ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis melo subsp. melo chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015983	CAG	4	871	882	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34657817
2	NC_015983	TCT	4	3082	3093	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34657817
3	NC_015983	AAT	4	3541	3553	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_015983	TAA	4	4582	4593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015983	TAT	4	7363	7375	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_015983	AAT	4	7373	7384	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015983	TTA	4	9428	9440	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_015983	GTT	4	24536	24547	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34657818
9	NC_015983	CAA	4	28001	28012	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015983	AAT	4	29817	29828	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015983	ATA	4	30165	30175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015983	TAT	5	30244	30258	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_015983	ATT	4	32890	32900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015983	TTA	4	33878	33889	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015983	TAT	4	34027	34037	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015983	ATG	4	40897	40907	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34657819
17	NC_015983	GCA	4	42795	42806	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34657819
18	NC_015983	ATA	4	48903	48915	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_015983	AAT	4	51028	51039	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015983	TTA	4	53516	53527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015983	TAG	4	62806	62816	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015983	TAT	6	64958	64975	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_015983	ATA	4	67635	67649	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_015983	AAC	4	68290	68301	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015983	GAA	4	70365	70376	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015983	CAT	4	72203	72214	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34657821
27	NC_015983	AGT	4	73582	73593	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34657821
28	NC_015983	TCT	4	75776	75787	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34657821
29	NC_015983	TGA	4	76941	76952	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34657821
30	NC_015983	TCT	4	83797	83807	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34657821
31	NC_015983	TAT	4	83969	83979	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34657821
32	NC_015983	TTA	4	84614	84625	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34657821
33	NC_015983	CTT	4	86451	86462	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34657821
34	NC_015983	GAT	4	86919	86929	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34657821
35	NC_015983	ATA	4	110884	110895	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34657823
36	NC_015983	ATT	4	112866	112878	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34657823
37	NC_015983	ATT	4	115718	115729	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34657823
38	NC_015983	TTC	5	121992	122006	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	34657823
39	NC_015983	ATA	4	122384	122394	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34657823
40	NC_015983	AAT	4	126151	126162	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34657823
41	NC_015983	TAG	4	129442	129453	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34657823
42	NC_015983	ATA	4	130076	130086	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34657823
43	NC_015983	ATT	4	131458	131469	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34657823
44	NC_015983	ATC	4	155423	155433	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	34657825
45	NC_015983	GAA	5	155889	155903	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	34657825

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cucumis melo subsp. melo chloroplast