT39505889506011420 %40 %20 %20 %7 %34668339
99NC_016005TTGAC39695049695181520 %40 %20 %20 %6 %34668339
100NC_016005AAGAA39895249895381580 %0 %20 %0 %0 %34668339
101NC_016005AAGAA39923049923181580 %0 %20 %0 %6 %34668339
102NC_016005TTCTT3996813996827150 %80 %0 %20 %0 %34668339
103NC_016005GCTCC310103541010367140 %20 %20 %60 %7 %34668339
104NC_016005AGCAC3105338410533971440 %0 %20 %40 %7 %34668339
105NC_016005CTTTT310788051078820160 %80 %0 %20 %6 %34668339
106NC_016005TGATC3108719410872071420 %40 %20 %20 %7 %34668339
107NC_016005ATCTG3109223010922441520 %40 %20 %20 %0 %34668339
108NC_016005AAAGA4109270310927222080 %0 %20 %0 %10 %34668339
109NC_016005TCGCT411011281101148210 %40 %20 %40 %9 %34668339
110NC_016005GTGCT411094701109488190 %40 %40 %20 %10 %34668339
111NC_016005CTGGT311278091127822140 %40 %40 %20 %7 %34668339
112NC_016005TAGGT4112795311279722020 %40 %40 %0 %10 %34668339
113NC_016005CTTAA3113599011360031440 %40 %0 %20 %7 %34668339
114NC_016005TTCGC411451681145186190 %40 %20 %40 %10 %34668339
115NC_016005AGAGA3114905111490641460 %0 %40 %0 %7 %34668339
116NC_016005TCTTT311589091158923150 %80 %0 %20 %0 %34668339
117NC_016005TTTTC311605531160567150 %80 %0 %20 %6 %34668339
118NC_016005AAAAG3116273911627531580 %0 %20 %0 %6 %34668339
119NC_016005CGATC3116417811641911420 %20 %20 %40 %7 %34668339
120NC_016005AGAGA3116633911663521460 %0 %40 %0 %7 %34668339
121NC_016005TTTCT311705361170550150 %80 %0 %20 %6 %34668339
122NC_016005TTCTT312051931205207150 %80 %0 %20 %0 %34668339
123NC_016005AAAGA3121363912136531580 %0 %20 %0 %0 %34668339
124NC_016005AAGAT3121890012189141560 %20 %20 %0 %6 %34668339
125NC_016005TCTTT312362851236299150 %80 %0 %20 %0 %34668339
126NC_016005CTTTT312786381278652150 %80 %0 %20 %0 %34668339
127NC_016005CCGTC312848271284840140 %20 %20 %60 %7 %34668339
128NC_016005GAATA3129710012971141560 %20 %20 %0 %6 %34668339
129NC_016005CTTTT313261791326192140 %80 %0 %20 %7 %34668339
130NC_016005CTATG3135813913581521420 %40 %20 %20 %7 %34668339
131NC_016005AGCGA3135934213593561540 %0 %40 %20 %6 %34668339
132NC_016005GATCG3136058513605981420 %20 %40 %20 %7 %34668339
133NC_016005TCTCT313830721383086150 %60 %0 %40 %6 %34668339
134NC_016005CTTCT313873601387373140 %60 %0 %40 %7 %34668339
135NC_016005ATAAG3140851814085321560 %20 %20 %0 %6 %34668339
136NC_016005CTTCT314122831412296140 %60 %0 %40 %7 %34668339
137NC_016005GAAAG3142233814223531660 %0 %40 %0 %6 %34668339
138NC_016005GAAGA3144913814491511460 %0 %40 %0 %7 %34668339
139NC_016005AATAC3145206514520791560 %20 %0 %20 %6 %34668339
140NC_016005TTGTG314641891464204160 %60 %40 %0 %6 %34668339
141NC_016005CTTTT314686421468656150 %80 %0 %20 %6 %34668339
142NC_016005CATTA3147082114708361640 %40 %0 %20 %6 %34668339
143NC_016005TCCGC314847541484768150 %20 %20 %60 %6 %34668339
144NC_016005TCGCT314952171495231150 %40 %20 %40 %0 %34668339
145NC_016005GGTCT314958391495852140 %40 %40 %20 %7 %34668339
146NC_016005TTCTT314984021498415140 %80 %0 %20 %7 %34668339
147NC_016005TCCTT315325151532528140 %60 %0 %40 %7 %34668339
148NC_016005CTGAT3153974815397621520 %40 %20 %20 %6 %34668339