ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ferrocalamus rimosivaginus plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015831	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34003451
2	NC_015831	CTT	4	4530	4541	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003451
3	NC_015831	TAA	4	6394	6404	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_015831	CTT	4	6797	6807	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015831	AGT	4	6911	6922	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015831	GAA	4	9008	9019	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015831	TTG	4	11320	11330	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34003452
8	NC_015831	TAT	4	16073	16083	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_015831	TAA	4	18150	18160	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015831	TAT	4	18850	18860	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015831	ATA	4	20913	20923	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015831	CTA	4	21266	21277	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015831	ATT	4	21374	21384	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015831	AGA	4	22357	22368	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003452
15	NC_015831	AAC	4	25003	25014	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	34003452
16	NC_015831	AAT	5	26691	26705	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34003452
17	NC_015831	GAA	4	29845	29856	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003452
18	NC_015831	ATT	4	31639	31651	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_015831	AGA	4	32128	32138	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34003453
20	NC_015831	GTT	5	33321	33335	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34003453
21	NC_015831	TGC	4	34313	34324	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34003453
22	NC_015831	AAG	4	44459	44470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003453
23	NC_015831	AGT	4	44861	44871	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34003453
24	NC_015831	TAT	4	46492	46502	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_015831	CTT	4	50098	50109	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015831	ATT	5	53021	53035	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_015831	TTC	4	62641	62652	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003454
28	NC_015831	TCT	4	63088	63098	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015831	ATA	4	65031	65041	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015831	TTA	4	65511	65522	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015831	TTC	4	67426	67437	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015831	ATA	4	67873	67883	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015831	AAT	4	70822	70834	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	34003451
34	NC_015831	AGA	4	76687	76698	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003451
35	NC_015831	TAT	4	77745	77755	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34003451
36	NC_015831	TTC	4	81324	81336	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34003451
37	NC_015831	TCT	4	83017	83030	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34003451
38	NC_015831	TTC	4	84117	84127	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34003451
39	NC_015831	ATA	4	90801	90811	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34003451
40	NC_015831	TAC	4	92617	92628	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34003451
41	NC_015831	AAG	4	106404	106415	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003458
42	NC_015831	CAA	4	111702	111712	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	34003458
43	NC_015831	TAT	5	112545	112558	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015831	ATT	4	113360	113371	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	34003458
45	NC_015831	TAA	4	117930	117940	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_015831	TTA	4	129537	129548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_015831	GTA	4	129931	129942	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ferrocalamus rimosivaginus plastid