ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Oroperipatus sp. DVL-2011 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015890	TAT	5	572	586	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	34224026
2	NC_015890	TTTA	4	1021	1036	16	25 %	75 %	0 %	6 %	34224026
3	NC_015890	TA	6	1328	1338	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224026
4	NC_015890	ATA	4	2779	2790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34224026
5	NC_015890	ATT	4	3212	3223	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34224026
6	NC_015890	TTA	5	3232	3246	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	34224026
7	NC_015890	TTTTA	3	3361	3375	15	20 %	80 %	0 %	6 %	34224026
8	NC_015890	TAA	4	3879	3890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34224026
9	NC_015890	AAAG	3	3957	3968	12	75 %	0 %	25 %	8 %	34224026
10	NC_015890	TAA	5	4449	4462	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	34224026
11	NC_015890	ATA	4	4748	4758	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34224026
12	NC_015890	TAA	4	4883	4893	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34224026
13	NC_015890	A	13	5178	5190	13	100 %	0 %	0 %	7 %	34224026
14	NC_015890	TTAA	3	5609	5619	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224026
15	NC_015890	ATT	4	5666	5677	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34224026
16	NC_015890	AAAT	3	5844	5855	12	75 %	25 %	0 %	8 %	34224026
17	NC_015890	AATT	3	5860	5870	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224026
18	NC_015890	ATT	4	6140	6151	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34224026
19	NC_015890	ATA	4	6350	6360	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34224026
20	NC_015890	ATA	4	6372	6382	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34224026
21	NC_015890	ATT	4	7064	7075	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34224026
22	NC_015890	ATT	4	7270	7281	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34224026
23	NC_015890	TAA	4	7377	7388	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	34224026
24	NC_015890	TTTA	3	7453	7463	11	25 %	75 %	0 %	9 %	34224026
25	NC_015890	ATTT	3	7961	7971	11	25 %	75 %	0 %	9 %	34224026
26	NC_015890	TTAGTA	3	8202	8218	17	33.33 %	50 %	16.67 %	5 %	34224026
27	NC_015890	TA	6	8621	8633	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015890	TAAA	3	9009	9019	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015890	TA	11	9102	9122	21	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015890	TA	7	9235	9247	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_015890	TA	10	9251	9271	21	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_015890	TTATA	4	9346	9364	19	40 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
33	NC_015890	TATATT	3	9406	9422	17	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_015890	GAT	4	9761	9771	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	34224026
35	NC_015890	ATT	4	9888	9899	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34224026
36	NC_015890	TTGA	3	9995	10006	12	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_015890	ATT	4	10396	10407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015890	TAA	4	10551	10561	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_015890	TTAA	3	10682	10693	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015890	ATTA	4	11368	11382	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_015890	TTA	4	11895	11906	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34224027
42	NC_015890	ATT	4	13031	13042	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	34224027
43	NC_015890	AATT	3	13084	13094	11	50 %	50 %	0 %	9 %	34224027
44	NC_015890	AT	6	13166	13177	12	50 %	50 %	0 %	8 %	34224027
45	NC_015890	TAT	5	13739	13753	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	34224027
46	NC_015890	AAT	5	13780	13794	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34224027
47	NC_015890	TTTA	3	13888	13898	11	25 %	75 %	0 %	9 %	34224027
48	NC_015890	TATT	4	14160	14176	17	25 %	75 %	0 %	5 %	34224027
49	NC_015890	TAT	4	14334	14344	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	34224027

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Oroperipatus sp. DVL-2011 mitochondrion