ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pyrus pyrifolia chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015996	T	15	166	180	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015996	A	18	184	201	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_015996	CAG	4	939	950	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34668327
4	NC_015996	AAGT	3	1045	1055	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668327
5	NC_015996	AAT	4	1485	1497	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_015996	TCTT	3	2225	2235	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34668327
7	NC_015996	TA	7	4474	4486	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_015996	A	17	4748	4764	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015996	TA	6	4790	4800	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015996	TAA	4	5080	5091	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015996	A	13	5647	5659	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	34668327
12	NC_015996	TA	6	6261	6271	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668327
13	NC_015996	A	28	6998	7025	28	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_015996	TTTA	3	7182	7192	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015996	ATA	6	7624	7640	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_015996	A	12	7942	7953	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015996	GATAA	3	7970	7984	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_015996	A	14	8071	8084	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_015996	T	15	9371	9385	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_015996	AAAG	3	9433	9444	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015996	AT	7	10419	10432	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_015996	AT	7	10435	10447	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_015996	AAATAT	3	10466	10482	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_015996	AAAT	3	10484	10494	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_015996	TA	6	10498	10508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015996	TA	6	10519	10529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015996	TTA	5	10628	10641	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015996	AAATTT	3	10700	10717	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_015996	ATTAT	3	10842	10856	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_015996	ATA	4	10882	10893	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015996	T	15	13235	13249	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	34668328
32	NC_015996	ATT	4	13874	13884	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015996	TAT	5	13898	13912	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_015996	AAAG	3	14135	14146	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015996	A	15	14562	14576	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_015996	AAT	5	14683	14698	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_015996	A	12	15309	15320	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015996	T	21	15564	15584	21	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015996	T	14	17410	17423	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_015996	TTA	4	17552	17563	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015996	TATGAT	3	18624	18641	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	34668328
42	NC_015996	T	13	19659	19671	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34668328
43	NC_015996	TTCA	3	23766	23777	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34668328
44	NC_015996	GAAT	3	23860	23870	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34668328
45	NC_015996	T	12	24105	24116	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	34668328
46	NC_015996	GTT	4	24735	24746	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34668328
47	NC_015996	ATTC	3	24778	24790	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
48	NC_015996	T	12	27355	27366	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	34668328
49	NC_015996	TCAT	3	28045	28055	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_015996	ATT	4	28296	28306	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_015996	A	16	28431	28446	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015996	T	12	28843	28854	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015996	GGT	4	29866	29876	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_015996	AAAG	3	29877	29888	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_015996	TGAAA	3	30447	30462	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_015996	TA	9	31207	31223	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_015996	TA	6	31242	31253	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_015996	TTTA	3	31870	31881	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015996	TTTA	3	32151	32162	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015996	A	14	32217	32230	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015996	TATTC	3	32444	32458	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
62	NC_015996	TAA	5	32625	32638	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_015996	ATA	4	32936	32946	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_015996	ATATT	3	33941	33955	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_015996	AATT	3	33957	33968	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_015996	TA	6	34058	34068	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_015996	TCTTT	3	34637	34650	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
68	NC_015996	TAAAA	3	35094	35108	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_015996	GAAA	3	37073	37084	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34668329
70	NC_015996	TTGC	3	37474	37484	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	34668329
71	NC_015996	AG	6	38298	38308	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_015996	TA	8	38525	38539	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_015996	A	14	38576	38589	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015996	TC	6	38874	38884	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34668329
75	NC_015996	AT	6	39048	39059	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015996	ATA	4	39168	39180	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_015996	A	16	39192	39207	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015996	TATT	4	39216	39232	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_015996	AT	7	39233	39245	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_015996	ATTT	3	39397	39407	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_015996	ATTC	3	39497	39507	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_015996	TCT	4	40020	40030	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34668329
83	NC_015996	ATG	4	41564	41574	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34668329
84	NC_015996	AATG	3	43057	43068	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34668329
85	NC_015996	GCA	4	43462	43473	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34668329
86	NC_015996	TG	6	43499	43509	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	34668329
87	NC_015996	A	22	45144	45165	22	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
88	NC_015996	TAA	4	45786	45797	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34668329
89	NC_015996	TTCC	3	46279	46290	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34668329
90	NC_015996	A	13	47551	47563	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015996	ATA	4	49165	49176	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_015996	AT	6	49521	49531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_015996	AT	6	49555	49565	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_015996	TATT	3	49792	49802	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_015996	TAT	5	49974	49989	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_015996	A	22	50289	50310	22	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
97	NC_015996	AT	6	50380	50392	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_015996	AT	6	50398	50408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_015996	AT	6	50412	50422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_015996	GAAA	3	50595	50607	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_015996	AT	6	51419	51429	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_015996	TA	11	51847	51867	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_015996	A	13	52309	52321	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_015996	GTCT	3	53497	53508	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	34668329
105	NC_015996	CAA	4	54213	54223	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
106	NC_015996	ATATA	3	54314	54327	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_015996	TA	6	54557	54568	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_015996	TAGA	3	54637	54647	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_015996	T	17	54660	54676	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_015996	TA	13	54676	54700	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_015996	TTTCAT	3	54739	54755	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
112	NC_015996	ATA	4	57837	57847	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34668330
113	NC_015996	TTTC	3	58156	58166	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
114	NC_015996	TGCA	3	59481	59493	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	34668330
115	NC_015996	AATTGA	4	60054	60076	23	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_015996	TA	6	60168	60179	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_015996	TTG	4	60233	60243	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_015996	TAT	4	60301	60313	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_015996	TTA	4	60414	60424	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_015996	T	15	60492	60506	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015996	GTTA	3	60519	60529	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_015996	TA	7	62837	62850	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_015996	TTA	4	63061	63071	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_015996	GATC	3	65005	65016	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_015996	AT	6	65281	65291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34668330
126	NC_015996	AAAT	3	66208	66219	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_015996	T	28	66621	66648	28	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_015996	TA	6	66881	66892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_015996	A	12	67046	67057	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_015996	TTA	4	67058	67069	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_015996	TGTT	3	68374	68384	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_015996	T	13	68391	68403	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015996	CTTT	3	68626	68636	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_015996	A	16	68717	68732	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015996	AAAC	3	68759	68770	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_015996	AT	8	69791	69805	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_015996	AT	6	70094	70104	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_015996	TCTT	3	70592	70603	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_015996	TTTC	3	70609	70620	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
140	NC_015996	A	19	70641	70659	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
141	NC_015996	TA	6	71238	71248	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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255	NC_015996	AT	7	149440	149452	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
256	NC_015996	TATT	3	150333	150343	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
257	NC_015996	CATAC	3	150441	150454	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
258	NC_015996	ATCA	3	152978	152990	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	34668335
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263	NC_015996	TATT	3	155888	155899	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34668335
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267	NC_015996	ATC	4	159103	159113	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	34668335
268	NC_015996	GAA	5	159569	159583	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	34668335

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pyrus pyrifolia chloroplast