ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016005	TC	6	2886	2896	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016005	CT	6	4508	4518	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668335
3	NC_016005	GA	6	5122	5132	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668335
4	NC_016005	AG	7	18792	18805	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34668339
5	NC_016005	GA	7	22054	22067	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34668339
6	NC_016005	CT	7	43138	43150	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	34668339
7	NC_016005	CT	6	43448	43459	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
8	NC_016005	CT	6	47808	47819	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
9	NC_016005	TA	6	55495	55505	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668339
10	NC_016005	CT	6	60451	60461	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
11	NC_016005	TC	6	72596	72606	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
12	NC_016005	TC	6	76031	76041	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
13	NC_016005	CT	6	90819	90829	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
14	NC_016005	AG	6	99857	99868	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
15	NC_016005	GA	7	101484	101497	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34668339
16	NC_016005	TA	6	104756	104767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668339
17	NC_016005	AG	6	105447	105457	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
18	NC_016005	TG	6	112293	112304	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	34668339
19	NC_016005	TC	6	112586	112596	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
20	NC_016005	AG	8	115548	115562	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	34668339
21	NC_016005	CT	7	120174	120186	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	34668339
22	NC_016005	AT	6	122105	122116	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668339
23	NC_016005	AG	6	122709	122719	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
24	NC_016005	TC	6	128957	128967	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
25	NC_016005	CA	6	135667	135678	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	34668339
26	NC_016005	TC	7	141751	141764	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	34668339
27	NC_016005	TA	8	147414	147428	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34668339
28	NC_016005	TA	6	155084	155095	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668339
29	NC_016005	AG	7	162889	162901	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34668339
30	NC_016005	TC	6	164068	164079	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
31	NC_016005	AG	6	172663	172674	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
32	NC_016005	CT	6	177019	177029	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
33	NC_016005	GA	8	182906	182920	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	34668339
34	NC_016005	TA	7	184913	184926	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34668339
35	NC_016005	AG	6	189451	189461	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
36	NC_016005	GA	6	189780	189790	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
37	NC_016005	CT	7	190804	190817	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	34668339
38	NC_016005	TC	6	195743	195754	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
39	NC_016005	AG	6	197676	197686	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
40	NC_016005	TC	6	199312	199322	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
41	NC_016005	TC	6	203526	203536	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
42	NC_016005	GA	6	203942	203953	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
43	NC_016005	GA	6	209897	209907	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
44	NC_016005	AG	6	211456	211467	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
45	NC_016005	TA	7	226411	226423	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34668339
46	NC_016005	GA	6	236188	236199	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
47	NC_016005	CT	7	241600	241612	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	34668339
48	NC_016005	TC	6	254346	254357	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
49	NC_016005	TA	6	262818	262829	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668339
50	NC_016005	CT	6	270609	270620	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
51	NC_016005	AT	6	274772	274783	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668339
52	NC_016005	CT	6	280316	280327	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
53	NC_016005	GA	6	293090	293100	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
54	NC_016005	AG	6	300077	300088	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
55	NC_016005	GA	6	304710	304720	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
56	NC_016005	TC	6	305930	305940	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
57	NC_016005	TA	8	314228	314242	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34668339
58	NC_016005	CT	6	314539	314550	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
59	NC_016005	AT	6	318601	318612	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668339
60	NC_016005	TC	7	321915	321927	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	34668339
61	NC_016005	GT	6	327395	327405	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	34668339
62	NC_016005	TC	6	328172	328182	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
63	NC_016005	GA	7	340783	340795	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34668339
64	NC_016005	AT	6	341613	341623	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668339
65	NC_016005	GA	6	343907	343917	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
66	NC_016005	TC	6	344229	344240	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
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69	NC_016005	CT	6	349515	349526	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
70	NC_016005	GA	6	350882	350895	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34668339
71	NC_016005	CT	6	356671	356682	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
72	NC_016005	TC	6	357262	357272	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
73	NC_016005	AG	6	360062	360072	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
74	NC_016005	CT	6	364345	364356	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
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77	NC_016005	CT	6	373147	373158	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
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79	NC_016005	AT	7	405153	405165	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34668339
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96	NC_016005	TC	6	473677	473687	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
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102	NC_016005	CT	6	489757	489768	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
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130	NC_016005	CT	6	688855	688866	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1