ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016005	CTA	4	1048	1059	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34668335
2	NC_016005	CTT	4	3240	3251	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016005	TTC	4	3351	3362	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016005	GAC	4	5550	5561	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34668335
5	NC_016005	GAT	4	8302	8312	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
6	NC_016005	GAA	4	10809	10821	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
7	NC_016005	AAG	4	12024	12035	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
8	NC_016005	AAG	4	12056	12067	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
9	NC_016005	AAG	4	12088	12099	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
10	NC_016005	TCT	4	14019	14029	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
11	NC_016005	AAG	4	15886	15896	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
12	NC_016005	GAA	4	20501	20512	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
13	NC_016005	TAA	4	21889	21899	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34668339
14	NC_016005	TCC	4	23422	23432	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	34668339
15	NC_016005	AAG	4	24656	24667	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
16	NC_016005	TAT	4	26229	26241	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34668339
17	NC_016005	AGA	4	26779	26789	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
18	NC_016005	AAT	4	27588	27600	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34668339
19	NC_016005	TCT	4	29471	29482	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
20	NC_016005	CAA	4	29627	29638	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
21	NC_016005	CAT	4	30517	30527	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
22	NC_016005	CTT	4	32428	32439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
23	NC_016005	TTC	4	33894	33905	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
24	NC_016005	TCT	6	34488	34504	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
25	NC_016005	AGA	4	35039	35051	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
26	NC_016005	TCT	4	37355	37365	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
27	NC_016005	AGG	4	40333	40343	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	34668339
28	NC_016005	AGA	4	41215	41225	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
29	NC_016005	TAG	4	42330	42341	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
30	NC_016005	AAG	5	43587	43600	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
31	NC_016005	TCT	4	49026	49037	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
32	NC_016005	TCT	4	55750	55760	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
33	NC_016005	TTC	4	56038	56048	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
34	NC_016005	TTC	5	56484	56497	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34668339
35	NC_016005	TCT	7	59765	59785	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
36	NC_016005	TTC	4	60026	60037	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
37	NC_016005	TCT	6	60307	60323	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	34668339
38	NC_016005	GGA	4	62461	62471	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	34668339
39	NC_016005	TCT	4	63100	63111	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
40	NC_016005	TCT	4	69003	69015	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34668339
41	NC_016005	CTT	4	69124	69134	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
42	NC_016005	GAG	4	70323	70335	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	34668339
43	NC_016005	TCT	5	70443	70457	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	34668339
44	NC_016005	GAA	4	70759	70771	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
45	NC_016005	AGA	4	70862	70873	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
46	NC_016005	AGT	5	72731	72745	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	34668339
47	NC_016005	AAG	4	80499	80509	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
48	NC_016005	AGA	4	81264	81274	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
49	NC_016005	AGA	5	82160	82173	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
50	NC_016005	TCT	4	82766	82777	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
51	NC_016005	AGA	4	83254	83265	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
52	NC_016005	AGA	4	84468	84479	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
53	NC_016005	TTG	4	87510	87521	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
54	NC_016005	GGA	4	89270	89280	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	34668339
55	NC_016005	GTA	4	90273	90284	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
56	NC_016005	TAG	4	93475	93486	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
57	NC_016005	AGA	4	95653	95663	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
58	NC_016005	GAA	4	95816	95827	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
59	NC_016005	AGA	5	95840	95853	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
60	NC_016005	TCT	4	95912	95923	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
61	NC_016005	GAG	4	96961	96972	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	34668339
62	NC_016005	CTT	4	104719	104730	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
63	NC_016005	AAG	4	105122	105132	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
64	NC_016005	TGA	4	105760	105771	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	34668339
65	NC_016005	AGA	5	106485	106498	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
66	NC_016005	CTT	5	107341	107356	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	34668339
67	NC_016005	CTT	4	107559	107570	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
68	NC_016005	CTT	4	108026	108036	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
69	NC_016005	GAA	5	108226	108239	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
70	NC_016005	CTC	4	108572	108582	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	34668339
71	NC_016005	ACT	4	112786	112797	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
72	NC_016005	TTC	5	116187	116201	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	34668339
73	NC_016005	GAA	4	116953	116964	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
74	NC_016005	TCT	4	118809	118819	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
75	NC_016005	CTT	4	121850	121860	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
76	NC_016005	TCC	4	122150	122160	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	34668339
77	NC_016005	TTC	4	122246	122257	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
78	NC_016005	GGA	4	123386	123397	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	34668339
79	NC_016005	CTT	4	124389	124399	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
80	NC_016005	AGA	5	125244	125258	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	34668339
81	NC_016005	GTA	4	125843	125855	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
82	NC_016005	AGA	4	127360	127370	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
83	NC_016005	GAA	4	128247	128257	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
84	NC_016005	AGA	4	131450	131460	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
85	NC_016005	AGA	4	131907	131918	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
86	NC_016005	TTC	4	137189	137200	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
87	NC_016005	CAC	4	137689	137699	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	34668339
88	NC_016005	CTC	4	139722	139733	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	34668339
89	NC_016005	TCT	4	140088	140098	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
90	NC_016005	AAG	4	140233	140245	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
91	NC_016005	TCT	4	140799	140810	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
92	NC_016005	CTT	4	142031	142043	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34668339
93	NC_016005	TAC	4	148888	148899	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
94	NC_016005	TAC	4	149019	149030	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
95	NC_016005	GAA	4	149045	149056	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	34668339
96	NC_016005	AGA	5	149095	149108	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	34668339
97	NC_016005	ATC	4	152939	152950	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
98	NC_016005	GAA	4	153224	153235	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	34668339
99	NC_016005	AAG	4	153823	153834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
100	NC_016005	TCT	4	154421	154433	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34668339
101	NC_016005	AGA	6	156700	156716	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34668339
102	NC_016005	TTC	4	158948	158959	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
103	NC_016005	GGA	4	160940	160951	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	34668339
104	NC_016005	GGT	4	168331	168341	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	34668339
105	NC_016005	ACT	4	169697	169708	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
106	NC_016005	TCT	4	174892	174903	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
107	NC_016005	TTC	4	175145	175156	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
108	NC_016005	TCA	4	176002	176012	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
109	NC_016005	CTT	4	182339	182350	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34668339
110	NC_016005	GGA	4	182792	182803	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	34668339
111	NC_016005	AAG	4	184165	184175	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34668339
112	NC_016005	AGA	4	188455	188466	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
113	NC_016005	TCT	4	189585	189595	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
114	NC_016005	TCC	4	190648	190658	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	34668339
115	NC_016005	TCT	4	190932	190943	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
116	NC_016005	TCT	4	191158	191168	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668339
117	NC_016005	AGA	5	192765	192780	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	34668339
118	NC_016005	AGA	4	192961	192972	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
119	NC_016005	GAA	4	193547	193558	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34668339
120	NC_016005	CTT	4	193695	193706	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34668339
121	NC_016005	GGT	4	193981	193991	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	34668339
122	NC_016005	ATT	4	194579	194591	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34668339
123	NC_016005	TCC	4	194679	194690	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	34668339
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 1