ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sporothrix schenckii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015923	ATT	4	1082	1093	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015923	TTA	4	2979	2990	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015923	AAAGAA	3	3110	3128	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_015923	ATA	4	3534	3544	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34319824
5	NC_015923	AAATT	3	3546	3560	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	34319824
6	NC_015923	ATA	4	3790	3801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34319824
7	NC_015923	ATA	4	4517	4528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015923	CATT	3	5938	5948	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	34319824
9	NC_015923	TAT	4	6041	6053	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34319824
10	NC_015923	TA	6	6147	6157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34319824
11	NC_015923	TTA	4	6224	6234	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34319824
12	NC_015923	ATA	4	7182	7192	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34319824
13	NC_015923	TAT	4	7244	7256	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34319824
14	NC_015923	TATAT	3	7335	7348	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	34319824
15	NC_015923	AGTT	3	7554	7564	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	34319824
16	NC_015923	TA	7	7906	7918	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_015923	AGAAAA	3	8158	8175	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_015923	TTGT	3	8838	8848	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015923	AT	6	8874	8884	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015923	AT	7	8887	8899	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015923	TAT	4	8964	8975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015923	TA	6	9037	9047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015923	TAT	5	9260	9275	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34319824
24	NC_015923	TTTA	3	10744	10755	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34319824
25	NC_015923	ATA	6	11024	11040	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34319824
26	NC_015923	ATT	4	11415	11426	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34319824
27	NC_015923	TTA	5	12334	12348	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34319824
28	NC_015923	GTTA	3	12714	12725	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	34319824
29	NC_015923	TTTA	3	12759	12771	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	34319824
30	NC_015923	GTTT	3	13211	13222	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	34319824
31	NC_015923	AAAT	3	13638	13649	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	34319824
32	NC_015923	GAATTA	3	14760	14778	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	34319824
33	NC_015923	TAT	5	15672	15686	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34319824
34	NC_015923	TAA	4	16518	16530	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34319824
35	NC_015923	ATTT	4	16686	16701	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	34319824
36	NC_015923	AT	16	16702	16733	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015923	ATT	4	16734	16744	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_015923	ATA	4	16801	16811	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_015923	TAT	4	16843	16854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015923	AAT	5	17886	17900	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34319825
41	NC_015923	TAAA	3	18046	18057	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015923	TA	6	18215	18225	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34319825
43	NC_015923	TA	6	18309	18320	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34319825
44	NC_015923	AAT	4	18336	18347	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34319825
45	NC_015923	ATT	4	18462	18472	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34319825
46	NC_015923	TTA	4	18502	18513	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34319825
47	NC_015923	ATT	4	18585	18596	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34319825
48	NC_015923	ATT	4	18681	18692	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34319825
49	NC_015923	AATT	3	19535	19546	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_015923	A	13	19572	19584	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_015923	TTTA	3	19606	19616	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34319825
52	NC_015923	TTC	4	20469	20480	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34319825
53	NC_015923	TA	8	20672	20687	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_015923	AT	7	21327	21339	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_015923	TTAA	3	22256	22267	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_015923	AT	8	22397	22412	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_015923	TTA	4	23139	23149	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34319825
58	NC_015923	AT	6	23561	23572	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_015923	TTTAA	3	23727	23741	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_015923	TA	7	23816	23832	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_015923	TAA	4	24669	24680	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34319825
62	NC_015923	ATT	4	24754	24764	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34319825
63	NC_015923	AATT	3	25527	25538	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_015923	TTTTA	3	26098	26111	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	34319825
65	NC_015923	GAAT	3	26128	26139	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34319825
66	NC_015923	TAA	4	26243	26254	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34319825
67	NC_015923	TAA	4	26324	26335	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34319825
68	NC_015923	TAA	4	26485	26496	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34319825
69	NC_015923	TTAT	3	26631	26642	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sporothrix schenckii mitochondrion