ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Perfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016005	TAAA	3	16969	16980	12	75 %	25 %	0 %	0 %	34668339
2	NC_016005	AAGA	3	51730	51741	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
3	NC_016005	TCTT	3	56691	56702	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
4	NC_016005	TGAA	3	70840	70851	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
5	NC_016005	GAAG	3	87826	87837	12	50 %	0 %	50 %	0 %	34668339
6	NC_016005	GAAG	3	93574	93585	12	50 %	0 %	50 %	0 %	34668339
7	NC_016005	AGGA	3	111003	111014	12	50 %	0 %	50 %	0 %	34668339
8	NC_016005	TCTT	3	111567	111578	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
9	NC_016005	CTTT	3	113540	113551	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
10	NC_016005	TGAA	3	114814	114825	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
11	NC_016005	AGAA	3	125799	125810	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
12	NC_016005	TCTT	3	140497	140508	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
13	NC_016005	TTAG	3	145743	145754	12	25 %	50 %	25 %	0 %	34668339
14	NC_016005	TCAC	3	146592	146603	12	25 %	25 %	0 %	50 %	34668339
15	NC_016005	TGAA	3	153901	153912	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
16	NC_016005	AAAG	3	170314	170325	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
17	NC_016005	TCTT	3	172973	172984	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
18	NC_016005	AGAA	3	175218	175229	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
19	NC_016005	GAAA	3	193509	193520	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
20	NC_016005	AAAG	3	195155	195166	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
21	NC_016005	TCCT	3	212876	212887	12	0 %	50 %	0 %	50 %	34668339
22	NC_016005	CTTT	3	223696	223707	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
23	NC_016005	GAAA	3	224498	224509	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
24	NC_016005	AGAA	3	259053	259064	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
25	NC_016005	TCAT	3	265826	265837	12	25 %	50 %	0 %	25 %	34668339
26	NC_016005	ACTA	3	267787	267798	12	50 %	25 %	0 %	25 %	34668339
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30	NC_016005	CTTT	3	280410	280421	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
31	NC_016005	CTTT	3	291649	291660	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
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33	NC_016005	AAAG	3	295170	295181	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
34	NC_016005	ATTC	3	297925	297936	12	25 %	50 %	0 %	25 %	34668339
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39	NC_016005	TTCA	3	333704	333715	12	25 %	50 %	0 %	25 %	34668339
40	NC_016005	CTTT	3	334111	334122	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
41	NC_016005	TTTC	3	336959	336970	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
42	NC_016005	GATC	3	386481	386492	12	25 %	25 %	25 %	25 %	34668339
43	NC_016005	AGAA	3	392556	392567	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
44	NC_016005	AAGC	3	419356	419367	12	50 %	0 %	25 %	25 %	34668339
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46	NC_016005	TCTT	4	438292	438307	16	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
47	NC_016005	AATC	3	442229	442240	12	50 %	25 %	0 %	25 %	34668339
48	NC_016005	TCTT	3	446240	446251	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
49	NC_016005	ATTC	3	447177	447188	12	25 %	50 %	0 %	25 %	34668339
50	NC_016005	AAAG	3	450542	450553	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
51	NC_016005	GAAA	3	451404	451415	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
52	NC_016005	AGAA	3	452924	452935	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
53	NC_016005	CTTT	3	453254	453265	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
54	NC_016005	TGGA	3	453911	453922	12	25 %	25 %	50 %	0 %	34668339
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60	NC_016005	TCCT	3	478500	478511	12	0 %	50 %	0 %	50 %	34668339
61	NC_016005	CTTC	3	478773	478784	12	0 %	50 %	0 %	50 %	34668339
62	NC_016005	GATC	3	488090	488101	12	25 %	25 %	25 %	25 %	34668339
63	NC_016005	ATGA	3	499801	499812	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
64	NC_016005	CTTC	3	503462	503473	12	0 %	50 %	0 %	50 %	34668339
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69	NC_016005	AATT	3	537441	537452	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34668339
70	NC_016005	CTTT	3	551542	551553	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
71	NC_016005	AATC	3	556469	556480	12	50 %	25 %	0 %	25 %	34668339
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73	NC_016005	TGAA	3	576857	576868	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
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101	NC_016005	GAAT	3	784845	784856	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
102	NC_016005	TGAA	3	795370	795381	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
103	NC_016005	AAAG	3	801133	801144	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
104	NC_016005	CTTT	3	807562	807573	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
105	NC_016005	ATTC	3	807818	807829	12	25 %	50 %	0 %	25 %	34668339
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108	NC_016005	TTAA	3	817622	817633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34668339
109	NC_016005	AAAG	3	819916	819927	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
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111	NC_016005	AAAG	3	836679	836690	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
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115	NC_016005	CTAA	3	881652	881663	12	50 %	25 %	0 %	25 %	34668339
116	NC_016005	TCTT	3	884657	884668	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
117	NC_016005	AGAA	3	889849	889860	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
118	NC_016005	AGAA	3	890339	890350	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
119	NC_016005	TTTC	3	904719	904730	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
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121	NC_016005	AAAG	3	921269	921280	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
122	NC_016005	TCTT	3	923928	923939	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
123	NC_016005	AGAA	3	926173	926184	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
124	NC_016005	TCTT	3	947250	947261	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
125	NC_016005	AAGG	3	957553	957564	12	50 %	0 %	50 %	0 %	34668339
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127	NC_016005	CTGA	3	968381	968392	12	25 %	25 %	25 %	25 %	34668339
128	NC_016005	GGAC	3	969121	969132	12	25 %	0 %	50 %	25 %	34668339
129	NC_016005	TGGC	3	969339	969350	12	0 %	25 %	50 %	25 %	34668339
130	NC_016005	CTTT	3	970564	970575	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
131	NC_016005	GAAA	3	978686	978697	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
132	NC_016005	AAGA	3	982980	982991	12	75 %	0 %	25 %	0 %	34668339
133	NC_016005	CATC	3	985796	985807	12	25 %	25 %	0 %	50 %	34668339
134	NC_016005	AGGA	3	988715	988726	12	50 %	0 %	50 %	0 %	34668339
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213	NC_016005	CTTT	3	1483717	1483728	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34668339
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219	NC_016005	CTTT	3	1523860	1523871	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
220	NC_016005	TTTC	3	1527713	1527724	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
221	NC_016005	GATA	4	1540989	1541004	16	50 %	25 %	25 %	0 %	34668339
222	NC_016005	TCAT	3	1543362	1543373	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Perfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1