ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015893	TA	24	1560	1605	46	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015893	TA	13	3528	3552	25	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015893	TA	15	3581	3609	29	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_015893	TA	6	4672	4682	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224027
5	NC_015893	AT	12	5840	5861	22	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_015893	TA	6	6236	6247	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015893	TA	9	6411	6427	17	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_015893	AT	6	6864	6875	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015893	AT	6	6968	6978	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015893	TG	6	6995	7006	12	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015893	AT	6	7066	7076	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015893	AT	7	7095	7107	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_015893	TA	13	15608	15633	26	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_015893	TG	8	17495	17510	16	0 %	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
15	NC_015893	TA	13	17541	17565	25	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_015893	TA	7	21731	21743	13	50 %	50 %	0 %	7 %	34224027
17	NC_015893	TA	6	24651	24661	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015893	TG	15	25029	25058	30	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015893	TA	6	25585	25595	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015893	GT	6	25642	25652	11	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015893	TA	6	26825	26836	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015893	AT	30	26855	26912	58	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015893	TA	6	29166	29176	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224027
24	NC_015893	TA	8	33009	33023	15	50 %	50 %	0 %	6 %	34224027
25	NC_015893	AT	6	33137	33147	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224027
26	NC_015893	TA	19	42475	42512	38	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_015893	AT	8	43288	43304	17	50 %	50 %	0 %	5 %	34224028
28	NC_015893	TA	6	43470	43482	13	50 %	50 %	0 %	7 %	34224028
29	NC_015893	AT	6	50074	50085	12	50 %	50 %	0 %	8 %	34224028
30	NC_015893	TA	6	50438	50449	12	50 %	50 %	0 %	8 %	34224028
31	NC_015893	TA	17	51247	51280	34	50 %	50 %	0 %	8 %	34224028
32	NC_015893	TA	6	53273	53283	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
33	NC_015893	TA	6	55844	55854	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
34	NC_015893	AT	12	56910	56931	22	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015893	AT	12	60703	60724	22	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
36	NC_015893	AG	6	61332	61343	12	50 %	0 %	50 %	8 %	34224028
37	NC_015893	TA	12	63842	63864	23	50 %	50 %	0 %	8 %	34224028
38	NC_015893	AT	13	67677	67702	26	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_015893	AT	6	68546	68559	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_015893	AT	11	68727	68747	21	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015893	TA	7	85906	85918	13	50 %	50 %	0 %	7 %	34224028
42	NC_015893	AT	9	86081	86097	17	50 %	50 %	0 %	5 %	34224028
43	NC_015893	TA	6	89660	89671	12	50 %	50 %	0 %	8 %	34224028
44	NC_015893	AT	6	91796	91806	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
45	NC_015893	TA	6	94324	94334	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
46	NC_015893	AT	13	104434	104459	26	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_015893	AT	6	104947	104957	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
48	NC_015893	AG	6	108702	108713	12	50 %	0 %	50 %	8 %	34224028
49	NC_015893	AT	6	108811	108821	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
50	NC_015893	AT	6	108884	108894	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224028
51	NC_015893	TA	6	117224	117235	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_015893	AT	8	117401	117416	16	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_015893	AT	6	120215	120225	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_015893	TA	9	120331	120348	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 mitochondrion