ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sesamia inferens mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015835	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_015835	ATATA	3	195	209	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015835	TAT	8	711	733	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990683
4	NC_015835	AATT	3	804	814	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990683
5	NC_015835	ATT	4	1045	1057	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990683
6	NC_015835	TTAA	3	1213	1223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990683
7	NC_015835	T	13	1266	1278	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33990683
8	NC_015835	TTAA	4	1277	1292	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33990683
9	NC_015835	ATT	4	2066	2077	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990683
10	NC_015835	GAAA	3	2278	2289	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	33990683
11	NC_015835	AATT	4	3937	3952	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33990683
12	NC_015835	T	17	3955	3971	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	33990683
13	NC_015835	TTAA	3	4026	4037	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33990683
14	NC_015835	ATT	4	4204	4215	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990683
15	NC_015835	CTTTAT	3	4289	4306	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	33990683
16	NC_015835	ATTTT	3	4307	4321	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	33990683
17	NC_015835	AATT	3	4433	4443	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990683
18	NC_015835	ATATT	3	4631	4645	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	33990683
19	NC_015835	T	15	5028	5042	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33990683
20	NC_015835	CTTT	3	5391	5402	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	33990683
21	NC_015835	TAT	4	5675	5685	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990683
22	NC_015835	TAATT	3	5957	5971	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	33990683
23	NC_015835	TAA	4	6023	6034	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015835	ATTT	3	6326	6337	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015835	ATT	4	6427	6438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990683
26	NC_015835	TAAA	3	6452	6463	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	33990683
27	NC_015835	AATT	3	6470	6480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990683
28	NC_015835	AATTAT	3	6914	6932	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	33990683
29	NC_015835	TTA	4	7277	7288	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990683
30	NC_015835	TAA	5	7383	7397	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33990683
31	NC_015835	TAA	4	7416	7427	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990683
32	NC_015835	ATT	4	7585	7596	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990683
33	NC_015835	AAAT	3	7621	7631	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33990683
34	NC_015835	TAA	4	7820	7832	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33990683
35	NC_015835	TAA	4	8028	8038	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33990683
36	NC_015835	TAT	5	8135	8149	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33990683
37	NC_015835	TAATAT	3	8397	8414	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33990684
38	NC_015835	TAAA	3	9036	9046	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33990684
39	NC_015835	TAAA	3	9068	9079	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	33990684
40	NC_015835	AAAT	3	9120	9130	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33990684
41	NC_015835	AAAAT	3	9209	9222	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33990684
42	NC_015835	TATAAA	4	9447	9470	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990684
43	NC_015835	ATT	4	9529	9540	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33990684
44	NC_015835	A	16	9750	9765	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33990684
45	NC_015835	ATT	4	9885	9896	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990684
46	NC_015835	T	13	10304	10316	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33990684
47	NC_015835	ATA	4	10480	10491	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990684
48	NC_015835	ATTT	4	10495	10510	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33990684
49	NC_015835	ATTA	8	10571	10602	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990684
50	NC_015835	AAT	4	10611	10621	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33990684
51	NC_015835	TA	6	10787	10797	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990684
52	NC_015835	AATTTT	3	11522	11539	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	33990684
53	NC_015835	ATTA	3	11764	11774	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990684
54	NC_015835	ATA	4	11857	11867	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33990684
55	NC_015835	TA	6	12044	12054	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990684
56	NC_015835	AAT	4	12252	12263	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990684
57	NC_015835	TAAAA	3	12455	12468	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33990684
58	NC_015835	TAA	4	12493	12503	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33990684
59	NC_015835	TAT	5	12769	12783	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33990684
60	NC_015835	TA	7	12801	12813	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_015835	TA	11	12873	12896	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_015835	AAATAT	3	13692	13708	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_015835	ATTA	4	13867	13882	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_015835	TTAA	3	13998	14009	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015835	TTTCA	3	14113	14126	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
66	NC_015835	AATT	3	14256	14267	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015835	AAATT	3	14431	14445	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_015835	ATTTTA	4	14548	14571	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_015835	AAAT	3	15000	15012	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_015835	TA	8	15098	15112	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_015835	T	23	15129	15151	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_015835	T	16	15193	15208	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_015835	TA	8	15312	15328	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_015835	AT	7	15400	15412	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sesamia inferens mitochondrion