ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Perfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016005	TTC	4	3351	3362	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016005	GAC	4	5550	5561	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34668335
3	NC_016005	CTT	4	32428	32439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
4	NC_016005	TCT	4	34488	34499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
5	NC_016005	TCT	4	59765	59776	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
6	NC_016005	AGT	4	72731	72742	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
7	NC_016005	AGA	4	82162	82173	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
8	NC_016005	TTC	4	82765	82776	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
9	NC_016005	AGA	4	95840	95851	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
10	NC_016005	TGA	4	105760	105771	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
11	NC_016005	GAA	4	149045	149056	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
12	NC_016005	AGA	4	149097	149108	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
13	NC_016005	GAA	4	153224	153235	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
14	NC_016005	AGA	5	156702	156716	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
15	NC_016005	TTC	4	175145	175156	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
16	NC_016005	CTT	4	182339	182350	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
17	NC_016005	AGA	4	192769	192780	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
18	NC_016005	TTG	4	197206	197217	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	34668339
19	NC_016005	AGA	6	201643	201660	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
20	NC_016005	CTT	4	202248	202259	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
21	NC_016005	CTT	4	207108	207119	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
22	NC_016005	CTT	4	211985	211996	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
23	NC_016005	CTT	4	217491	217502	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
24	NC_016005	TTC	4	221438	221449	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
25	NC_016005	AGA	4	229610	229621	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
26	NC_016005	TTA	4	232611	232622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34668339
27	NC_016005	AGA	4	232957	232968	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
28	NC_016005	TTC	4	247557	247568	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
29	NC_016005	TGA	4	254969	254980	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
30	NC_016005	AGA	4	264829	264840	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
31	NC_016005	TCT	4	286170	286181	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
32	NC_016005	TCT	4	310769	310780	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
33	NC_016005	AGA	4	330906	330917	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
34	NC_016005	ACT	4	368135	368146	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34668339
35	NC_016005	AAG	4	375912	375923	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
36	NC_016005	AGA	4	377400	377411	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
37	NC_016005	AAG	4	380180	380191	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
38	NC_016005	AGA	4	392528	392539	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
39	NC_016005	AAG	4	400812	400823	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
40	NC_016005	CTT	4	456085	456096	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
41	NC_016005	GAG	4	478167	478178	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	34668339
42	NC_016005	CTT	4	485212	485223	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
43	NC_016005	AGA	4	500571	500582	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
44	NC_016005	CTT	4	500696	500707	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
45	NC_016005	TCT	4	501483	501494	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
46	NC_016005	AGA	4	510886	510897	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
47	NC_016005	AGA	4	527439	527450	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
48	NC_016005	GAA	5	530978	530992	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
49	NC_016005	TTC	4	532535	532546	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
50	NC_016005	AGA	4	542347	542358	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
51	NC_016005	GAA	4	586896	586907	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
52	NC_016005	CTA	4	601498	601509	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34668339
53	NC_016005	GAA	4	602098	602109	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
54	NC_016005	AGT	4	608459	608470	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
55	NC_016005	AAG	4	633905	633916	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
56	NC_016005	AGA	4	653255	653266	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
57	NC_016005	AAG	4	672648	672659	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
58	NC_016005	AGA	4	675815	675826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
59	NC_016005	AGA	4	688831	688842	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
60	NC_016005	AAG	4	695296	695307	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
61	NC_016005	TAG	7	708240	708260	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
62	NC_016005	TGA	4	715409	715420	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
63	NC_016005	CTT	4	718421	718432	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
64	NC_016005	AAG	4	747451	747462	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
65	NC_016005	AAG	4	747877	747888	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
66	NC_016005	AGA	4	770872	770883	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
67	NC_016005	TCT	4	779336	779347	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
68	NC_016005	TTC	4	791423	791434	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
69	NC_016005	GAG	4	795176	795187	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	34668339
