ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phyllostachys nigra var. henonis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015826CAG46806911233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %34003434
2NC_015826CTT445334544120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34003434
3NC_015826TAA4638963991166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_015826CTT467926802110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
5NC_015826AGT4690669171233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
6NC_015826GAA4900290131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
7NC_015826TTG41131711327110 %66.67 %33.33 %0 %9 %34003435
8NC_015826TAA415996160071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_015826TAT416037160471133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_015826TAA418113181231166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_015826TAT418807188171133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_015826ATA420858208681166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_015826CTA421199212101233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
14NC_015826ATT421307213171133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_015826AGA422290223011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34003435
16NC_015826AAC424936249471266.67 %0 %0 %33.33 %8 %34003435
17NC_015826AAT526624266381566.67 %33.33 %0 %0 %6 %34003435
18NC_015826GAA430118301291266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34003435
19NC_015826ATT431892319041333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_015826AGA432382323921166.67 %0 %33.33 %0 %9 %34003435
21NC_015826GTT53357533589150 %66.67 %33.33 %0 %6 %34003436
22NC_015826TGC43454834559120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34003436
23NC_015826AAG444688446991266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34003436
24NC_015826AGT445097451071133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34003436
25NC_015826TAG445999460091133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34003436
26NC_015826TAT446739467491133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
27NC_015826CTT45033650347120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
28NC_015826TTC46292262933120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34003437
29NC_015826TCT46334963359110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_015826ATA465285652951166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_015826TTA465764657751233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_015826TTC46767367684120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
33NC_015826ATA468101681111166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
34NC_015826AGA476906769171266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34003442
35NC_015826TAT477964779741133.33 %66.67 %0 %0 %9 %34003442
36NC_015826TTC48149781509130 %66.67 %0 %33.33 %7 %34003442
37NC_015826TCT48314883161140 %66.67 %0 %33.33 %7 %34003442
38NC_015826TTC48426284272110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34003442
39NC_015826ATA490919909291166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34003442
40NC_015826TAC492735927461233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34003442
41NC_015826AAG41065951066061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34003441
42NC_015826ATA41087611087711166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_015826CAA41120271120371166.67 %0 %0 %33.33 %9 %34003441
44NC_015826TAT51128951129081433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
45NC_015826GTT4116313116323110 %66.67 %33.33 %0 %9 %34003441
46NC_015826TAA41182681182781166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_015826GTA41303281303391233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding