ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cnaphalocrocis medinalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015985	TTA	5	721	736	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	34589418
2	NC_015985	ATT	4	981	992	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34589418
3	NC_015985	ATT	4	1051	1063	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	34589418
4	NC_015985	TTA	4	1097	1108	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34589418
5	NC_015985	TAA	4	1362	1374	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_015985	CTT	4	2110	2122	13	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	34589418
7	NC_015985	ATT	4	3380	3390	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	34589419
8	NC_015985	ATA	4	3520	3531	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34589419
9	NC_015985	ATA	4	4071	4081	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34589419
10	NC_015985	AAT	5	4100	4114	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34589419
11	NC_015985	TAT	6	5943	5959	17	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	34589419
12	NC_015985	ATT	4	6469	6479	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	34589419
13	NC_015985	TAT	4	7227	7237	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	34589419
14	NC_015985	AAT	4	7623	7634	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34589419
15	NC_015985	TAA	4	7877	7889	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	34589419
16	NC_015985	ATA	4	8107	8117	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34589419
17	NC_015985	TAA	4	8321	8335	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34589419
18	NC_015985	TAA	4	9220	9232	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	34589419
19	NC_015985	ATT	4	9576	9587	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34589419
20	NC_015985	ATT	5	10000	10014	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_015985	TAA	7	10466	10486	21	66.67 %	33.33 %	0 %	4 %	34589419
22	NC_015985	ATT	4	10936	10946	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	34589419
23	NC_015985	TAA	5	11153	11167	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34589419
24	NC_015985	TAT	4	11280	11291	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34589419
25	NC_015985	ATA	4	13224	13234	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015985	TAT	5	13272	13287	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_015985	ATT	4	14524	14535	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015985	ATT	4	14955	14967	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cnaphalocrocis medinalis mitochondrion