ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Marssonina brunnea f. sp. 'multigermtubi' mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015991	T	12	175	186	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015991	ATT	5	1528	1541	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589425
3	NC_015991	TA	7	1617	1629	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_015991	AAT	4	1632	1642	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015991	T	13	1764	1776	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015991	T	17	1946	1962	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_015991	ATA	4	2126	2136	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_015991	TAT	4	2665	2676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589425
9	NC_015991	ACAT	3	3978	3988	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015991	TAAG	3	4672	4683	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015991	T	13	4897	4909	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_015991	TAT	4	4948	4958	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015991	TAAA	3	5583	5593	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015991	ATT	4	5706	5716	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015991	TA	6	5945	5955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015991	TA	7	6523	6538	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_015991	TAAA	3	6848	6858	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015991	TA	6	7891	7901	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015991	A	12	9455	9466	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015991	TAT	4	9867	9877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015991	CTAT	3	11400	11411	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015991	ATA	4	12198	12209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015991	A	16	12277	12292	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_015991	A	12	12328	12339	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015991	ATT	4	12354	12364	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015991	ATT	4	12400	12410	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015991	TA	7	12678	12691	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015991	TTTTAT	3	12820	12837	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_015991	TAAA	4	13196	13210	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_015991	AAT	4	13263	13275	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_015991	TA	6	13703	13713	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_015991	ATAC	3	14217	14227	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015991	TA	7	14542	14554	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_015991	ATT	4	14611	14622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015991	TACT	3	14682	14693	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_015991	TTGGT	3	14745	14758	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_015991	TTATA	4	14899	14918	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_015991	GTA	5	15261	15275	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_015991	TTTA	4	15674	15688	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_015991	TAT	4	15752	15762	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015991	CTTT	3	16408	16419	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34589426
42	NC_015991	TTA	5	16469	16483	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589426
43	NC_015991	TA	6	16813	16824	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_015991	TTTC	3	16993	17004	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015991	ATA	4	17054	17065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_015991	ATAG	3	17653	17664	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_015991	TAT	4	17908	17919	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_015991	TTAAAT	3	18091	18107	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_015991	ATA	4	19110	19121	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_015991	TA	6	19707	19717	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_015991	TA	8	20190	20204	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_015991	ATTTT	3	20721	20734	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_015991	TAA	4	21258	21269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_015991	AATT	3	21402	21413	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_015991	TAAA	3	21422	21433	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015991	TAA	4	21532	21542	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_015991	CATA	3	21625	21636	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_015991	AATA	3	22055	22066	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_015991	AGTA	3	22501	22511	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_015991	GTAA	3	22973	22983	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_015991	ACAA	3	23715	23726	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015991	TAAA	3	23727	23738	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015991	T	14	23765	23778	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_015991	TTTA	3	23782	23792	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_015991	TAT	8	24764	24786	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_015991	AT	6	25180	25190	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_015991	TA	7	25382	25394	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_015991	TA	7	26425	26438	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_015991	TAT	4	26591	26601	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_015991	ATA	4	27453	27464	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_015991	A	14	27461	27474	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_015991	AT	6	27647	27657	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589426
73	NC_015991	ATA	4	29294	29304	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_015991	TTTA	3	29552	29563	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_015991	TAA	4	30172	30183	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015991	ATGG	3	30242	30252	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_015991	ATT	5	30477	30491	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_015991	ATT	4	30559	30569	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_015991	AATA	3	30712	30723	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_015991	CTA	4	31103	31114	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
81	NC_015991	AGT	4	31972	31983	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_015991	TAT	4	33033	33044	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_015991	TTTA	3	33190	33202	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_015991	TTA	4	34130	34141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_015991	TATTT	3	34853	34866	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_015991	AT	6	34926	34936	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_015991	AAT	4	35200	35212	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_015991	CTTCAC	3	35516	35533	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
89	NC_015991	TAT	5	37594	37609	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_015991	T	18	37668	37685	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_015991	AC	6	37901	37911	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
92	NC_015991	TA	8	38188	38202	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_015991	TA	6	38464	38474	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_015991	TAT	4	38586	38597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_015991	TA	6	38637	38647	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_015991	AAAC	3	38679	38689	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_015991	ATTTAT	3	39059	39076	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	34589426
98	NC_015991	GCA	18	39936	39989	54	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	34589426
99	NC_015991	TAG	4	40094	40104	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34589426
100	NC_015991	TTAAA	3	41074	41087	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_015991	TAA	4	41815	41825	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589426
102	NC_015991	TAT	5	41850	41864	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589426
103	NC_015991	TTTA	3	43102	43113	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015991	ACT	4	43264	43274	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_015991	AGT	4	43326	43337	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_015991	TAT	5	43346	43360	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015991	T	12	43546	43557	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015991	TTA	4	43873	43884	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_015991	TAAA	3	44465	44476	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015991	TGG	4	44654	44665	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_015991	A	12	45969	45980	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_015991	TTTG	3	46138	46148	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_015991	TGGTT	3	47754	47767	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	34589426
114	NC_015991	ACT	4	48701	48712	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_015991	AGA	4	50529	50540	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_015991	TAAAT	3	51156	51169	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_015991	TAA	4	51318	51329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_015991	TTAT	4	51474	51489	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_015991	TAT	4	51761	51772	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_015991	TAA	4	51821	51831	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_015991	GTAG	3	51840	51850	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_015991	AAAT	3	52031	52041	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_015991	AT	9	52710	52726	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
124	NC_015991	TAAA	3	53227	53239	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_015991	T	16	55368	55383	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_015991	TTA	4	56066	56076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_015991	AAT	6	57492	57510	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
128	NC_015991	AGAA	3	58745	58755	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_015991	GAA	4	58761	58772	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_015991	AGAA	3	58808	58818	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_015991	A	12	59018	59029	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_015991	TA	6	59058	59068	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_015991	TAA	4	59215	59226	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_015991	C	12	59234	59245	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015991	TTAA	3	59527	59539	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_015991	TAAA	3	59736	59747	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_015991	ATA	5	60081	60095	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_015991	GGTGTA	3	60826	60843	18	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	5 %	34589426
139	NC_015991	TTA	4	61493	61503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589426
140	NC_015991	AT	9	61564	61580	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
141	NC_015991	TTA	4	61757	61768	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_015991	ATA	4	61903	61915	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_015991	GTTA	3	62417	62428	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	34589426
144	NC_015991	TAAA	3	63833	63845	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_015991	TTA	8	64911	64933	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_015991	TAT	4	65103	65115	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
147	NC_015991	TAT	4	65416	65427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_015991	TAA	4	66021	66033	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_015991	ATA	4	66305	66315	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
150	NC_015991	A	14	67830	67843	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
151	NC_015991	TAA	4	67849	67860	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_015991	ACTA	3	68277	68287	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
153	NC_015991	GTTTAA	3	68393	68410	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
154	NC_015991	ATT	4	68562	68572	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_015991	ATTT	3	68951	68962	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_015991	AATG	3	69393	69403	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Marssonina brunnea f. sp. 'multigermtubi' mitochondrion