ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Marssonina brunnea f. sp. 'multigermtubi' mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015991	ATT	5	1528	1541	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589425
2	NC_015991	AAT	4	1632	1642	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015991	ATA	4	2126	2136	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_015991	TAT	4	2665	2676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589425
5	NC_015991	TAT	4	4948	4958	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_015991	ATT	4	5706	5716	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_015991	TAT	4	9867	9877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_015991	ATA	4	12198	12209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015991	ATT	4	12354	12364	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015991	ATT	4	12400	12410	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015991	AAT	4	13263	13275	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_015991	ATT	4	14611	14622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015991	GTA	5	15261	15275	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_015991	TAT	4	15752	15762	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015991	TTA	5	16469	16483	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589426
16	NC_015991	ATA	4	17054	17065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015991	TAT	4	17908	17919	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015991	ATA	4	19110	19121	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015991	TAA	4	21258	21269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015991	TAA	4	21532	21542	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015991	TAT	8	24764	24786	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015991	TAT	4	26591	26601	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015991	ATA	4	27453	27464	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015991	ATA	4	29294	29304	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_015991	TAA	4	30172	30183	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015991	ATT	5	30477	30491	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_015991	ATT	4	30559	30569	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_015991	CTA	4	31103	31114	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_015991	AGT	4	31972	31983	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015991	TAT	4	33033	33044	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015991	TTA	4	34130	34141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015991	AAT	4	35200	35212	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_015991	TAT	5	37594	37609	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_015991	TAT	4	38586	38597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015991	GCA	18	39936	39989	54	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	34589426
36	NC_015991	TAG	4	40094	40104	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34589426
37	NC_015991	TAA	4	41815	41825	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589426
38	NC_015991	TAT	5	41850	41864	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589426
39	NC_015991	ACT	4	43264	43274	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_015991	AGT	4	43326	43337	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015991	TAT	5	43346	43360	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015991	TTA	4	43873	43884	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_015991	TGG	4	44654	44665	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_015991	ACT	4	48701	48712	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_015991	AGA	4	50529	50540	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_015991	TAA	4	51318	51329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_015991	TAT	4	51761	51772	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_015991	TAA	4	51821	51831	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_015991	TTA	4	56066	56076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_015991	AAT	6	57492	57510	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_015991	GAA	4	58761	58772	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_015991	TAA	4	59215	59226	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_015991	ATA	5	60081	60095	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_015991	TTA	4	61493	61503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589426
55	NC_015991	TTA	4	61757	61768	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_015991	ATA	4	61903	61915	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_015991	TTA	8	64911	64933	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_015991	TAT	4	65103	65115	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_015991	TAT	4	65416	65427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015991	TAA	4	66021	66033	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_015991	ATA	4	66305	66315	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_015991	TAA	4	67849	67860	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_015991	ATT	4	68562	68572	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Marssonina brunnea f. sp. 'multigermtubi' mitochondrion