ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pieris rapae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015895	ATTT	3	226	237	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015895	T	14	271	284	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34224029
3	NC_015895	TTAA	3	955	965	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34224029
4	NC_015895	ATT	4	1018	1030	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34224029
5	NC_015895	AT	8	1046	1060	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34224029
6	NC_015895	TAT	4	1934	1945	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224029
7	NC_015895	AGG	4	2099	2110	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	34224029
8	NC_015895	ATT	4	2650	2661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224029
9	NC_015895	ATA	5	2832	2846	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34224029
10	NC_015895	TCAA	3	2856	2866	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	34224029
11	NC_015895	T	26	3883	3908	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34224029
12	NC_015895	TTTA	3	3914	3924	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34224029
13	NC_015895	TAATTT	3	3944	3961	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	34224029
14	NC_015895	ATTT	3	4348	4360	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	34224030
15	NC_015895	ATT	4	4833	4843	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224029
16	NC_015895	T	15	4965	4979	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	34224029
17	NC_015895	TAA	4	5145	5157	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34224029
18	NC_015895	AACA	3	5359	5370	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	34224029
19	NC_015895	TAAT	5	5473	5493	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34224029
20	NC_015895	TAT	4	5843	5854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224029
21	NC_015895	ATAA	3	6517	6528	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34224029
22	NC_015895	ATA	4	6750	6761	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224029
23	NC_015895	A	13	6893	6905	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	34224029
24	NC_015895	TAAA	3	7104	7114	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34224029
25	NC_015895	TTA	4	7179	7190	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224029
26	NC_015895	TAAA	4	7522	7536	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	34224029
27	NC_015895	AGA	4	7825	7835	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34224029
28	NC_015895	AAATAT	3	7958	7974	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34224029
29	NC_015895	AAATAA	3	7990	8007	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	34224029
30	NC_015895	ATT	4	8029	8040	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015895	ATA	4	8170	8182	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34224029
32	NC_015895	ATT	4	8286	8297	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224029
33	NC_015895	TA	7	8926	8940	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34224029
34	NC_015895	AAAT	3	9011	9021	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34224029
35	NC_015895	AAAAT	3	9100	9113	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	34224029
36	NC_015895	TAA	4	9173	9184	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224029
37	NC_015895	TAAA	3	9598	9608	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	34224029
38	NC_015895	ATT	5	9827	9841	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_015895	AAT	4	9874	9885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224029
40	NC_015895	CTTT	3	9886	9897	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34224029
41	NC_015895	ATTA	3	9934	9944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34224029
42	NC_015895	TTTA	3	10045	10056	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	34224029
43	NC_015895	GAAAT	3	10202	10215	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	34224029
44	NC_015895	TTTA	3	10228	10238	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	34224029
45	NC_015895	TAA	5	10287	10301	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34224029
46	NC_015895	ATT	4	10301	10313	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34224029
47	NC_015895	ATT	5	10744	10757	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34224030
48	NC_015895	TAA	4	10760	10771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224030
49	NC_015895	TTA	4	10984	10995	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224030
50	NC_015895	TAT	4	11382	11392	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224030
51	NC_015895	TAAT	3	11523	11534	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	34224030
52	NC_015895	AAAT	3	11744	11756	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	34224030
53	NC_015895	A	15	12208	12222	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	34224030
54	NC_015895	ATA	4	12237	12248	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224030
55	NC_015895	AAT	4	12307	12318	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	34224030
56	NC_015895	AATT	3	12676	12686	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_015895	AAAAAT	3	12979	12997	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
58	NC_015895	ATT	4	13008	13019	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_015895	TTTA	3	13296	13307	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015895	TAT	4	13488	13499	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_015895	TAATTA	3	13941	13958	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_015895	ATT	4	14157	14169	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_015895	T	24	14798	14821	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_015895	AAT	4	14911	14922	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_015895	TA	8	14963	14978	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_015895	AT	13	15037	15061	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pieris rapae mitochondrion