ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Argynnis hyperbius mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015988	TTTAT	3	125	139	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_015988	TTATTT	3	241	258	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	34589423
3	NC_015988	TCTA	3	316	328	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	34589423
4	NC_015988	ATTT	3	464	474	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34589423
5	NC_015988	ATT	4	532	544	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589423
6	NC_015988	AATT	3	786	796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589423
7	NC_015988	ATTT	3	865	876	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589423
8	NC_015988	TTTAAT	3	928	945	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	34589423
9	NC_015988	ATTA	4	1026	1040	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589423
10	NC_015988	AGG	4	2111	2122	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	34589423
11	NC_015988	AATTAT	3	2837	2854	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589423
12	NC_015988	ATT	4	2883	2893	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589423
13	NC_015988	CATTA	3	3327	3340	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	34589423
14	NC_015988	AATT	3	3712	3722	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589423
15	NC_015988	T	17	3897	3913	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	34589423
16	NC_015988	ATT	4	3941	3951	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589423
17	NC_015988	T	14	4246	4259	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34589423
18	NC_015988	TAT	4	5098	5109	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589423
19	NC_015988	AT	6	5361	5371	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589423
20	NC_015988	TATTTA	3	5484	5502	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_015988	TAA	4	5557	5568	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589423
22	NC_015988	ATT	5	5577	5591	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589423
23	NC_015988	ATTT	3	5803	5814	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589423
24	NC_015988	ATA	4	6318	6329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589423
25	NC_015988	TAAA	3	6352	6363	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	34589423
26	NC_015988	TAA	4	6412	6425	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589423
27	NC_015988	AAAT	3	6898	6909	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34589423
28	NC_015988	TTA	4	7177	7188	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589423
29	NC_015988	TAA	4	7286	7297	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589423
30	NC_015988	AT	6	7301	7314	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589423
31	NC_015988	AATT	3	7316	7327	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589423
32	NC_015988	AAT	4	7466	7478	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589423
33	NC_015988	TAAA	3	7520	7530	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589423
34	NC_015988	TAA	4	7720	7732	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589423
35	NC_015988	TAAA	3	7760	7771	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	34589423
36	NC_015988	A	12	7998	8009	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	34589423
37	NC_015988	ATATAA	3	8243	8260	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34589423
38	NC_015988	ATA	5	8896	8909	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589423
39	NC_015988	AT	6	8929	8941	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589423
40	NC_015988	A	15	9098	9112	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	34589423
41	NC_015988	AATAA	4	9159	9178	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	34589423
42	NC_015988	ATAAAT	3	9354	9371	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	34589423
43	NC_015988	TAT	4	9419	9430	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	34589423
44	NC_015988	AT	7	9561	9575	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589423
45	NC_015988	ATT	4	9577	9589	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589423
46	NC_015988	ATT	4	9836	9847	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_015988	TTTA	3	10058	10069	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	34589424
48	NC_015988	ATT	4	10149	10160	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	34589424
49	NC_015988	TTTTAA	3	10189	10207	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	34589424
50	NC_015988	AAAT	3	10213	10223	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589424
51	NC_015988	TAT	4	10234	10244	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589424
52	NC_015988	TAA	6	10303	10320	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34589424
53	NC_015988	TTTA	3	10321	10332	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589424
54	NC_015988	TA	6	10564	10574	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589424
55	NC_015988	T	14	10672	10685	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34589424
56	NC_015988	TTA	7	10758	10777	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	34589424
57	NC_015988	ATTT	3	10953	10963	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34589424
58	NC_015988	TTA	4	10997	11008	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589424
59	NC_015988	AATTTT	3	11299	11316	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	34589424
60	NC_015988	TTA	7	11394	11413	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	34589424
61	NC_015988	ATT	4	11490	11500	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589424
62	NC_015988	TAAT	3	11545	11556	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	34589424
63	NC_015988	A	12	11759	11770	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	34589424
64	NC_015988	ATA	5	11826	11841	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34589424
65	NC_015988	AAATAT	3	12011	12029	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	34589424
66	NC_015988	TAT	4	12553	12565	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589424
67	NC_015988	T	14	12848	12861	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_015988	ATA	4	12996	13007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_015988	TAT	4	13041	13052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_015988	TTA	4	13258	13269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_015988	ATATTT	3	13344	13361	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_015988	AAATTT	3	13616	13633	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_015988	TTA	4	13752	13764	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_015988	ATTT	3	13877	13888	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_015988	TTTA	3	13948	13959	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015988	AAATT	3	14520	14534	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_015988	TAATT	3	14601	14615	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015988	ATTA	6	14707	14729	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_015988	ATA	4	14808	14819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_015988	T	25	14831	14855	25	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_015988	ATTA	4	15022	15037	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_015988	AT	12	15041	15063	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_015988	TA	11	15090	15110	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_015988	TATAA	3	15140	15153	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Argynnis hyperbius mitochondrion