Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015893GTAC4247624901525 %25 %25 %25 %6 %Non-Coding
2NC_015893AGCT3348734981225 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
3NC_015893ACGT8611461453225 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
4NC_015893AATT3799680071250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_015893TACG510967109882225 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
6NC_015893TAAA311170111811275 %25 %0 %0 %8 %34224027
7NC_015893ATTT313022130331225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_015893TAAA313452134631275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_015893TAAT314268142781150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_015893TAGC314718147281125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
11NC_015893ATGT315032150431225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
12NC_015893GTAC315176151881325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
13NC_015893ACGT315313153241225 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
14NC_015893CGGT31567015681120 %25 %50 %25 %8 %Non-Coding
15NC_015893ACGT417113171271525 %25 %25 %25 %6 %Non-Coding
16NC_015893GTAC718390184152625 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
17NC_015893TTTA319990200001125 %75 %0 %0 %9 %34224027
18NC_015893GATG322314223241125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
19NC_015893TAAT323182231931250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_015893GGGT42334023355160 %25 %75 %0 %6 %Non-Coding
21NC_015893CGTA324772247831225 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
22NC_015893TTTA324922249331225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_015893AAAT325102251131275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_015893TACG325358253691225 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
25NC_015893AGTT327726277361125 %50 %25 %0 %9 %34224027
26NC_015893TGAA329772297831250 %25 %25 %0 %8 %34224027
27NC_015893AAAT331471314821275 %25 %0 %0 %8 %34224027
28NC_015893ACAA332590326021375 %0 %0 %25 %7 %34224027
29NC_015893TTTA334365343751125 %75 %0 %0 %9 %34224027
30NC_015893ATTC335253352631125 %50 %0 %25 %9 %34224027
31NC_015893CTGG33690936920120 %25 %50 %25 %8 %34224027
32NC_015893TACG942228422613425 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
33NC_015893TAAA346116461261175 %25 %0 %0 %9 %34224028
34NC_015893GGCT44708147096160 %25 %50 %25 %6 %34224028
35NC_015893ACAA347160471711275 %0 %0 %25 %8 %34224028
36NC_015893TAAA348320483301175 %25 %0 %0 %9 %34224028
37NC_015893TAGA350420504301150 %25 %25 %0 %9 %34224028
38NC_015893TAGC350498505091225 %25 %25 %25 %8 %34224028
39NC_015893GCAA350510505211250 %0 %25 %25 %8 %34224028
40NC_015893TTAA352694527051250 %50 %0 %0 %8 %34224028
41NC_015893TATT453380533941525 %75 %0 %0 %6 %34224028
42NC_015893AAAT353975539861275 %25 %0 %0 %8 %34224028
43NC_015893TAAA457157571721675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
44NC_015893ACGT557285573042025 %25 %25 %25 %5 %Non-Coding
45NC_015893AATT357562575731250 %50 %0 %0 %8 %34224028
46NC_015893TTAT558253582732125 %75 %0 %0 %4 %34224028
47NC_015893CCAT359338593481125 %25 %0 %50 %9 %34224028
48NC_015893AATT361987619971150 %50 %0 %0 %9 %34224028
49NC_015893AGTT362851628631325 %50 %25 %0 %7 %34224028
50NC_015893CTTT36328663297120 %75 %0 %25 %8 %34224028
51NC_015893TACG365154651661325 %25 %25 %25 %7 %34224028
52NC_015893TAAA366262662721175 %25 %0 %0 %9 %34224028
53NC_015893TGAG366340663521325 %25 %50 %0 %7 %34224028
54NC_015893ATTA367612676231250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
55NC_015893CTCA371969719801225 %25 %0 %50 %8 %34224028
56NC_015893GGAA373580735901150 %0 %50 %0 %9 %34224028
57NC_015893AAAT374176741871275 %25 %0 %0 %8 %34224028
58NC_015893AATG374188741981150 %25 %25 %0 %9 %34224028
59NC_015893CCTA374252742631225 %25 %0 %50 %8 %34224028
60NC_015893TTAC376687766971125 %50 %0 %25 %9 %34224028
61NC_015893TAAA377589775991175 %25 %0 %0 %9 %34224028
62NC_015893GATT381002810121125 %50 %25 %0 %9 %34224028
63NC_015893TTTA381495815051125 %75 %0 %0 %9 %34224028
64NC_015893GATT483995840101625 %50 %25 %0 %6 %34224028
65NC_015893AAAT386170861811275 %25 %0 %0 %8 %34224028
66NC_015893AAAT387856878661175 %25 %0 %0 %9 %34224028
67NC_015893TAAT491586916011650 %50 %0 %0 %6 %34224028
68NC_015893CTGG39791297923120 %25 %50 %25 %8 %34224028
69NC_015893TTAG397967979781225 %50 %25 %0 %8 %34224028
70NC_015893TACA398468984781150 %25 %0 %25 %9 %34224028
71NC_015893CAAT398989990001250 %25 %0 %25 %8 %34224028
72NC_015893TACG81013861014163125 %25 %25 %25 %3 %34224028
73NC_015893CTGG10101554101593400 %25 %50 %25 %5 %34224028
74NC_015893ATTT31028801028911225 %75 %0 %0 %8 %34224028
75NC_015893ACGT161040841041456225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
76NC_015893TGCA41042081042231625 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
77NC_015893TTAG31044881044981125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
78NC_015893ATTT31046061046161125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
79NC_015893ATTA31046351046461250 %50 %0 %0 %8 %34224028
80NC_015893AATT31051641051741150 %50 %0 %0 %9 %34224028
81NC_015893TATT31052731052841225 %75 %0 %0 %0 %34224028
82NC_015893TTTA31062841062941125 %75 %0 %0 %9 %34224028
83NC_015893GTAA31069961070061150 %25 %25 %0 %9 %34224028
84NC_015893ATAC31070071070181250 %25 %0 %25 %8 %34224028
85NC_015893ATAA31070731070841275 %25 %0 %0 %8 %34224028
86NC_015893GTAC91081401081733425 %25 %25 %25 %5 %Non-Coding
87NC_015893CAAT31088371088471150 %25 %0 %25 %9 %34224028
88NC_015893ATTC31096241096351225 %50 %0 %25 %8 %34224028
89NC_015893GTAC41123321123471625 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
90NC_015893CGTA51125011125242425 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
91NC_015893TACG41125951126101625 %25 %25 %25 %6 %Non-Coding
92NC_015893CAAA41145111145261675 %0 %0 %25 %6 %34224028
93NC_015893ATTT41161141161291625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
94NC_015893AAAT31161931162041275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
95NC_015893AATG31170381170481150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
96NC_015893TAAG31193731193851350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
97NC_015893TACT71267001267262725 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
98NC_015893ATAA41269991270141675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding