ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Magnolia kwangsiensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015892	AAAG	3	4	15	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015892	GAAAA	3	237	250	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_015892	GAAA	3	350	361	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015892	CAG	4	1088	1099	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34231618
5	NC_015892	AAGT	3	1194	1204	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34231618
6	NC_015892	AGA	4	2190	2201	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34231618
7	NC_015892	A	12	3958	3969	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015892	A	14	4412	4425	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_015892	ATAG	3	4679	4690	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015892	A	12	4758	4769	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015892	GAAA	3	4771	4782	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015892	TCTCT	3	5183	5196	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	34231618
13	NC_015892	A	16	5409	5424	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	34231618
14	NC_015892	ATAA	3	6565	6575	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015892	CAT	4	6603	6614	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_015892	AAATC	3	6662	6675	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_015892	T	12	7732	7743	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015892	GATAA	3	8652	8666	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_015892	GA	6	9235	9246	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015892	TCTTT	3	9384	9397	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015892	TA	6	9400	9411	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015892	ATCT	3	10683	10694	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015892	GTTT	3	11276	11287	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	34231619
24	NC_015892	A	18	12720	12737	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_015892	TAT	5	14185	14198	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_015892	AAAT	3	14752	14763	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015892	ATT	5	14789	14804	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_015892	TGAAA	3	15433	15447	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_015892	T	15	15775	15789	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015892	T	13	17508	17520	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015892	TGT	4	17855	17865	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34231619
32	NC_015892	TCAA	3	17948	17959	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	34231619
33	NC_015892	T	14	19711	19724	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34231619
34	NC_015892	TTCA	3	23803	23814	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34231619
35	NC_015892	GAAT	3	23902	23912	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34231619
36	NC_015892	GTT	4	24759	24770	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34231619
37	NC_015892	GAAA	3	27405	27417	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	34231619
38	NC_015892	TCAT	3	28065	28075	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_015892	AGCT	3	28555	28566	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015892	GT	6	28993	29003	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015892	CAG	4	29323	29334	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_015892	TTA	4	31861	31871	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_015892	AT	6	33242	33254	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015892	TGTA	3	33745	33756	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_015892	TA	6	34532	34543	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_015892	TTCGA	3	34811	34824	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
47	NC_015892	TA	6	34892	34905	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_015892	GTA	4	34911	34921	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_015892	GAAA	3	36805	36816	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34231620
50	NC_015892	TTG	4	37210	37220	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34231620
51	NC_015892	AG	6	38010	38020	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_015892	TC	6	38614	38624	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34231620
53	NC_015892	GAAT	3	40854	40864	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34231620
54	NC_015892	ATG	4	41209	41219	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34231620
55	NC_015892	AATG	3	42702	42713	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34231620
56	NC_015892	GCA	4	43107	43118	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34231620
57	NC_015892	TG	6	43144	43154	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	34231620
58	NC_015892	TTCCT	3	44416	44429	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
59	NC_015892	TTTA	3	44451	44462	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015892	TAA	4	44712	44724	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_015892	ATATCT	3	44736	44753	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
62	NC_015892	TTAA	3	44973	44984	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_015892	T	13	45294	45306	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34231620
64	NC_015892	ATCA	3	45356	45366	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	34231620
65	NC_015892	TCTT	4	45845	45860	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	34231620
66	NC_015892	TCTT	3	46762	46772	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34231620
67	NC_015892	TAAA	4	46815	46830	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	34231620
68	NC_015892	AGT	4	48111	48122	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34231620
69	NC_015892	TTTTA	3	48389	48402	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_015892	ATT	4	49040	49050	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_015892	TTGA	3	49599	49611	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_015892	TTAT	3	49889	49900	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_015892	GGAA	3	50894	50906	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_015892	GTTT	3	53081	53093	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_015892	GAAT	3	53238	53249	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015892	AGTC	3	53435	53445	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_015892	AATT	3	53742	53753	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_015892	ATAAAA	3	54025	54042	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_015892	T	12	55728	55739	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_015892	TTTGT	3	55781	55795	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_015892	ATA	5	57785	57798	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34231621
82	NC_015892	TA	6	60112	60123	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_015892	GTTA	3	60508	60518	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_015892	TATTTT	3	62202	62219	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_015892	TTA	4	63116	63126	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_015892	TGAA	3	63844	63854	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_015892	T	12	64265	64276	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_015892	A	14	64653	64666	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_015892	AATG	3	65466	65477	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	34231621
90	NC_015892	A	15	67256	67270	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_015892	CTT	4	67478	67490	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_015892	AGT	4	69074	69086	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_015892	TTA	4	69516	69527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_015892	TTGCA	3	70421	70434	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
95	NC_015892	GAAT	3	71090	71101	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_015892	GAAT	3	71322	71332	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_015892	TCT	4	71445	71456	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_015892	TA	7	71749	71762	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_015892	AGA	4	72263	72273	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_015892	ATTT	3	72915	72925	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_015892	ATAA	4	73018	73033	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_015892	CTG	4	73869	73880	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34231622
103	NC_015892	AGA	4	74130	74141	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34231622
104	NC_015892	TTTA	3	74322	74333	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34231622
105	NC_015892	TAT	5	74606	74621	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	34231622
106	NC_015892	TCT	4	74648	74659	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34231622
107	NC_015892	T	14	75383	75396	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	34231622
108	NC_015892	TGAA	3	75997	76007	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34231622
109	NC_015892	CATTC	3	78997	79010	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	34231622
110	NC_015892	TTCTA	3	80577	80590	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	34231622
111	NC_015892	TACG	3	82847	82859	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	34231622
112	NC_015892	GGA	4	83826	83838	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	34231622
113	NC_015892	T	12	84364	84375	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	34231622
114	NC_015892	GAAA	4	84901	84915	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	34231622
115	NC_015892	AGAA	3	84928	84939	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34231622
116	NC_015892	GTTA	3	86290	86300	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	34231622
117	NC_015892	TC	6	87167	87177	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34231622
118	NC_015892	TC	11	87189	87210	22	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34231622
119	NC_015892	ACAT	3	87582	87593	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	34231622
120	NC_015892	CTT	4	88114	88125	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34231622
121	NC_015892	TTCT	3	89571	89582	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34231622
122	NC_015892	GAT	4	89945	89955	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34231622
123	NC_015892	TTCT	3	91640	91650	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34231622
124	NC_015892	CTTT	3	92818	92828	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34231622
125	NC_015892	GAT	4	92973	92984	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34231622
126	NC_015892	TGAT	3	94655	94667	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	34231622
127	NC_015892	TGA	4	94706	94717	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	34231622
128	NC_015892	AATA	3	95544	95556	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	34231622
129	NC_015892	TTTC	3	95606	95617	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34231622
130	NC_015892	ATTAGA	3	96143	96160	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	34231622
131	NC_015892	GAAGGA	3	96336	96353	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	34231622
132	NC_015892	TCTA	3	97641	97651	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	34231622
133	NC_015892	TCCGG	3	98534	98548	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	34231622
134	NC_015892	TTTCG	3	101141	101154	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	34231622
135	NC_015892	TTTGTT	3	101559	101577	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	34231622
136	NC_015892	TATTAG	3	103498	103520	23	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	4 %	34231626
137	NC_015892	ATCC	3	106790	106801	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	34231626
138	NC_015892	TCTA	3	107179	107190	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	34231626
139	NC_015892	CTT	4	107270	107281	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34231626
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169	NC_015892	TAAT	3	130567	130578	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34231626
170	NC_015892	CATT	3	130732	130743	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	34231626
171	NC_015892	TTTTTC	3	132192	132209	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	34231626
172	NC_015892	TTCC	3	134294	134304	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34231626
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177	NC_015892	CTTA	3	136351	136361	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	34231626
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182	NC_015892	ACCGG	3	149149	149163	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
183	NC_015892	CATAC	3	150473	150486	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
184	NC_015892	CTCCTT	3	151344	151361	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	34231626
185	NC_015892	CTTCTA	3	151536	151553	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	34231626
186	NC_015892	TGAA	3	152080	152091	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	34231626
187	NC_015892	ATCA	3	153031	153043	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	34231626
188	NC_015892	TGAT	3	153126	153138	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	34231626
189	NC_015892	ATC	4	154714	154725	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34231626
190	NC_015892	AAAG	3	154870	154880	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34231626
191	NC_015892	ATTT	3	155921	155932	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	34231626
192	NC_015892	ATC	4	157743	157753	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
193	NC_015892	AGAA	3	158116	158127	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34231626

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Magnolia kwangsiensis chloroplast