ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ichthyophthirius multifiliis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015981	TAA	4	173	184	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015981	TAA	4	398	409	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015981	TAA	4	623	634	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015981	TAAA	3	993	1004	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015981	TA	9	1219	1235	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_015981	TTAAT	3	1237	1251	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_015981	TTATTT	3	1330	1347	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_015981	T	13	1364	1376	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015981	TTTTC	3	1658	1672	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
10	NC_015981	ACTT	3	2137	2147	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015981	CAG	4	2273	2283	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015981	CT	6	2488	2498	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015981	ATTTAT	3	2676	2693	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_015981	CATTTA	3	2715	2733	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
15	NC_015981	AT	6	3171	3183	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015981	TA	7	3237	3250	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_015981	TAT	4	3721	3731	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589411
18	NC_015981	TAA	4	3914	3926	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589411
19	NC_015981	AATT	3	4055	4067	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589411
20	NC_015981	ATAAAA	3	4292	4309	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	34589411
21	NC_015981	AAT	5	4335	4350	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34589411
22	NC_015981	AT	6	4598	4608	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589411
23	NC_015981	TTAAAT	3	4839	4857	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	34589411
24	NC_015981	AT	6	5015	5025	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589411
25	NC_015981	AT	9	5028	5045	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589411
26	NC_015981	A	12	5044	5055	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	34589411
27	NC_015981	TA	6	5186	5197	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589411
28	NC_015981	TAAA	3	5396	5406	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015981	AATT	3	5439	5450	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589412
30	NC_015981	TTTA	3	5664	5675	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589412
31	NC_015981	T	26	5709	5734	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34589412
32	NC_015981	T	12	6050	6061	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	34589412
33	NC_015981	ATTT	3	6316	6326	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34589412
34	NC_015981	ATTT	4	6370	6385	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	34589412
35	NC_015981	A	13	6474	6486	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	34589412
36	NC_015981	ATTT	5	6636	6655	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	34589412
37	NC_015981	T	16	6669	6684	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	34589412
38	NC_015981	T	13	6832	6844	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	34589412
39	NC_015981	TAAA	3	7195	7205	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589412
40	NC_015981	TTAA	3	7401	7412	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589412
41	NC_015981	ATTTAT	3	7450	7467	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	34589412
42	NC_015981	ATATT	3	7482	7495	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	34589412
43	NC_015981	GTA	4	7569	7579	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34589412
44	NC_015981	TAT	4	7804	7814	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589412
45	NC_015981	TAT	4	8203	8214	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589412
46	NC_015981	TA	6	8805	8815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589412
47	NC_015981	A	12	8896	8907	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	34589412
48	NC_015981	AT	9	9037	9053	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589412
49	NC_015981	A	12	9129	9140	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	34589412
50	NC_015981	ATA	4	9171	9181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589412
51	NC_015981	AAAT	3	9352	9362	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589412
52	NC_015981	TTAT	3	9973	9984	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589412
53	NC_015981	CAC	4	10129	10140	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	0 %	34589412
54	NC_015981	T	15	10352	10366	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	34589412
55	NC_015981	TA	8	10425	10440	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589412
56	NC_015981	AATT	3	10531	10542	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589412
57	NC_015981	TAT	4	10752	10764	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34589412
58	NC_015981	ATAA	4	10838	10854	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	34589412
59	NC_015981	GCAT	3	11324	11336	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	34589412
60	NC_015981	ATT	4	11700	11711	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	34589412
61	NC_015981	TAAA	3	11793	11805	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	34589412
62	NC_015981	ATA	6	11850	11866	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34589412
63	NC_015981	ATA	4	11917	11927	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589412
64	NC_015981	AAT	4	11930	11941	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34589412
65	NC_015981	CAT	4	12105	12115	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	34589412
66	NC_015981	AT	9	12261	12278	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589413
67	NC_015981	TAAATA	3	12317	12334	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34589413
68	NC_015981	TATT	3	12347	12358	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589413