70	NC_016005	GAA	4	821829	821840	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
71	NC_016005	GAA	4	825494	825505	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
72	NC_016005	TCT	4	829224	829235	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
73	NC_016005	GAA	5	838327	838341	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
74	NC_016005	TTC	4	843196	843207	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
75	NC_016005	GAA	4	852385	852396	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
76	NC_016005	GAA	4	852933	852944	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
77	NC_016005	CTT	4	859952	859963	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
78	NC_016005	TAA	4	869480	869491	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	34668339
79	NC_016005	TAG	4	870450	870461	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
80	NC_016005	TTC	4	926100	926111	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
81	NC_016005	CAA	4	950453	950464	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	34668339
82	NC_016005	AAG	4	960105	960116	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
83	NC_016005	GAA	5	975604	975618	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
84	NC_016005	CTC	4	990279	990290	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	34668339
85	NC_016005	CTT	4	1001852	1001863	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
86	NC_016005	TGA	4	1002191	1002202	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
87	NC_016005	CTA	4	1010178	1010189	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34668339
88	NC_016005	TCT	4	1014399	1014410	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
89	NC_016005	CTT	4	1025017	1025028	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
90	NC_016005	GAA	4	1025620	1025631	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
91	NC_016005	GAA	4	1025731	1025742	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
92	NC_016005	GAA	4	1025842	1025853	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
93	NC_016005	GAA	4	1025911	1025922	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
94	NC_016005	AGA	4	1033481	1033492	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
95	NC_016005	AGA	4	1044837	1044848	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
96	NC_016005	GAA	4	1050071	1050082	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
97	NC_016005	GAA	4	1053736	1053747	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
98	NC_016005	TCT	4	1057466	1057477	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
99	NC_016005	AAG	4	1068890	1068901	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
100	NC_016005	TCT	4	1077953	1077964	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
101	NC_016005	AGA	4	1101191	1101202	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
102	NC_016005	AGA	4	1113226	1113237	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
103	NC_016005	TCT	4	1116307	1116318	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
104	NC_016005	AGA	4	1118775	1118786	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
105	NC_016005	TCT	4	1119089	1119100	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
106	NC_016005	TCT	4	1122267	1122278	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
107	NC_016005	AAG	4	1150138	1150149	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
108	NC_016005	GAA	4	1162568	1162579	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
109	NC_016005	AGA	4	1175671	1175682	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
110	NC_016005	TCT	4	1175824	1175835	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
111	NC_016005	AGA	4	1209931	1209942	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
112	NC_016005	AAG	4	1221276	1221287	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
113	NC_016005	AAG	4	1241691	1241702	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
114	NC_016005	TCT	4	1260330	1260341	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
115	NC_016005	GTA	4	1277182	1277193	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
116	NC_016005	CTT	4	1281396	1281407	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
117	NC_016005	TCT	4	1285814	1285825	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
118	NC_016005	TAG	4	1288682	1288693	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668339
119	NC_016005	TCT	4	1316428	1316439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
120	NC_016005	AGA	4	1323176	1323187	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
121	NC_016005	CTT	4	1323615	1323626	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
122	NC_016005	TCT	4	1331864	1331875	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
123	NC_016005	TCT	5	1339639	1339653	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
124	NC_016005	CTA	4	1340425	1340436	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34668339
125	NC_016005	TTC	4	1354924	1354935	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
126	NC_016005	AAG	4	1377891	1377902	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
127	NC_016005	TCT	5	1410445	1410459	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
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132	NC_016005	AGA	4	1454071	1454082	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
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134	NC_016005	ATC	4	1465775	1465786	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34668339
135	NC_016005	TCT	5	1466617	1466631	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34668339
136	NC_016005	ATA	6	1474951	1474968	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	34668339
137	NC_016005	AGA	4	1475705	1475716	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
138	NC_016005	GAA	4	1485881	1485892	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
139	NC_016005	AAG	4	1512259	1512270	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
140	NC_016005	GAA	4	1518442	1518453	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016005	CTT	4	1523879	1523890	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Perfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1