ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016005	AACT	3	4106	4117	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	34668335
2	NC_016005	CTCG	3	5087	5097	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	34668335
3	NC_016005	TTTC	3	9480	9490	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
4	NC_016005	TTCA	3	9506	9516	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	34668339
5	NC_016005	GCGA	3	11954	11964	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	34668339
6	NC_016005	TTGA	3	13653	13664	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	34668339
7	NC_016005	TCCT	3	16727	16738	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
8	NC_016005	GTAG	3	16893	16904	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	34668339
9	NC_016005	TAAA	4	16969	16984	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	34668339
10	NC_016005	GCTT	3	19141	19151	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	34668339
11	NC_016005	TCAA	4	20214	20228	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	34668339
12	NC_016005	TTTC	4	22125	22141	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	34668339
13	NC_016005	GAAA	3	22332	22342	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
14	NC_016005	GGAA	3	22387	22397	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
15	NC_016005	CCTT	3	23655	23665	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
16	NC_016005	GACT	3	25394	25404	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	34668339
17	NC_016005	TTCC	3	25683	25693	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
18	NC_016005	GAAA	3	28473	28483	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
19	NC_016005	TGAA	3	31504	31515	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34668339
20	NC_016005	GAAG	3	33482	33494	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34668339
21	NC_016005	CGGA	3	35819	35829	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	34668339
22	NC_016005	GAAG	3	36748	36759	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
23	NC_016005	TACT	3	36867	36878	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34668339
24	NC_016005	GAAT	3	38398	38409	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34668339
25	NC_016005	CCTT	3	39169	39180	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
26	NC_016005	TTTC	4	40249	40264	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	34668339
27	NC_016005	GGAA	3	40763	40773	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34668339
28	NC_016005	CTTT	3	48953	48964	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
29	NC_016005	AAGA	4	51726	51741	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	34668339
30	NC_016005	GGGA	3	53445	53456	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	34668339
31	NC_016005	CTTT	3	56180	56190	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
32	NC_016005	TCTT	3	56691	56702	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
33	NC_016005	GAAA	3	57178	57188	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
34	NC_016005	GAAA	3	59967	59977	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
35	NC_016005	GAAA	3	65928	65938	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
36	NC_016005	CTTT	3	66492	66502	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
37	NC_016005	AAAG	3	69166	69176	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
38	NC_016005	TGAA	3	70840	70851	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	34668339
39	NC_016005	CCTC	3	74215	74226	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	34668339
40	NC_016005	CCTT	3	75081	75092	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
41	NC_016005	ATTC	3	83120	83131	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34668339
42	NC_016005	TTCC	3	83637	83647	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668339
43	NC_016005	GCTC	3	84764	84774	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	34668339
44	NC_016005	GAAA	3	86134	86144	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
45	NC_016005	CATA	3	86714	86725	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	34668339
46	NC_016005	TTTC	3	87081	87092	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
47	NC_016005	GAAG	4	87823	87837	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	34668339
48	NC_016005	TGAA	3	87858	87868	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668339
49	NC_016005	CTCC	3	90581	90592	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	34668339
50	NC_016005	GAAG	3	93574	93585	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	34668339
51	NC_016005	CTTT	3	94507	94517	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
52	NC_016005	TCTT	3	94899	94910	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
53	NC_016005	AGAA	3	96155	96167	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	34668339
54	NC_016005	GAAA	3	97491	97501	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
55	NC_016005	GAGG	3	98988	98999	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	34668339
56	NC_016005	GAAT	3	99433	99444	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34668339
57	NC_016005	TGAA	3	99955	99965	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668339
58	NC_016005	ACGG	3	100000	100011	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	34668339
59	NC_016005	AAAG	3	101816	101826	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
60	NC_016005	GAAA	3	108879	108889	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
61	NC_016005	CTTT	3	109587	109598	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
62	NC_016005	AAAG	3	109974	109985	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34668339
63	NC_016005	TCTT	4	111564	111578	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	34668339
64	NC_016005	TTCT	3	111622	111634	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	34668339
65	NC_016005	CTTT	3	113540	113551	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
66	NC_016005	TGAA	3	114814	114825	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	34668339
67	NC_016005	GTCC	3	116264	116274	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	34668339
68	NC_016005	TTTC	3	117886	117897	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
69	NC_016005	TTTC	3	120781	120792	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
70	NC_016005	GAAT	3	121503	121514	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34668339
71	NC_016005	AGAA	3	125799	125810	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	34668339
72	NC_016005	CAGA	3	126439	126449	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	34668339
73	NC_016005	GACT	3	127657	127667	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	34668339
74	NC_016005	AAAG	3	129728	129739	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34668339
75	NC_016005	TATC	3	130792	130803	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34668339
76	NC_016005	TCCT	3	131145	131156	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
77	NC_016005	TAAG	3	131573	131583	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668339
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79	NC_016005	GAAA	3	134986	134996	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
80	NC_016005	AAGA	3	135580	135591	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34668339
81	NC_016005	CTTG	3	136542	136554	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	34668339
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87	NC_016005	TTCT	3	144415	144426	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
88	NC_016005	GACG	3	145651	145661	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	34668339
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91	NC_016005	TCAC	3	146592	146607	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	34668339
92	NC_016005	CTTT	3	150082	150092	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
93	NC_016005	ATTC	3	151502	151513	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34668339
94	NC_016005	TTCC	3	151514	151525	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
95	NC_016005	CTTT	3	152955	152965	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
96	NC_016005	TGAA	3	153901	153912	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	34668339
97	NC_016005	AGAA	3	154947	154958	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34668339
98	NC_016005	GAAA	3	157621	157633	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	34668339
99	NC_016005	ATTC	3	158585	158596	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34668339
100	NC_016005	GCCT	3	159585	159595	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	34668339
101	NC_016005	TGAA	3	168922	168933	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34668339
102	NC_016005	AAAG	3	170314	170325	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	34668339
103	NC_016005	TCTT	3	172969	172984	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	34668339
104	NC_016005	AGAA	3	173327	173338	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34668339
105	NC_016005	AGAA	3	175218	175229	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	34668339
106	NC_016005	TCCT	3	178239	178250	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668339
107	NC_016005	CGGA	3	180405	180415	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	34668339
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109	NC_016005	GAGT	3	180487	180498	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	34668339
110	NC_016005	AAGA	3	181983	181994	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34668339
111	NC_016005	GGAC	3	183521	183531	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	34668339
112	NC_016005	GAAA	3	186774	186784	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34668339
113	NC_016005	TTGA	3	187243	187253	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	34668339
114	NC_016005	CCGT	3	191624	191634	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	34668339
115	NC_016005	TCCT	3	192195	192207	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	34668339
116	NC_016005	GAGT	3	192645	192656	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	34668339
117	NC_016005	GAAA	3	193509	193520	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	34668339
118	NC_016005	ATTC	4	193743	193757	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	34668339
119	NC_016005	AAAG	3	195155	195166	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	34668339
120	NC_016005	AAGT	3	195976	195986	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668339
121	NC_016005	TGAA	3	196061	196072	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34668339
122	NC_016005	TTCT	3	198391	198402	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34668339
123	NC_016005	ATTC	3	198421	198432	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34668339
124	NC_016005	CTTT	3	199392	199402	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
125	NC_016005	AAGG	3	199884	199895	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34668339
126	NC_016005	GATA	3	201958	201968	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668339
127	NC_016005	TGAA	3	202505	202515	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668339
128	NC_016005	TTTC	3	203044	203054	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668339
129	NC_016005	ATGA	3	203433	203443	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668339
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1