ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bambusa emeiensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015830	CAG	5	684	698	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	34003443
2	NC_015830	TTC	4	1797	1808	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003443
3	NC_015830	CTT	4	4517	4528	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003443
4	NC_015830	TAA	4	6389	6399	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015830	TTG	4	10870	10880	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34003443
6	NC_015830	TAC	4	15569	15579	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_015830	TAT	4	15615	15625	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_015830	TAA	4	17683	17693	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_015830	TAT	4	18442	18452	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015830	ATA	4	20473	20483	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015830	CTA	4	20814	20825	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015830	ATT	4	20916	20926	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015830	AGA	4	21889	21900	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003444
14	NC_015830	AAC	4	24542	24553	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	34003444
15	NC_015830	AAT	5	26230	26244	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34003444
16	NC_015830	GAA	4	29768	29779	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003444
17	NC_015830	ATT	4	31554	31566	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_015830	AGA	4	32038	32048	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34003444
19	NC_015830	GTT	5	33231	33245	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34003444
20	NC_015830	TGC	4	34206	34217	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34003444
21	NC_015830	TAG	5	37934	37948	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_015830	AAG	4	44359	44370	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003445
23	NC_015830	AGT	4	44761	44771	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34003445
24	NC_015830	CTT	4	49967	49978	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015830	TTC	4	62679	62690	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003446
26	NC_015830	TCT	4	63111	63121	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015830	TTA	4	65517	65528	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015830	TTC	5	67418	67432	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
29	NC_015830	CAT	4	74218	74229	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34003451
30	NC_015830	TAT	4	77725	77735	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34003451
31	NC_015830	ATT	4	78304	78314	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34003451
32	NC_015830	TCT	4	81651	81662	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003451
33	NC_015830	TTC	4	82912	82926	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	34003451
34	NC_015830	TTC	4	84021	84031	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34003451
35	NC_015830	ATA	4	90672	90682	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34003451
36	NC_015830	TAC	4	92488	92499	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34003451
37	NC_015830	AAG	4	106270	106281	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003449
38	NC_015830	CAA	4	111762	111772	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	34003450
39	NC_015830	TAA	4	117993	118003	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_015830	GTA	4	129983	129994	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bambusa emeiensis chloroplast