ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Pyrus pyrifolia chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015996	TA	7	4474	4486	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_015996	TA	6	4790	4800	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015996	TA	6	6261	6271	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668327
4	NC_015996	AT	7	10419	10432	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015996	AT	7	10435	10447	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_015996	TA	6	10498	10508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_015996	TA	6	10519	10529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_015996	TA	9	31207	31223	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_015996	TA	6	31242	31253	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015996	TA	6	34058	34068	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015996	AG	6	38298	38308	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015996	TA	8	38525	38539	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_015996	TC	6	38874	38884	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668329
14	NC_015996	AT	6	39048	39059	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015996	AT	7	39233	39245	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015996	TG	6	43499	43509	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	34668329
17	NC_015996	AT	6	49521	49531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015996	AT	6	49555	49565	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015996	AT	6	50380	50392	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_015996	AT	6	50398	50408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015996	AT	6	50412	50422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015996	AT	6	51419	51429	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015996	TA	11	51847	51867	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015996	TA	6	54557	54568	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015996	TA	13	54676	54700	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015996	TA	6	60168	60179	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015996	TA	7	62837	62850	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015996	AT	6	65281	65291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668330
29	NC_015996	TA	6	66881	66892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015996	AT	8	69791	69805	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_015996	AT	6	70094	70104	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_015996	TA	6	71238	71248	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015996	AT	8	71252	71266	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_015996	AT	6	75658	75669	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668333
35	NC_015996	TA	6	86073	86083	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668333
36	NC_015996	TA	6	87038	87048	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668333
37	NC_015996	TA	8	88560	88574	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34668333
38	NC_015996	TA	7	98173	98185	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34668333
39	NC_015996	TA	6	113042	113053	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668331
40	NC_015996	AT	6	118404	118416	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34668331
41	NC_015996	TA	6	124575	124585	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668331
42	NC_015996	AT	6	134574	134585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34668331
43	NC_015996	CT	6	147596	147607	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668335
44	NC_015996	AT	7	149440	149452	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_015996	AT	7	159053	159065	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34668335

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Pyrus pyrifolia chloroplast