69	NC_015981	AAAT	3	12377	12387	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589413
70	NC_015981	TA	12	12609	12630	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
71	NC_015981	ATTT	3	12861	12872	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589413
72	NC_015981	AAAT	3	13406	13417	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34589413
73	NC_015981	T	15	13511	13525	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	34589413
74	NC_015981	ATT	5	13658	13672	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589413
75	NC_015981	ATAA	3	13909	13920	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34589413
76	NC_015981	A	15	13992	14006	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	34589413
77	NC_015981	TATT	3	14145	14156	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_015981	TTAA	3	14319	14330	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589413
79	NC_015981	AT	7	14421	14434	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589413
80	NC_015981	TTTA	3	14464	14474	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34589413
81	NC_015981	ATT	5	14506	14520	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589413
82	NC_015981	ATA	4	14552	14564	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589413
83	NC_015981	AAAT	5	14556	14576	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589413
84	NC_015981	A	15	14675	14689	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	34589413
85	NC_015981	TA	10	14693	14715	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589413
86	NC_015981	TA	6	15077	15087	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
87	NC_015981	ATATT	3	15355	15368	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	34589413
88	NC_015981	ATT	4	15375	15386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589413
89	NC_015981	AT	6	15457	15467	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
90	NC_015981	TTAA	3	15578	15589	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589413
91	NC_015981	TA	6	15593	15603	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
92	NC_015981	TA	6	15967	15977	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
93	NC_015981	AAAT	3	15979	15990	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34589413
94	NC_015981	ATT	4	16008	16019	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34589413
95	NC_015981	TAAAA	3	16031	16045	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	34589413
96	NC_015981	A	14	16070	16083	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	34589413
97	NC_015981	TA	6	16108	16118	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
98	NC_015981	AT	6	16202	16213	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589413
99	NC_015981	TTTA	3	16457	16467	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34589413
100	NC_015981	TAAAAA	3	16505	16522	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	34589413
101	NC_015981	TTAT	3	16599	16609	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34589413
102	NC_015981	AT	6	16636	16646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589413
103	NC_015981	TA	7	17107	17122	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_015981	TAAA	3	17437	17447	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589413
105	NC_015981	TTTC	3	17632	17642	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34589413
106	NC_015981	TA	7	17674	17686	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589413
107	NC_015981	A	14	18208	18221	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	34589413
108	NC_015981	ATATT	3	18303	18317	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	34589413
109	NC_015981	TAAAAT	3	18514	18531	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34589413
110	NC_015981	AT	7	18534	18546	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34589413
111	NC_015981	AT	7	18673	18687	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589413
112	NC_015981	ATA	5	18768	18781	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34589413
113	NC_015981	AT	7	19078	19092	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34589413
114	NC_015981	ATAA	3	19188	19199	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34589413
115	NC_015981	ATA	4	19307	19317	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589413
116	NC_015981	TATAAT	3	19528	19544	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589413
117	NC_015981	TAA	4	19618	19628	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589413
118	NC_015981	TTTTA	3	19662	19676	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	34589413
119	NC_015981	TTTA	3	19871	19882	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34589414
120	NC_015981	T	12	20386	20397	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	34589414
121	NC_015981	TTA	4	20565	20575	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34589414
122	NC_015981	TGTT	3	20708	20719	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	34589414
123	NC_015981	AATA	3	20829	20839	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34589414
124	NC_015981	ATATA	3	21022	21035	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	34589414
125	NC_015981	TA	6	21040	21050	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
126	NC_015981	ATATTA	3	21073	21090	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34589414
127	NC_015981	TAA	4	21142	21153	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	34589414
128	NC_015981	TAAA	3	21170	21181	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34589414
129	NC_015981	ATT	5	21559	21574	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34589414
130	NC_015981	AATT	3	21613	21624	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34589414
131	NC_015981	TAA	4	21685	21695	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34589414
132	NC_015981	ATTTT	3	21836	21849	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	34589414
133	NC_015981	AT	6	21878	21888	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34589414
134	NC_015981	T	13	22405	22417	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34589414
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ichthyophthirius multifiliis mitochondrion