ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia kwangsiensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015892	CAG	4	1088	1099	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34231618
2	NC_015892	AGA	4	2190	2201	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34231618
3	NC_015892	CAT	4	6603	6614	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015892	TAT	5	14185	14198	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015892	ATT	5	14789	14804	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_015892	TGT	4	17855	17865	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34231619
7	NC_015892	GTT	4	24759	24770	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34231619
8	NC_015892	CAG	4	29323	29334	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015892	TTA	4	31861	31871	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015892	GTA	4	34911	34921	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015892	TTG	4	37210	37220	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34231620
12	NC_015892	ATG	4	41209	41219	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34231620
13	NC_015892	GCA	4	43107	43118	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34231620
14	NC_015892	TAA	4	44712	44724	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_015892	AGT	4	48111	48122	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34231620
16	NC_015892	ATT	4	49040	49050	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_015892	ATA	5	57785	57798	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34231621
18	NC_015892	TTA	4	63116	63126	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015892	CTT	4	67478	67490	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_015892	AGT	4	69074	69086	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015892	TTA	4	69516	69527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015892	TCT	4	71445	71456	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015892	AGA	4	72263	72273	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015892	CTG	4	73869	73880	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34231622
25	NC_015892	AGA	4	74130	74141	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34231622
26	NC_015892	TAT	5	74606	74621	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34231622
27	NC_015892	TCT	4	74648	74659	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34231622
28	NC_015892	GGA	4	83826	83838	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	34231622
29	NC_015892	CTT	4	88114	88125	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34231622
30	NC_015892	GAT	4	89945	89955	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34231622
31	NC_015892	GAT	4	92973	92984	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34231622
32	NC_015892	TGA	4	94706	94717	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34231622
33	NC_015892	CTT	4	107270	107281	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34231626
34	NC_015892	TAT	4	115304	115316	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	34231626
35	NC_015892	TTA	4	116820	116831	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34231626
36	NC_015892	ATT	4	117442	117452	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34231626
37	NC_015892	TTC	4	117646	117658	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34231626
38	NC_015892	TGT	4	118223	118234	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34231626
39	NC_015892	ACA	4	118239	118250	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	34231626
40	NC_015892	TAT	4	119233	119243	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34231626
41	NC_015892	CTT	4	120030	120040	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34231626
42	NC_015892	ATA	4	123261	123272	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	34231626
43	NC_015892	AAT	4	128624	128635	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	34231626
44	NC_015892	TTA	4	144832	144843	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34231626
45	NC_015892	ATC	4	154714	154725	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34231626
46	NC_015892	ATC	4	157743	157753	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia kwangsiensis chloroplast