ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015893	TAATGC	3	632	649	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015893	TGG	4	1338	1349	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015893	TA	17	1566	1599	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015893	AGCT	3	3487	3498	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015893	TA	8	3534	3549	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015893	TA	13	3584	3609	26	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015893	TTA	4	4467	4478	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34224027
8	NC_015893	TAC	4	5708	5719	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015893	AT	10	5841	5860	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015893	GTACT	3	5874	5888	15	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015893	G	12	6004	6015	12	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015893	ACGT	8	6114	6145	32	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015893	TATTG	3	6155	6169	15	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015893	ATTTA	3	9645	9659	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015893	TTA	4	10664	10675	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015893	ATTGT	5	10937	10961	25	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015893	GATAC	3	10965	10979	15	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015893	AAT	5	11117	11131	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	34224027
19	NC_015893	CTTTT	3	13952	13966	15	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015893	CAG	13	14651	14689	39	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015893	ATGT	3	15032	15043	12	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015893	ACGT	3	15313	15324	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015893	GCA	4	15453	15464	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015893	AT	6	15623	15634	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015893	GTA	4	15655	15666	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015893	AT	8	15998	16013	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015893	TG	7	17495	17508	14	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015893	TA	10	17542	17561	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015893	GTAC	3	18397	18408	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015893	CGTA	3	24772	24783	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015893	TAT	12	24847	24882	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015893	TG	15	25029	25058	30	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015893	TACG	3	25358	25369	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015893	C	12	26257	26268	12	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_015893	AT	8	26864	26879	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015893	TA	12	26887	26910	24	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015893	T	15	28380	28394	15	0 %	100 %	0 %	0 %	34224027
38	NC_015893	TGT	4	30885	30896	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	34224027
39	NC_015893	TA	6	33009	33020	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34224027
40	NC_015893	TAT	5	33332	33346	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34224027
41	NC_015893	TAA	4	35433	35444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	34224027
42	NC_015893	GTTTA	4	35533	35552	20	20 %	60 %	20 %	0 %	34224027
43	NC_015893	GTA	8	35602	35625	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224027
44	NC_015893	TAG	21	38255	38317	63	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015893	TACG	3	42250	42261	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015893	TA	10	42481	42500	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015893	TATTTA	3	42517	42534	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015893	AAT	7	42716	42736	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015893	AT	7	43288	43301	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015893	TAG	10	45640	45669	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224028
51	NC_015893	TAG	12	46943	46978	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224028
52	NC_015893	GGCT	3	47081	47092	12	0 %	25 %	50 %	25 %	34224028
53	NC_015893	AAT	6	48397	48414	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	34224028
54	NC_015893	AGT	5	49612	49626	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224028
55	NC_015893	ATA	4	51080	51091	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	34224028
56	NC_015893	TA	8	51252	51267	16	50 %	50 %	0 %	0 %	34224028
57	NC_015893	TAG	16	52519	52566	48	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224028
58	NC_015893	TATT	3	53380	53391	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34224028
59	NC_015893	CAG	6	53650	53667	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34224028
60	NC_015893	ATACA	3	54451	54465	15	60 %	20 %	0 %	20 %	34224028
61	NC_015893	TTACA	3	54466	54480	15	40 %	40 %	0 %	20 %	34224028
62	NC_015893	TGTAT	3	54505	54519	15	20 %	60 %	20 %	0 %	34224028
63	NC_015893	TATTG	3	54522	54536	15	20 %	60 %	20 %	0 %	34224028
64	NC_015893	ACAAAC	6	55217	55252	36	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	34224028
65	NC_015893	AT	10	56911	56930	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015893	TAAA	3	57157	57168	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015893	ACGT	4	57289	57304	16	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015893	TTAT	3	58253	58264	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34224028
69	NC_015893	A	12	58301	58312	12	100 %	0 %	0 %	0 %	34224028
70	NC_015893	AT	10	60704	60723	20	50 %	50 %	0 %	0 %	34224028
71	NC_015893	TAG	6	63438	63455	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224028
72	NC_015893	TA	10	63843	63862	20	50 %	50 %	0 %	0 %	34224028
73	NC_015893	G	13	65619	65631	13	0 %	0 %	100 %	0 %	34224028
74	NC_015893	ATTA	3	67612	67623	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015893	AT	12	67678	67701	24	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015893	AT	6	68546	68557	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015893	AT	7	68729	68742	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015893	TGA	5	71597	71611	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34224028
79	NC_015893	GTTTA	4	78231	78250	20	20 %	60 %	20 %	0 %	34224028
80	NC_015893	CATTT	3	78945	78959	15	20 %	60 %	0 %	20 %	34224028
81	NC_015893	TAT	5	82402	82416	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34224028
82	NC_015893	TAT	4	83513	83524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34224028
83	NC_015893	AT	7	86081	86094	14	50 %	50 %	0 %	0 %	34224028
84	NC_015893	A	12	91813	91824	12	100 %	0 %	0 %	0 %	34224028
85	NC_015893	ATTTA	3	97323	97337	15	40 %	60 %	0 %	0 %	34224028
86	NC_015893	TAT	4	97732	97743	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34224028
87	NC_015893	ATT	4	100477	100488	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34224028
88	NC_015893	TACG	6	101386	101409	24	25 %	25 %	25 %	25 %	34224028
89	NC_015893	CTGG	9	101554	101589	36	0 %	25 %	50 %	25 %	34224028
90	NC_015893	AGG	5	103710	103724	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015893	ATA	5	103822	103836	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015893	ATA	4	103846	103857	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015893	CATTG	3	103992	104006	15	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015893	ACGT	13	104091	104142	52	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015893	TGCA	4	104208	104223	16	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015893	TATTC	3	104308	104322	15	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015893	AT	11	104438	104459	22	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015893	TATT	3	105273	105284	12	25 %	75 %	0 %	0 %	34224028
99	NC_015893	GAA	5	105658	105672	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34224028
100	NC_015893	TGA	6	108094	108111	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015893	GTAC	5	108140	108159	20	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015893	GTA	11	108377	108409	33	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015893	TAATG	3	109742	109756	15	40 %	40 %	20 %	0 %	34224028
104	NC_015893	TAT	6	111926	111943	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015893	GTAC	4	112332	112347	16	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015893	CGTA	5	112501	112520	20	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015893	TACG	3	112595	112606	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015893	TAG	13	112627	112665	39	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015893	GTATT	4	112675	112694	20	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015893	CAAA	3	114511	114522	12	75 %	0 %	0 %	25 %	34224028
111	NC_015893	A	12	115344	115355	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015893	GCT	29	115479	115565	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015893	GTA	6	115675	115692	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015893	TAGTG	4	115905	115924	20	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015893	ATTT	3	116114	116125	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015893	TA	7	120331	120344	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015893	TTC	4	122488	122499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34224028
118	NC_015893	TACT	6	126700	126723	24	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015893	AGG	4	126740	126751	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015893	ATAA	3	126999	127010	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015893	ATATAA	4	127011	127034	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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