ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015893	TAT	4	71	82	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015893	ATC	4	190	201	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015893	CTG	4	213	224	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015893	GAA	4	384	396	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015893	TGG	4	1338	1349	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015893	ATC	4	1520	1531	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015893	TAT	4	4468	4479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224027
8	NC_015893	ATA	6	4909	4926	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34224027
9	NC_015893	TTC	4	5065	5076	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34224027
10	NC_015893	TTA	4	5095	5106	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224027
11	NC_015893	TAC	5	5705	5719	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
12	NC_015893	TAA	4	9246	9257	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015893	TAT	5	10282	10296	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_015893	TTA	6	10664	10680	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_015893	AAT	9	11117	11143	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34224027
16	NC_015893	ATA	6	11184	11200	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	34224027
17	NC_015893	TAA	4	11461	11472	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224027
18	NC_015893	CAG	19	14640	14695	56	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015893	CTG	4	14706	14717	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015893	GCA	5	15453	15467	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
21	NC_015893	GTA	4	15655	15666	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015893	TAT	4	18937	18947	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224027
23	NC_015893	TTA	4	19603	19613	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224027
24	NC_015893	TAT	4	20194	20206	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34224027
25	NC_015893	ATA	4	20417	20428	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224027
26	NC_015893	TAT	4	22004	22015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224027
27	NC_015893	GCT	4	22263	22274	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015893	TAT	4	23013	23024	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_015893	TAT	4	23604	23615	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015893	CAG	4	24522	24533	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015893	TAT	20	24828	24885	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015893	TAA	4	27346	27356	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34224027
33	NC_015893	TTG	4	27964	27974	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34224027
34	NC_015893	TGT	5	30885	30899	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34224027
35	NC_015893	AGT	4	32683	32693	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34224027
36	NC_015893	GCT	4	32741	32752	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34224027
37	NC_015893	TAT	6	33332	33349	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	34224027
38	NC_015893	TAA	4	33370	33381	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224027
39	NC_015893	TAA	4	33449	33460	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224027
40	NC_015893	AGT	4	34453	34464	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34224027
41	NC_015893	AAT	4	34697	34708	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224027
42	NC_015893	TAA	5	35429	35444	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34224027
43	NC_015893	GTA	8	35602	35625	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	34224027
44	NC_015893	TTA	4	36422	36433	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224027
45	NC_015893	TAG	23	38248	38317	70	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	4 %	Non-Coding
46	NC_015893	TAT	4	40306	40317	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_015893	TAT	4	41650	41661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_015893	TGC	4	41809	41820	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015893	AAT	7	42716	42736	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015893	ATT	4	43574	43585	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224028
51	NC_015893	TAA	4	43998	44010	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34224028
52	NC_015893	TAA	4	44551	44562	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
53	NC_015893	TAG	11	45640	45671	32	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	3 %	34224028
54	NC_015893	TCA	4	45706	45717	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34224028
55	NC_015893	TTA	4	46045	46055	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224028
56	NC_015893	AGA	4	46562	46572	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34224028
57	NC_015893	TAG	13	46943	46981	39	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	2 %	34224028
58	NC_015893	AAT	6	48397	48414	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	34224028
59	NC_015893	AGT	5	49612	49626	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	34224028
60	NC_015893	ATA	5	51080	51093	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34224028
61	NC_015893	TTA	4	51579	51589	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224028
62	NC_015893	TAG	4	51676	51687	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34224028
63	NC_015893	TAG	21	52510	52570	61	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34224028
64	NC_015893	ACT	4	53548	53559	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34224028
65	NC_015893	CAG	6	53650	53667	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224028
66	NC_015893	ATT	4	54237	54247	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224028
67	NC_015893	ATT	4	55127	55137	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224028
68	NC_015893	CTG	4	56599	56610	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34224028
69	NC_015893	CTG	4	56893	56903	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_015893	ATA	4	57418	57428	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_015893	TAA	4	60879	60890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
72	NC_015893	AAT	4	62016	62028	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34224028
73	NC_015893	TAC	4	63429	63440	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34224028
74	NC_015893	TAG	12	63435	63469	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34224028
75	NC_015893	ATA	4	63734	63745	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
76	NC_015893	TAA	4	64808	64819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
77	NC_015893	ATA	4	67094	67106	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_015893	TAT	4	67568	67579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_015893	ATT	4	67704	67716	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_015893	TTA	4	68690	68701	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_015893	CTT	4	71341	71352	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34224028
82	NC_015893	TGA	6	71597	71614	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	34224028
83	NC_015893	GAG	4	74226	74237	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	34224028
84	NC_015893	TTA	4	75842	75853	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224028
85	NC_015893	TAA	4	76618	76629	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
86	NC_015893	TAA	4	77971	77981	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34224028
87	NC_015893	TCT	4	78277	78287	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34224028
88	NC_015893	TAA	4	81192	81203	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
89	NC_015893	TAT	5	82402	82416	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	34224028
90	NC_015893	TAA	4	83496	83507	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
91	NC_015893	TAT	7	83502	83524	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224028
92	NC_015893	AGA	4	90055	90066	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34224028
93	NC_015893	TTA	4	91388	91399	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224028
94	NC_015893	TTA	4	92217	92227	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224028
95	NC_015893	GCT	4	93260	93271	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34224028
96	NC_015893	CTA	4	95232	95243	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34224028
97	NC_015893	ATT	4	95836	95848	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34224028
98	NC_015893	TAT	4	97732	97743	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	34224028
99	NC_015893	ATA	4	98297	98307	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34224028
100	NC_015893	ATT	5	100477	100491	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34224028
101	NC_015893	TAA	4	100516	100527	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
102	NC_015893	ATT	5	102360	102374	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34224028
103	NC_015893	AGG	7	103704	103724	21	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_015893	ATA	7	103819	103839	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_015893	ATA	4	103846	103860	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_015893	TAT	4	104574	104585	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_015893	GAA	6	105658	105675	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34224028
108	NC_015893	TAA	4	106644	106654	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34224028
109	NC_015893	GCA	4	108058	108068	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
110	NC_015893	TGA	8	108094	108117	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_015893	ACT	4	108196	108207	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_015893	TAC	4	108261	108272	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_015893	GTA	14	108377	108419	43	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_015893	AAT	4	108936	108947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34224028
115	NC_015893	TTA	4	109063	109073	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34224028
116	NC_015893	AGC	4	109333	109345	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	34224028
117	NC_015893	TAT	4	109859	109871	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34224028
118	NC_015893	ATT	4	109947	109958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34224028
119	NC_015893	TAG	4	111691	111702	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_015893	TAT	8	111923	111946	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_015893	CAT	4	112353	112364	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_015893	TAC	4	112618	112629	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_015893	TAG	19	112621	112675	55	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_015893	GCT	32	115470	115565	96	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	3 %	Non-Coding
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129	NC_015893	GGT	4	126928	126939	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 mitochondrion