ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pelochelys cantorii isolate Xiamen mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015825	TACT	3	96	106	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015825	AAAC	3	1140	1150	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015825	ACCA	3	2377	2388	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015825	GTTC	3	2499	2510	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015825	CTC	4	2767	2777	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
6	NC_015825	ACA	5	4334	4348	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	33990674
7	NC_015825	AAT	4	4534	4545	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990674
8	NC_015825	ATA	4	4694	4705	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990674
9	NC_015825	ATA	4	6793	6804	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990675
10	NC_015825	ACT	4	7134	7144	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33990675
11	NC_015825	CTA	4	8585	8596	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33990675
12	NC_015825	GCA	4	8740	8751	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33990675
13	NC_015825	CAAT	3	9496	9507	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015825	CTA	4	9819	9830	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33990675
15	NC_015825	CATT	3	10527	10537	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	33990675
16	NC_015825	CAA	4	10797	10808	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33990675
17	NC_015825	ATC	4	11423	11433	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33990675
18	NC_015825	AC	6	11563	11573	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	33990675
19	NC_015825	ATA	4	12188	12199	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990675
20	NC_015825	TAA	4	12741	12752	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990675
21	NC_015825	ACA	4	13523	13534	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33990675
22	NC_015825	AACA	3	13648	13660	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	33990675
23	NC_015825	CCAA	4	13677	13691	15	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	33990675
24	NC_015825	CAAA	3	14083	14093	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	33990675
25	NC_015825	TAC	5	14553	14567	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	33990676
26	NC_015825	CCAT	3	14855	14867	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	33990676
27	NC_015825	CTA	4	15080	15092	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	33990676
28	NC_015825	AT	6	16006	16017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_015825	AT	8	17044	17060	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_015825	AT	8	17062	17078	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_015825	AT	8	17080	17096	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_015825	AT	8	17098	17114	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_015825	AT	8	17116	17132	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_015825	AT	8	17134	17150	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_015825	AT	8	17152	17168	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_015825	AT	8	17170	17186	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_015825	AT	8	17188	17204	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_015825	AT	10	17206	17226	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_015825	AT	42	17206	17288	83	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_015825	AT	107	17259	17465	207	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015825	AT	18	17281	17317	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pelochelys cantorii isolate Xiamen mitochondrion