ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 2

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016004	TAAA	3	63	74	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016004	TCT	4	112	123	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016004	AAG	4	1631	1643	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016004	TTCTTT	3	2104	2122	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016004	AAGG	3	2387	2398	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016004	TA	7	2740	2754	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016004	AG	6	4425	4435	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016004	GGAG	3	4910	4921	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016004	TTTC	3	5244	5254	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016004	GA	6	6154	6164	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016004	TATT	4	6209	6223	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016004	AGAA	3	7099	7110	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016004	CTTT	3	7781	7791	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016004	TGAT	3	8188	8198	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016004	TCT	4	8376	8386	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016004	AATA	3	9015	9027	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016004	TTGA	3	9056	9066	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016004	AAG	4	9210	9221	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016004	TTCA	4	9627	9641	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016004	AGA	4	9716	9727	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016004	AAG	4	10945	10956	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016004	GA	6	11612	11622	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016004	GAA	4	12443	12454	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016004	GAAA	3	12526	12537	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016004	AG	6	12678	12689	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016004	CTTT	3	13036	13047	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016004	CGGA	3	15091	15101	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016004	AAAG	3	15268	15279	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016004	GCAA	3	15377	15387	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016004	AGA	4	15611	15622	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016004	TGAA	3	15639	15650	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016004	GA	6	15854	15865	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016004	GCCG	3	15878	15889	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016004	AG	6	15943	15954	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016004	GAAG	3	16073	16085	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016004	TTCT	3	17482	17493	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016004	TCT	4	18186	18197	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016004	CTA	4	18677	18688	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016004	CCTG	3	18743	18753	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016004	TTTC	3	19871	19881	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016004	AGA	6	21090	21106	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016004	CTTT	3	21781	21792	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016004	GAA	4	22364	22376	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016004	GA	6	22489	22499	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016004	AAGG	3	24951	24962	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016004	TATCT	3	25002	25016	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016004	TCT	4	25175	25188	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016004	GAA	4	25497	25508	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016004	AAAG	3	25560	25571	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016004	GAAA	3	25970	25981	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016004	CCTT	3	26553	26564	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016004	ATCCTA	3	26723	26741	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
53	NC_016004	TCCA	3	26759	26769	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016004	CTCC	3	27055	27066	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016004	CTT	4	27431	27441	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016004	TCC	4	28489	28500	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016004	CT	6	28929	28939	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016004	CGGA	3	29250	29260	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016004	AAAG	3	29410	29420	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016004	TCT	4	30632	30644	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016004	ATC	4	31809	31819	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016004	GAA	4	32215	32226	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016004	AAG	4	32830	32840	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016004	CCGAGC	3	33065	33082	18	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016004	CCTTT	3	33249	33262	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016004	AAAG	3	33305	33315	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016004	CCT	4	35843	35853	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016004	GTG	4	36582	36593	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016004	GGAAA	3	36775	36789	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016004	GAAA	3	36974	36986	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016004	ACGC	3	37138	37148	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016004	AAG	4	37219	37229	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016004	AG	7	38685	38697	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016004	TCT	4	40051	40063	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016004	GAAA	3	41076	41088	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016004	CTA	4	41135	41146	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016004	TCT	4	42457	42469	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016004	CCTT	3	42938	42949	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016004	TATC	3	44014	44025	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016004	CATA	3	45011	45021	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016004	CAT	4	45589	45600	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016004	AG	6	45719	45729	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016004	AAG	4	47093	47103	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016004	CCT	4	47717	47729	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016004	AGA	4	48197	48209	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016004	ATCTCG	3	49052	49069	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
87	NC_016004	AAGG	3	49849	49859	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016004	CAA	4	50492	50503	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016004	TGAA	3	51546	51557	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016004	GAA	4	52947	52958	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016004	TTTC	3	53829	53841	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016004	TCT	4	53869	53880	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016004	CTC	4	55141	55151	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016004	GGAG	3	55519	55530	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016004	GAAG	3	56587	56599	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016004	AAAG	3	57615	57625	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016004	AGA	7	58045	58065	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016004	AG	6	58215	58226	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016004	GAA	5	58896	58910	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016004	GGAA	3	60528	60538	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016004	GAA	4	60813	60823	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016004	GAAT	3	61349	61360	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016004	AATCC	3	62877	62890	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016004	ATGA	3	62957	62968	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016004	CT	6	63448	63458	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016004	TC	6	63479	63490	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016004	ATA	4	63835	63846	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016004	ATTC	3	64296	64307	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016004	CAGA	3	64965	64975	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016004	TTCTT	3	65068	65081	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016004	GAA	4	65321	65332	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016004	CTTC	3	65796	65807	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016004	TCTT	3	66849	66860	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016004	TC	7	67024	67037	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016004	GAA	4	67642	67653	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016004	AAG	5	68701	68715	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016004	TCT	4	69584	69595	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016004	TAT	4	69672	69683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016004	CAT	4	69980	69990	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016004	TGA	4	71002	71012	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016004	GAAA	3	73386	73397	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016004	TTC	4	74495	74507	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016004	GTTTCC	3	75053	75070	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
124	NC_016004	TCAA	3	75292	75303	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016004	T	12	76250	76261	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016004	ATCC	3	77395	77406	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016004	GATC	3	77581	77592	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016004	AAGAA	3	80095	80108	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016004	AGAA	3	80189	80200	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016004	CCTT	3	80341	80351	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016004	TCT	4	81567	81578	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016004	AGA	5	81687	81702	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016004	A	13	83682	83694	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cucumis sativus mitochondrion chromosome 2